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Detailed information of PE_Scaf6317_0.4 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6317_0.4	XANTHINE DEHYDROGENASE	Superscaffold8	3555536	3561985	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf6317_0.4

CAGTGACGAGAGTGCATCAGACAGAGCTGATTTAGCTAACGTGCTGAAACTAGATAGACGACGGCATGTCGGACTACGACAAAAGCGAGCTGGTGTTCTTCGTTAACGGCAAGAAGGTAAGTAGTTGTGTCGCTGTCGGCCAGCCTACAAATAGGTCCAAAGCTAACGTGTTAAGAACGGGCTTACCTTAACTTAGTTAACTAAGTAACCCGGGGTCGTCCCAGGGCAGGGGATGCTGACGAACGTGTTTACTGTTTACTCTCTGCAGTTTGCACAACGTCCACAACGTCATTGTCTATGACGGTGTAGGCGCTTATTCGACCAAAATGCCTTTTTACTTGGGACCAACAGTGGCAGTAGACTCCGGTTAGCTTAGCAAAATCAGTGTGTCTGATTCAACTGACCGGCGGGTTTGGTATTTTATAGGAGGTAAATTTGCCTATCTCCGTGTGGTGGCGCCACCATTGTCAGCCTCAGAACTCTGGACCAGTATCCTACACGGTGGATTCTCCTACACCACAACTGCAAAATAATTTATGAATCAGGCCATTAAGGTGGAATTTGTAAAGCGAAGTTAGCTTTCTTAATTGAGCATCCGATATATGTACGTCTTAATTGAGCATCCAAGATATATGTACATGAGAGATGAGAGATATGTACATGAAAAATGGCTTGTATCTAAGTGGAAAAGGGGGCAGCAGTTTTGTAAGAGAAACTGATGCGACCTGTTGACAGTGGGACAGGTTGCAATCCAAAAAGAAACACTTATCGAAAGAAGCTATTAGAAAAAATAAGTACAAACAAATGATGTGGAAGTCATATATAGACGTACTGGAAATGATGAAGACTACCGGGGTACTACATTTATAAAGAAGCACTTAACGAAGCTACAGCTGAAATTCAAAGAGAAGCTATGAACAACAATTAGCTTGTAATATAAAACAAGACAGCAAGAGTTTTTATGCGTATGTTTCAAAGCAAACAGAAAGTTCAGGATAAGGTCTATCTTCTAGAGGATAGTGCTGGACATATAATTTCAGGGATTCTTAATGGCAGAAGACCTGAATGAGTATTTTAGTTCAGTGTTTACCAGGGAAGATATCAGTTCACTTCCAATACCAGAGGCTAAGTTTAAGGGGACAGAATCAGACTATTTAGGACAGTTAATTGTAACCCCAGAAATGGTAGCTAAGAAAATAAGGGCTATGAAGGATAATAAATCACCTGGAGTGGATGGGATTCCGACCAAACTACTTTTGGAAATTGTAGAACAAATTAGCCTACCGCTTGCCACAGTTTTCAGTTTGTTATTAGAAGAGGGAGTGCTTTGAGAAACAAGTCAGCGAACTATAGACCAATGAGTTTAACATCAGTGATTTGCAAAGTATTAGAAAGACTAATTAAAGATCACATGATGGATTTTCTTGTTAAACATAGCTTGATAAACCCATCTCAACATGGTTTTCTAAAAGCGAGGTCATGATTAACAAATATGTAGTTTTTTGGAAGATATCACTAAGTGGGTAGACGAGAGATCACCAGTAGATATAATCTACTTAGATTTTCAGATAGCTTTTGATAAAGTGCCACATCAAAGATTATTGCTTAAAGTTAACTAAAGGCTCATGGCATAGGAAATGGACTAATTAACTGGATGGAAACAAGGCTGATTGACAGAAGGCAATGGGTAGTAGTTGATGGAGAGGCAGGGAATCAGTTTTGAGTGGGGTACTACATGGATCAGTACTGGGACCTATATTTTCTTAATAGATATCAATGATTTGGACGATGATATAACAAGCAAGGTGTTAAATTTGTGGATGCAAAAGTGTTTAGAAGGATTAAAAGTGATGGAGATAGACAGCATTTACAACAAATACAAGATGATCTTGACAGGTTGATCAAAATAATAGTCTGAAATGTGGCAAATGTTCAATTTTGGGAAATGTAAATGCCTCCACACAGGACATGGGAACGAAGACGTAGAATATACAATGGGGGGTACTGTACTAATTACTACTGTAAAAGAAAAGGATGTAGGGTTAACCATTAGTGCTGATATGAAGGTTTCAGAGCAGTGCGGACTTGCAGCTTCAAAGGGAAATAAAATCCTTGGTTTATTTAGGTGAAATATAGCGTATAAAGAAAAAGAACTAATAATACTGCTGTACAAAGCAATACTTAGGCCTCATTTAGAATATTGTATACAAGCGTGGAGGTCATATCGCCAGAAGGACATTGATATGCTAGAAAAAGTATAGAGGAGAGCGACTAAACTGATACCAAAACTGAGGGATCTTAGTTATGAAATACACCTAAAAGAATGTGGTTTAACAACACTTGTGACCAGGAGATTGAGAGGAGATCAGATAGAAGTGTTTAAAGTATTGAATGGTTATGAAAATATTGATACAAATATTTTTTATTTGTTAAGAAAGATAGAAGGACTAGAGGACATGAAGTTACATTAGTAAAGGAGCAGTGTAGATTAGATATATATATATAAGAAAGTTCTCATTTTCACAAAGGACTGTAAATGAATGGAACGGATTATCTGCTGATTGTGTGGATGCTAGTTGCGTGAATATGTTTAAAAATAAAATTGACACACACCTCGGAATGGAGGGATACAAGTAGATAAAAGGGTTGGACTCTCGATAAGCCAAAGAACTTCCTTGTCCACCTGCCATTTAGAGTTAAATCTCTGGGTGGCAATCTTGTTAAATTGTGTTAAATCCGAACTGGCAGCAATTTCATACACTACGTACAACCTCCTAGTTTCATCATGCACCTCACCAATGTGATGGAAATGAATAAATGTAATACCTGGATGTTTACCCAGATTCTGAACAAAGTACACACACATATATATATATGTGTGTTTATTCAGTAAAATGATACAGGCCCGTGCACTACAGTTCCCAACAAGTCATGACATTTGCTATGAAAAAGGCTGGTTGTACAATTGGAGCGCAGTGGCCGAGTGATTGGAGCATCAGACTCTCAACTGAGAGAACCCTAGTTTGAACCCTGTACTGCGATGTGGAACCTTGGGCAAGTTCGTTCACTCTACGTTGCTCCAGTTCACTCAGCTGTGTGAATGAGTACTGGCTATAGACAGTGACCTGGTGATATTTATGTACGAATAGTCTCTGCGCATTAATTGCAGTATGGCTTAATGCTTCCCATAGAAGTTGAGGTTCGATTGAACAGCTCTGTCAGTGCCAGGGAGTAAAGTATAAGTGCTTTAAACAGTCCAAAGGACTGGATACTGAGCTGTATGTGAACTTACCTTTATTCTTTATATTATTGCATATTGTGCAGTGCTCAGGTGATCAAAACGAAGTTTAAATTTGTGTTGCAAATCCAACGTTTTCTCCAGTTGTTTGAACTCTGACCATAGAGTTACTCTGACACAGTTATGTTATCAATTTTTACCTGTAGATAACTCTGTGTCAATGTTACCTTGATTGCTGTGCCTACTTCTAAGTAATCATTGACATATCTAGGATCTCGCAATGGGTAGAAACGCACAAAGCTTAGTTGCACATTAGTTGTTTCTGTCTAAACTGTAATGGCGCAACAGGTTATATAGAGAATATGGCTTGCTCATATCAGTTGTGTCCTTGATGAACACATAACACCAAATGTCTCATGAATTTGAATTGCCACGTAAAATTATATCACACAACATAAAATCCAACTAGAAGTCTACAGCTTTTGGAATAAATTATTCGTCTGACATGCATTTGGTGTGCGCATCCAGGACAATAAAGGAAAGTTTGCAGTCATTAGAGACTTGTGACGACCCACTCAAAATGGCTTGGTGACCCATTTTGGGTCGCGACCCAGGGGTTAAGAACTGCTGATGTAGATCTAACACAGTGGTCAACAACAAAAAAGCATGAGTGGCTCCAAATCAGGCCAGCAACATGGCTTAACTTAGGCACAGGATTTCTGATCATCAATTTAGTAACATTTATTTATATGTTTCTTAATAAAAATACAACATACACCAGGGTGTATATATATATATATATTATATATATCTATACAACCGGGTATATCATGTTTGACAGCCAACCAAACTGTGCTTAATAATCATGCATCTTTTTGGCAAAATTTTTTAATCAACGAAAAACAACAAACTTTGGTACATATAAAAGTTACAAATGCTGTGGAGGTATTGGGAACATTGTAGCCCAAAACAAAATAGGCTATCCATGACATTCTGATGAAACCCTGTAAATGATTTTTTTGGCAAATTGACTTAATCTAGTCTGCCCCTTCAAGAAATTCTCAAAGTTGGACATGACCAGTTGATGTGGTCATTGGTCACAGTTGGCAGGTCACACCACGTCCATTCTGTTAGAAACAATCTGTGTCAAGAATTATGGTTGTCCAAGAAAGACCGGTCACGTACAAAATTCTACAGGAGAGATGTCCAAGACAGACCGGTCACCTAAAAAGGTCAACAATAGAGGTGTCCAAGACAGACCGGTCACCTACAAAGGCCTGCCAGAGTGGTGTCCAGGACAGACCGGTCACCTACAAAGGTGTATCAGAGAGGTGTCCAAGACAGACCAGTGTAATTTGGTAAACATTTTACTGATTTTGATGCCAAAATTGTTTTCACAAATTTAATGCATTTCACTGAATGCTAGTGGCTCAGTCTTAAAATATGTTCATCTTTCAGGTGATTGAGCACAACCCTGACCCTGAGGTGACCTTGCTGCAGTATCTCCGTGACAACCGTATCCTCTCATTCTTTAACATAGTGTTAACATACAGACCTCTTGTTTATTTCTTTATGGGTACCTTCAACTTATGACATAGTACAGAACGTAGATGTAATGGTCACAACTACTGATTTGTTATATGAAGTGTTAATAGCAGTTTGAACTACATTAATACCCAGTAGTATTCACTGTTGGACGAATGTTTTTTGGTGGTATTATTAGCCATAGAAGAATGCTCTTTTAATACATTAATCATTTCAT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00111	Fer2	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001041	Domain	2Fe-2S ferredoxin-type iron-sulfur binding domain	Interproscan
IPR006058	Binding_site	2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site	Interproscan
IPR012675	Homologous_superfamily	Beta-grasp domain superfamily	Interproscan
IPR016208	Family	Aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase-like	Interproscan
IPR036010	Homologous_superfamily	2Fe-2S ferredoxin-like superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45444	XANTHINE DEHYDROGENASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005506	Molecular Function	iron ion binding	Interproscan
GO:0016491	Molecular Function	oxidoreductase activity	Interproscan
GO:0051536	Molecular Function	iron-sulfur cluster binding	Interproscan
GO:0051537	Molecular Function	2 iron, 2 sulfur cluster binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6317_0.4 global RNA-seq network