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Detailed information of PE_Scaf6195_1.27 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6195_1.27	SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN SM	Superscaffold2	51294531	51303530	-

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CDS

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PE_Scaf6195_1.27

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
--	--	--	--	--

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR010920	Homologous_superfamily	LSM domain superfamily	Interproscan
IPR027141	Family	Like-Sm (LSM) domain containing protein, LSm4/SmD1/SmD3	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23338	SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN SM	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000387	Biological Process	spliceosomal snRNP assembly	Interproscan
GO:0000932	Cellular Component	P-body	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0005688	Cellular Component	U6 snRNP	Interproscan
GO:0006396	Biological Process	RNA processing	Interproscan
GO:0017070	Molecular Function	U6 snRNA binding	Interproscan
GO:0033962	Biological Process	P-body assembly	Interproscan
GO:0097526	Cellular Component	spliceosomal tri-snRNP complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6195_1.27 global RNA-seq network