Gene detail

Detailed information of PE_Scaf5557_3.13 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf5557_3.13	LITTLE ELONGATION COMPLEX SUBUNIT 2	Superscaffold1	84839496	84862432	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf5557_3.13

ATGCAATCCAAAGCAGTTGCCATGCAAGAATCACGTGACGTCTTCCTTACATACCTGCACCAACGACCATGGGCACAGATTGTGGAGAAATTCAACAAGCCTCAGACAGGAAAGCCCAGTCAATCTGGCAACTTTTTCACAGAAAACATATTCAACAAATACAGTGTGCAGCCAAGTTGGAAGCAGCTGATAGTGCAGAAAGAGCGGGAACTGTGCGTGTCACCTGAGGGTACAGCAGCAGCAGGACCCCAGACTGTGGTGTCACATGAGGATACAGCCACAGCAGGACCCCAGACTGTGGTGGCCAAGACCCAGGAGGAACCACAACCAGGGACAGACAGACTAAGCTCTGGCCACCAGGTGGCACAACCTGCAGTTACCAAACGGCAACAGCAGGGCAAGATGAAAGGGAGGCTGCCATACCCACGTGCCTCTTGGCTGACAAGGGTGGAACAAAAGCTTTATTTGGAGTTGTATGATAAGTACATGAGTTACGTACCAACGAAAGCATCTGCCGCAGAGGTGAAAGAGATTCACCAGCTGAAAGAGCTGCAACTAAGAGTGGTTGTTGAACAGACTGAGTACATGAGCTTCCTGGAGACCACTGCTAGAACGTTCCCTGAGGACTACGCTTACATCCACACTGAGGCCAGCACCTACATAGAAGAACACCTGTCATGGAAGAGGTCGCGGGTCACTTCCTACCCAAGGTATTACACAATTCTTGACAGTGTGTCGCTGGCGCCACCTAGAAGCATCGCTGAACATGTTAGCTTCATTCATCTCAAGACGCTGCTTTGTGTGGGGACCATGCCAAAAGTAATCCTGCCAAACATGAGGCCAGACATGCGGCCGCACGTTCCCCTAAACTACGCCAAAGTCAATTGCAATTTTCCTGCAGCCTCCACTAACAGTACCAGCAAGAAGGTTTGTAGTGTGGATGAAACGGCTGAGAGATTGGCCTTGAAATATAAAGTTGATGTTGTCATCTCTGCCTCTGGCTTGAAATGTCTCATGGATAACACAGCCCCAGTCTTCCTCCAGTCATGGGAGCTTCCTGTGGTGGTGCGGGAGTATCCCGCGGAGGGAGACTCGCCATATCGGGTGGTGTACGTAGATCAGCCATTTGTGCCCAAGGTCATGTCAGTGCGAGAGAAGAACACTTGTTATTACAAGGCTGCTTTGAAGACACTGCTACAACACCCTCGTCATGGCAACCAATCACAGTCTCGCACAACAGATGAAGCTGGCACCTCATTGGCTGAAGGAGCTGATGACATAAATGGGGAACTCTTCAGTTCTGTTACGACATGTTTGGAAGATTTAGAAACATTCGGGACTGGCATTAGAGCCACAAAACTGAGGCATGGGCAAAGATGCAAGATGGATAATGAAGCGAAAGTGAAACCAGAAGAGATCATTTCTCAGTCAGTCAGAAACCTGAAAGTTGAGTTAAGGGAAGGTGTTCGTGTCGACGATGGAGAGAACAGGGGAAGGATAAATGTTATGAGAAGTCTGCGTGGAACTGAAACCAGCCAGGTAGACATTGTGAATACAAGGTTGATGGACACAGACACTCAAGTTGCTGACTGTCCAGTCAGGACACAAGAACCAGATACTGTTGCTCCAACACCCAGCACTGACAAGACCAAAGGTGACTCGGTTGTCAACAGAAAACAATTAGATGATGCCGAGTTTTCTTTGGACATCAATTCGTCTGACAGTGATTCTGACAACGCTCTTGTTATTGACATCTCAGCCAATTGTGATTCTCAAGAGGATGAGGAATCAGACGCCAATACAATGTCAGGGGTCGTAGGTCAGTCGCGTGCAAGGTCAGAGGTCACGCCAACGTCGGAAGCCCGCATTGAAATGTTGCAGGGTGTTTTGGAATTTGGAAATGAAACTGTTGGAAATAGAGAAAGTGCAGTTACAGAGATAAAACATGAAATTAATAGTGATGTTAACTCATCAGTGCATATAGAAATGAAGGATGAGATAAATGAAACTGAAACGAACTTTGAAAATCCGATCGGTGCTGACGAGAAGGATGTACAGAAGAAAGAAGTAAAAGTGGAAGATATCAAAGAAATGGAAAGGACGCTGCCTGTTAAAGTGGTTACTTGTCAAGGACGTGATGACACAGCTGACACAGCTAGTGACATGTCAACTCCAAGGAGGCGGTCACAGCGATGCAGGACAAGGGCCACCAATGATGACGTGTCATTTTTAAGTGACACGACGTCGACGGTGGAGCTTCTACTGAGACGGTCCCTGAGGTCCACCAGTGATGTATCATCTTTAAGTGATGTGACGTCGACAGTGGGGACTCCAGTGAGACGGTCCCTGAGGTCAGCAGTGACCAGGTCAGCCACTGGGGGACTGAGCGGGGGGAAGACACAGGCAGAAAACAGGAGGAGGACAAAGAGTGGGCCACGGAGGAGGAAGACAAGAGTGGAAGGACAGGACACAGGACAAGACGGACCAACACAGTGCCACGTCAGTGACACACAGACTGACATAGACACCAGACAGACACCACTCCATGAAGACAGTACAGCCGCCAAGAGGAGGAGGTCAATCCGTATGCCCACCAGGGCACAGAGGGAGATGACCACTGCTGAGGTGGCTAATGATACAGGTGTGACGACACGGTCAAAGAGACGCAGGTCACAACAGTTGGACACAGGCAGGTCAGTTGAGGTCGTCTCAGAGAGTCCTGAATCGGGATCTGTGCAAAGATCACCAGAGGTCACATGCAGGACACCTGCGAGTGAGGACAGGACAACCTGCAGGATTGTTGAGCAAACAAGAGAGGAACCTGAGGAAGAGACCCAGGAGAAGAAGACAAGGATGCAGGAGGAGAACACAGATGTGAGGACATCACCAGACATTGAAGGTGCTTTAGGAGACAATCAGTCTTGTGTCAGTGGAAGTGACATTGCAGGAGAGTTGACAGATATCTCTCGTAAAAAGAGTTCTGAGAATGCCGCTGGACCTCACTCTGTGGTTGGTTCCCGCGGCAACCAATTTACAGATTTTGCCAATGACAACCACTCCACTGATGAGGTCATTAGCAACAACTTAACAAATCTAGTCAACCCGGAGGTGAGCGACTTGTCAGATGTTATCAGAACTGTTGCCACCAGTGATGTAGCCAGTAGTGATAGGAATACTGGTGGTGCTCGCAGAATCAATATAGATAGCACAAAGGAGGGTTGCAGTGAGGCGAAGGTCTCTGTTAAAGTAGGCAAAGACACAAGAGATGAGAGGGATGATGTTGGTGGTGTGAGTTTTACCAGGAGCAAGAGTCAGACACAGAAGAGAAAGAGACAGACAGCTGTGGAAGATACCAGCAGCAACCAGAGACAACCAAAAGCTCCCTGCCCCACCCTGGGTCACACACCCCTAGACAAGATCCTATTGGCACAGCAGAAACTGCTACAACCAACGTATCCCAGCAGGCAGCAGTCCAATATGCTGCCCCCTACTGGCAGTACAGCGACAATGCCTGCAGGTGATCAGACAGTTGCCAAGCCATCTTGTGAACAATCTACAGCGCCCCATGGTGAGTGGGAGATGTCGGAAGACCCCGCCTTCTATCCCACAGAACCCCCGCACCGCAGCAATCTCTCCTACGATCTGTGGACCCTCGGCAACATCAGACTCCTTGTTCGCAGTCATTGCCATGGAAACATCACGACTTACAGGAAACCTATGTATCACGTTGAGCTGTCACCAAAGTTGGAGTACCAGCCGATGTTTGGCCTGGAACAAGTGACACCTAGTGAGGCCGCACGGAACTGGACATCTCTGTACATACACAACAACTGCCGTCTCATTCGAGCTCGAATCAACTGTTTCACATCAGAGGTGATGATGCTGGAAGAAGTAGACTTGAGACAAGTCGTCCCTCCAAGGTGTCCATTCCAACCAGCATCGGCTGTGAGTGTTCTCCACAGGGTCCTCACAAAGTTATACAGTTTGCCCAGTGGTCAGTATCTGCTGAGTCATACTCCTGGTTCTGGACATGCCAACCTCAAGAAGAGTACACACAATGACATAGGGGCATATGACCTTCACCGTGCCCATTCGGGCAGCCCAGCCATAGATGTATCAGGCAACCACACCGTACCCTGGATTCCAATTGACACGAGTATACTGCTGCCTCATCATAAGAAATACCACAGAATCCCTGCAACGTTCGAGCCAAAAGATGCAGCTGCTAAATTCCAGCCCAAGGCCCAACAAAAACAGAAGAAAAAGAAGAAAAGGAAGAAAAAAGGCAAAGGTCAAACTAAGGCTGCAACAGGAGAGCTGAACTGA

Transcript

PE_Scaf5557_3.13

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
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InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
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PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

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KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf5557_3.13 global RNA-seq network