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Detailed information of PE_Scaf4659_3.5 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf4659_3.5	SOLEUCYL-TRNA SYNTHETASE	Superscaffold8	28131090	28138466	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf4659_3.5

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF08264	Anticodon_1	Anticodon-binding domain of tRNA ligase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR009080	Homologous_superfamily	Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia, anticodon-binding	Interproscan
IPR013155	Domain	Methionyl/Valyl/Leucyl/Isoleucyl-tRNA synthetase, anticodon-binding	Interproscan
IPR050081	Family	Isoleucine--tRNA ligase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR42765	SOLEUCYL-TRNA SYNTHETASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000166	Molecular Function	nucleotide binding	Interproscan
GO:0004812	Molecular Function	aminoacyl-tRNA ligase activity	Interproscan
GO:0004822	Molecular Function	isoleucine-tRNA ligase activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0006418	Biological Process	tRNA aminoacylation for protein translation	Interproscan
GO:0006428	Biological Process	isoleucyl-tRNA aminoacylation	Interproscan
GO:0032543	Biological Process	mitochondrial translation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf4659_3.5 global RNA-seq network