Gene detail

Detailed information of PE_Scaf6149_3.5 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf6149_3.5	3-HYDROXY-3-METHYLGLUTARYL COENZYME A SYNTHASE	Superscaffold2	53401833	53429000	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf6149_3.5

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
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PF08540	HMG_CoA_synt_C	Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase C terminal	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
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IPR013528	Domain	Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase, N-terminal	Interproscan
IPR013746	Domain	Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A synthase, C-terminal domain	Interproscan
IPR016039	Homologous_superfamily	Thiolase-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004421	Molecular Function	hydroxymethylglutaryl-CoA synthase activity	Interproscan
GO:0006084	Biological Process	acetyl-CoA metabolic process	Interproscan
GO:0008299	Biological Process	isoprenoid biosynthetic process	Interproscan
GO:0010142	Biological Process	farnesyl diphosphate biosynthetic process, mevalonate pathway	Interproscan
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KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf6149_3.5 global RNA-seq network