Gene detail

Detailed information of PE_Scaf4857_9.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf4857_9.6	GTP-BINDING PROTEIN HFLX	Superscaffold6	59146311	59163815	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

PE_Scaf4857_9.6

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF13167	GTP-bdg_N	GTP-binding GTPase N-terminal	Family	Interproscan
PF16360	GTP-bdg_M	GTP-binding GTPase Middle Region	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR016496	Family	GTPase HflX	Interproscan
IPR025121	Domain	GTPase HflX, N-terminal	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR032305	Domain	GTP-binding protein, middle domain	Interproscan
IPR042108	Homologous_superfamily	GTPase HflX, N-terminal domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10229	GTP-BINDING PROTEIN HFLX	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005525	Molecular Function	GTP binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0043022	Molecular Function	ribosome binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf4857_9.6 global RNA-seq network