Gene detail

Detailed information of PE_Scaf5802_6.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf5802_6.2	60S RIBOSOMAL PROTEIN L38	Superscaffold5	4449371	4455013	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf5802_6.2

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01781	Ribosomal_L38e	Ribosomal L38e protein family	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002675	Family	Large ribosomal subunit protein eL38	Interproscan
IPR038464	Homologous_superfamily	Large ribosomal subunit protein eL38 superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10965	60S RIBOSOMAL PROTEIN L38	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003735	Molecular Function	structural constituent of ribosome	Interproscan
GO:0005840	Cellular Component	ribosome	Interproscan
GO:0006412	Biological Process	translation	Interproscan
GO:0022618	Biological Process	protein-RNA complex assembly	Interproscan
GO:0022625	Cellular Component	cytosolic large ribosomal subunit	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf5802_6.2 global RNA-seq network