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Detailed information of PE_Scaf5785_1.4 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf5785_1.4	OXYSTEROL-BINDING PROTEIN-RELATED	Superscaffold6	20088486	20098497	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf5785_1.4

GGTAACTCTCTGTCGGCCGTCTTGGATGGGGTGGGGAGATTAACATTCCTGAAGCGAGGAGAAGACTACTTGATCACAATGCCCTATGCACATTGTAAAGGTGAGTTTCACTCTTCACTTCGCTATCATAATCGTAAGATTTTACTGTCATTTATTGGTGACGTTCATCTACAAAACTAGGCTCACTATAGAGGGGAAATGACATTGTCAACATATTATTTTGTTGGCTCATTTTTAATTTAAGTATCACATCTTTTATATAAAGTGTACATTTTGTAGTTTCTATTTGCACTTTACCTTGTCTAGTTAAATCTTTAACCCACACATGATAATTTTGTGTTAGTGTTCAGTTATCATTTGTAATTCCTAATAGCGCTATTATTAGGTATTGATCATCTTTTGTTTTAGGACTTACTCAAATTTAAACCGTCCTGAACAGGATCTTACTGTGAATATAAAGTGTATTAAAGTTGTTGATGAATTATTGCATGTTGATTCTGTTTGAATGGTAACATTATTTTAACATCACACGCCTGATGCATGCTGGAATGTTTCAGGTATCCTCATTGGCACACTGACGATGGAGATGGGAGGCAAGGTATCCATTGTGTGTGAGAAGACAGGCTACAGAGCAGACATAGAGTTCAAACTGAAGGTGAATAGACGGCTGTTTGAAAGTAGCTCATCATTAGAACTACAAACCTTTTCAGCTCACCCTTTCAATTCTTCATGCTATCAACATTTCCAACCCACCCTTCTAGGAGAATGTATGGACTCAGTGGGGGATATATTACTGTGCATATATAATATATCAGTCAGTTACTGGTCCGTCTAACAGTAATTGACCTAGCATGTGTATGTACGATAAGGTTTTCCTCCTAGACACTTTTTAACTCGGGGGGCCAAACTTTCACATATTCACCTCTGACCCTTGGAAAGAAACCGAACACTTTTTTTTTCTAAATTCCTTGGTGGTTAAGGGTTCATACTGAACATTTGATGATTGTTTGCAATGTCACACGTGTTTTCTTCGATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAACAAGATTTAACAAGATTGCCATCCAGAAAATTACTCTGGATGGCAGGTGGACAAGGAAGCCTTTTGGCTTATCGAGAGTCCAATACTTTTTATCTACATGTATCCCACAAATTTTTGTAAGGTGTGTGTCGATTTTATTTTTAAACATATTCACACGCTTACTAGCACCAACACAATCAGGAGATAATCGTTCCATTCTATCAGCAGTCCTTTAGAGAATGAACTTTCTTTATATCTAATCTACACTGCTCCTTTACTAATGTAACTTCATGTCCTCTAGTCTTTCTATCTTTGTTAAACATATTTCTATCAATATTTTTATAACCATTCAATATTTTAAACACTTCTATCTGATCTCCTCTCAATCTCTTGGTCTCTAGTGTTGTTAAACCATTCTTTTAGGCGTTTTTCATAACGAAGATCCCTCAGTTTTGGTATAATTTTAGTCGCTCTCCTCTGTACTCTTTCTAGCATATCTATGTCCTTCTTGCGATATGGCCTCCATGCTTGTATACAATATTCTAAATGAGGCCTCACTATTGTTTTGTACAGCGGTACTATTAATTCTTTTTTCTTATACGCTATATTTCGCCTAATTAATCCAAGGATTTGATTTCCCTTTGACGCTGCAATTCTGCACTGCTCTGAAACCTTCATATCAGCACTAATGGTTAACCCCAAGTCCTTTTCTTTTACAGTAGTACTTAGAACAGTACCCCCCATTTTATATTTTACCTCTTCATTCCCATGACCTGTGTGGAGGCATTTACATTTCCCAAAATTGAACAGCATTTTTACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGTCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGTCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGTCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAAACATCCTACAACCAGCTGGCCATGGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAAACATCCTACAACCAGCTGGCCATGGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTGTTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGTTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAATAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCCGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCTGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCCGