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Detailed information of PE_Scaf6273_10.9 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6273_10.9	YTH YT521-B HOMOLOGY DOMAIN-CONTAINING	Superscaffold3	10971053	10980298	-

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CDS

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PE_Scaf6273_10.9

GGCCGAGGCACATGCAAGTCCGCCATTGTTCGGTGTGATTTGCGCAAGTACCTGCTGGAATTTTTCAGCGTATTCCAACGGATTAAAAACTGGTGCGGCTTATATCAGTGTTTTACGAAGTGCGCCACCCGTGTGTGTTAGTGAAGTGTTATACAGACATTGTTTCTAAAATTGTACCGAGAATCTGTGATGTCTGCAAGTGTCGATCAGGTTTGTAAGAACGACTGAATTGAAGTTTCCACAAATATGTCGTTGTGATGTCGTTGGCAACGTTGCGCTTTAATACCGTATATTACTATAGGTTATTGCTGATTAATCTAATGATATCCTTGTTTCTTTTTCATAACCACTGACTCTACCCGTGCAGCGGTCTAAAGGACAGCCCAATCAAGGTAAGATTGCGTTAATGTGAAAAATATTCCCGATTAACACGTCCTGACCGGATGTGTGTCGACTTGGCTTGGTTTTGGCTTTCGTCATTGATAAATTCCATTACCTGTTACGAAATAACCAAACCCTGTGCTTTCGTTTCCTACTGTTCAATCGGAAAATGTGTACCTTTTATACGTGTGTTATTTTGATTATGACTCATTTATTAAGTTCACTCACAGGCGGCCAAGCCCAAACAACTGAAATTATTAATCATTTATTCAAGTTAAACAAATTAATTTATGGGGATTAGTATTGTAAAAGCATTATGTACAAGTGTTGCTTGGTTTCGGCCTTGCCCATGAACAATGGGCATGGCACACATGGTATGTATATTCATAATATTTCATGCAAACATGCAGTAATTCACATTTTTTATGTTTATATATCTTTAAAAATTAAAGACTTCTATCACACCAAGGTAAATAATACAATTATAATAAAGTATTTTGATCATACAAAAAATATAAAATGTTTTAAATATATAGATATGAGTTCATAAGCGTTACAGAGCTCCAGGTGAATATGGTACTATAAAAAATGTATTGTTAATAGATTAGTAAAGCAGTGACGTAGAAGAATAAATTAGGCCGTTGCAATAGAACCAATATTGTTTTTAGTAAACATTTGACAGTTTCTGCTCGATTATACATTAGTTACCATGGTATCTTAGCATTATAAAGATCTTGGATGCTCCCAGTAGAACCATTATTTGTTATACAGATATGCATGATGGTGACATTAAACACTGTTTAGAGTAATTGACCTCGGCATAAATTCAAACCATGATCCAATGAGCTGTTTTTATATATATTTTTTTAATTAATTGTAACATTCTTTACTGGAGAAGCATGCACAGGTATGGTAACTGTGTTTATTCATTTGCCATGGTGTATGTACAATTATAGCAATTTCCATTTGTTTATTGTGTATGTAGTATGTACATATAAAACAATACCACTAAGTGCAACAATGAAGTATTGAAGCTATATTACGTGTACGAGCTGTGTGACAGGCATGATGAATAGGAAATATAAATATGATGTCAGAAATTCAGACTAGGTGTCTGCTATTCATGATACTAAACGATGACACGCTCACAGGACGCAGTGCAGTTTAGTGACTTGAGTGATAGTTTAATCAGTCGGCTGCTATATAGACCTAGCCTGCTCATTGCATCACAGAAGGACAGTCTACATGTTCGATTGTACATTCTGTATTCCACATGCAATTAATGTCAAGCAATGTGCGTGTTTGTGTGTGTTATGCATTACTAGTATTTAAAATTACAAATATGATTTAACATCAGTAATAAAATATTTCTGTTTTCAGTCTCCAATGGTTCCGGGGGCAAAGAGCCTGAATTTGAGACACCACCCTACCTGCAGAACCCTCCCCCTCAGGTAACACATTCCATAAAAGATGCAGTAAACATGTTTCATTGGTTATCTTTGTGCTCATCTGGTGATTGGTGAACTTTGTTGTGAAAAAAATGGAGCAAGTACATAAGCTGTAGCACTTTTTTGTATTTTATTTGTACAGGGCATCAATCCAACAAGTTGGAATTAGCCTTTAAAAATATTTTATTGTTAGTTTAATTTTTAACGTTCCTCATGGTCAAAATTTCTGTCATAAAGGTATGATTTTAAAAATAATCCAGAAATGTGTTTGGGAGGGCTATAATTGAAATTTGAAATTCAATAAGTGTGTGAAGTTGAAGAAATAACATTTAAATTGTGAGGTTGTCATTACCGGTATGTTTACATGAGCACTTGTTCGTTATTTATTGTTTGTGACTGGGAATACTTCCTGATTGCAGCGGTCATATTGTTCCTCTATTAAAATCCCCTTATTTTTTATCCCTTAAAATTTTTCATAATTCCATTATTAAATAACCACTAATGAAGTAATAGATTCTCAGTTTTGTTCCTGATAGAATAAGTTATTTTTTGTGGACGTGATTAATTTTTGACAAGACAAAAAAGAGAGTAAGATTTGGGTTGAAACTAGTCATATTGGATAAAGAATTCCTTTACATTCCATGACTCTGTAGAGTGGCTGTGGTATGAATATTGACATGAATGAACAATGACTTTTTGATGTGGAATTTATCACATTTCTTATTCATAGCAAACAATTTATTGCAAGTAATTCTGAAATGTGACGATAAACTACAAAACTAACAATTTTGTGTTCATGCTGACCATTATGATGTTTGAAAATTGAGCTTGCCAGTATTGATAGTAACTTGATACATGTTCTCACTGTTTCTGCACCATCTAATGCGTTTTTGTTTCCCTTTCATGTGCGGACTGCTTTGGCTGTGGATTGCTGCATTTGTCATCTGGTCATTTCGTTGCGTCTGCCACCAACAGGGCCCGTATGCAGCAGCGCCAATGAACAGCCCGAACATTTCTGACCAATACATGTCAAACTACTATCACCCTTACATGTCGTTCCCAAATGTCACCCAAGCTGGACCAGGAGAGGGTGCTTGGTCAAACGGCGAGTCAGTGTCATTCTTGGGTGGATACGGTGGTCACATGACCAACGAGTACATGTCAGGGAACGGTATGTTTAGTGGTGGCTTTGACTACAGTCACCCTGGCTTCGCGGCATGGAGCTTTCCCGGTGCTGACTACAGTGCATGGGGAACGAACTCCCTTCAGCAGCAGCAGCAACAACAGGGGCGTGAACCGGACGAGAGGGCGTATGCCAGGGGGTATTATAACATGGCCCCGCCGACTGACGGTTACGGGGCAATGAATGGTGCCGAGATGGAGCGTGATCCAGGAATGAAGGCGGTGGAACACGGGCTGAAGGGAATGAGCATGAATGAGGTGCACGATGGTGGAATGAACGACGGCGGACGTGGCAGTGTTTCTGGGGGCCAGCCAGGTGGCCAGGGTCCATCTGGCGGGCCAAGCTCACAGGCGCCCAAGAAGATGTCTTGGGCATCGATTGCGAGTCAGCCGGCACGACCTCAGCCGCAGCTGAAAGCTCGGACCATTCCCCCCGCACCAATCCCCCGTGGTAAGCACAACATGGACATTGGTACGTGGGACAACAAGGGGGGTGCGCCAAAACAGATGGGCGGACAGCGTCAGGCGTGGGGCAACCCTCGTGGCCGCCAGCAGACTGGGCCATACAACGCCGGTGGTGGGCTTTCCAACCAAAACGGACCATCTTCCAGCCACCAGAGTGGTGGCGGTACGAACTCTGCAGCGACTAGCGGCCCCTCTAGTAGCGCCTCTCCGAATCCGGTGCTCGAAAAGCTGCGCATGGCGAACCAGTACAACCAGAAAGAGTTCAACCTGCCCCTGAAGGGTGCGCGCTATTTCGTCATCAAGAGCTACTCGGAGGACGACATTCACCGCTCGATCAAGTACTCAATCTGGTGCAGCACGGAACACGGCAACAAGAACTTGGACTCGGCGTACCGAGAACGCGAGGGGAAGGGCCCCGTCTACCTGCTCTACAGTGTCAACGGCAGTGGCCACTTCTGCGGCATGGCGCAGATGATGTCGCCTGTCAACTATAACACGTCTTCAAAAGTGTGGGCGCAGGACAAGTGGAAGGGGCAGTTTGAGGTGAAGTGGATCTACGTGAAGGATGTTCCAAACAGCCAGCTGAGGCACATCCGGCTGGAAAACAACGAGAACAAGCCGGTGACAAACTCGCGAGACACTCAGGAGGTGCCGCCCGAGAAGGGCAAGCAGGTCGTCAAGATCCTGCACCAGTATCGCCATCAGACGTGTATCTTCGACGATTTCTCCTACTATGAGTCGGGACAGGAGGAGGTGGTACCTTCAGGCGAGGCGCCACCACCCAAGAAGGTGTGTGCTCCGTGATTTTGCTCTTTCTACGGTCACTTGGTGTTCACTCATCTGGTGTTCTACAGGGCTCGATTTTTTTATTGGAAATATTACAGGTTCATAGTTTGATTGGTTTGTCATAAAATCATGTTATATGATAGTGTTGTGTCTGGGTAAATCTGTGTGCAGAGACAAAAAGACTGTTTGTAAATTTACTTTAGTGGTATGAATATTATTGAGGGGTTGTAATATACTGTTATAGTCACTTTCGGGACTAGGCCAAATTGTACATCATGTTAGTGGGACTAATTTCCTAAACTTGATTGTTATACAAATTATTTGGGACTGTTTGGAGGTGACCGTAATTGGGAGGTGGCTGTATTACTGAGGTGACCGTGAAGTGAGATTTTACTAGTCTATACTAAACATGATTTCATGATAAAAACAATCAGGCTATACACATGATAATTGTGACATTCGATCTGCAGGGGTAAGTTGTACTAATGTTTCGGTGGTTGGTGTACATTTCCTAGATGACTAACAATTAACTGTGGACTATCTCGGCCTGCGAGTCTGTCATCTTAGAAATGTACCTAATAATTATGAGATAACATCAGATAGGTACACGATTGTTGGCAGTTCAGTTCCCTTTCCCAGGCTGTTGTGCACAGAACAGTGTACTTAGCTTCATATAATCAATGAATGCATAATTTTGTTTGATAAATGTTGAGAAAGTATCTTAAATTGAACAGAAAG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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04146	YTH	YT521-B-like domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR007275	Domain	YTH domain	Interproscan
IPR045168	Family	YTH domain containing protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12357	YTH YT521-B HOMOLOGY DOMAIN-CONTAINING	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003729	Molecular Function	mRNA binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0061157	Biological Process	mRNA destabilization	Interproscan
GO:1990247	Molecular Function	N6-methyladenosine-containing RNA reader activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6273_10.9 global RNA-seq network