Gene detail

Detailed information of PE_Scaf6846_1.5 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6846_1.5	2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE	Superscaffold8	51747360	51774935	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf6846_1.5

Transcript

PE_Scaf6846_1.5

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
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PF02779	Transket_pyr	Transketolase, pyrimidine binding domain	Domain	Interproscan
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InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
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IPR005475	Domain	Transketolase-like, pyrimidine-binding domain	Interproscan
IPR011603	Family	2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component	Interproscan
IPR029061	Homologous_superfamily	Thiamin diphosphate-binding fold	Interproscan
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IPR042179	Homologous_superfamily	Multifunctional 2-oxoglutarate metabolism enzyme, C-terminal domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0016624	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor	Interproscan
GO:0030976	Molecular Function	thiamine pyrophosphate binding	Interproscan

KEGG pathway

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-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6846_1.5 global RNA-seq network