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCCGGCCGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCCGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTACAACCAGCCGGCCATTGCTATTGTTCAACCATAAGTAAACCATCCTATAACCAGCCGGCCATTGCTATTGCAACACCAAAGAACCGGTGTCAATATTCATCCTGTGGTCATCCACACATGGCAAGAGAAACAGAGGGAAACAGAAGAAAACATACATCAAGCTGATCTGAAACCTTGGTATTAAAGAGACAGACCTTCCATCCCTGAAGCACAATCGACCCATATGGAAACAACTCATCTATGCTCCTGTGCCGGCCGAACAATGGTGATGATGATGAAACCATCCACAATTGATCAGTGATGGTTGTAATTGTATAACCAAATACAATTCTGTGTTGTTGATTTCAGCCGTTCCTCAGCAGCAACGAAGCATCTAACAAGATGATTGGCAAGATCAAGCTGGGGTCAGAAACCCTCGCCACCCTGGACGGGCACTGGGACCAGGAGGTGTACATCAGGGACAAGGCGACAGGAGTAAGTAGCCCTGGGCAGGGAACATGCAGCTAAAGAACTGCATGGTGTATACATGGCGGGAATTGGTCTTATTTTTTTTAAATGATTGGCAATGCCATAGCGAATATGGCCCTGGTTAATAGCCCTTTCCCCATAATGACTTTTAGGTGTCCCAGTACATAGAGTCATAATGATACTAAAATGTTTGTTTTTTCTCACAGGAGACCTCGCTGTTCTGGAATCCCACGCCTGAGATAAAGGCTCAACGAATGAAACGCTTCACTGTTCCCCTGCAAGCCCAGAATGACTTCGAGTCAGAAAAGTATGACATTAGCATTACGATGTCTCGCCAATACTGTGATAATAACTGAAGTATTTCATCTCTACTTGACACCAGCCCATGGAGCAGCAAAGTATGGGCAGGAGTTGTATAATAAATAGTAAAGTTCACCACTGGTAGAAACGAGGTGATGGGAATGGAGCATAAGACCCACTGTTTCCATCTTTCACTGACAACTGAAAAGCATATTGCATACACATAAGTAAATAACTCTAAATGACTGCCATTGTGTAAAAGATCTCATACTGGAAATGGAAAAAATAGATTCTCCAAACCTATCATCTCGATCTACAAAACCTCATACATAGGGCTGCATTAGCTGCATCCAAACAATTTACTGTGATACTGTAGTAAGTCACAAAAGTGCTTTATTTAGGTGGACACCAACGCGTACGTACTGTATTTATTTAACATTTTTTATTATTTTATTTATTATTTTAATATTTGTTACACCTTAAATTTTAGGTGCTCCGTGTTGGACTAAACCACCATTTTACATTTTCTCTACTGTGACTTTGATTCTTCATGTAGAAATGCGACAAGAAATTAATTGTTTATTTTATGTTAACAGACTCTGGCTGCATGTGTCGGAGGCGATACAGAAAGGTGACCAGCAAATGGCGACACATGAGAAATTCATTGTGGAGGAGGCGCAGCGCAAGGCAGCGAAGGAACGCGAAGTGACGATGCAGGAATGGATGCCACGGCTTTTTGAGAGGAACCCAATCACAGAGGACTGGCTGTACAAGTACATCGAGTAAGTGGTCTTTTTGTAGTCCTCACTCTCTGTCTCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCTCCTCCCTCTCCCTCCTCTCCCTCTCCCTCTCCTCCATGCCTCCCTCCCTCCTCACTCACTCTCTCCCTCCCTTCTCTCTCCTCCTCCCTCCCTCTCTCCCCCCTCTCCCCC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ACACAACTTGAT

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01237	Oxysterol_BP	Oxysterol-binding protein	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000648	Family	Oxysterol-binding protein	Interproscan
IPR037239	Homologous_superfamily	Oxysterol-binding protein superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10972	OXYSTEROL-BINDING PROTEIN-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0008289	Molecular Function	lipid binding	Interproscan
GO:0015248	Molecular Function	obsolete sterol transporter activity	Interproscan
GO:0015485	Molecular Function	cholesterol binding	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0032934	Molecular Function	sterol binding	Interproscan
GO:0043231	Cellular Component	intracellular membrane-bounded organelle	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf5785_1.4 global RNA-seq network