Gene detail

Detailed information of PE_Scaf7376_3.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf7376_3.6	ALANYL-TRNA EDITING PROTEIN	Superscaffold3	65480298	65494968	+

Gene Structure

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CDS

Transcript

PE_Scaf7376_3.6

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07973	tRNA_SAD	Threonyl and Alanyl tRNA synthetase second additional domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR009000	Homologous_superfamily	Translation protein, beta-barrel domain superfamily	Interproscan
IPR012947	Domain	Threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD	Interproscan
IPR018163	Homologous_superfamily	Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily	Interproscan
IPR018165	Domain	Alanyl-tRNA synthetase, class IIc, core domain	Interproscan
IPR051335	Family	Alanyl-tRNA Editing Enzymes	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR43462	ALANYL-TRNA EDITING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000166	Molecular Function	nucleotide binding	Interproscan
GO:0002196	Molecular Function	Ser-tRNA(Ala) hydrolase activity	Interproscan
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0004812	Molecular Function	aminoacyl-tRNA ligase activity	Interproscan
GO:0004813	Molecular Function	alanine-tRNA ligase activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0006419	Biological Process	alanyl-tRNA aminoacylation	Interproscan
GO:0006450	Biological Process	regulation of translational fidelity	Interproscan
GO:0043039	Biological Process	tRNA aminoacylation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf7376_3.6 global RNA-seq network