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Detailed information of PE_Scaf4435_1.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf4435_1.6	LYSYL OXIDASE-LIKE-RELATED	Superscaffold4	57768583	57779943	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf4435_1.6

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00530	SRCR	Scavenger receptor cysteine-rich domain	Domain	Interproscan
PF01186	Lysyl_oxidase	Lysyl oxidase	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001190	Domain	SRCR domain	Interproscan
IPR001695	Family	Lysyl oxidase	Interproscan
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PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45817	LYSYL OXIDASE-LIKE-RELATED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004720	Molecular Function	protein-lysine 6-oxidase activity	Interproscan
GO:0005507	Molecular Function	copper ion binding	Interproscan
GO:0005615	Cellular Component	extracellular space	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0016641	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on the CH-NH2 group of donors, oxygen as acceptor	Interproscan
GO:0018057	Biological Process	peptidyl-lysine oxidation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf4435_1.6 global RNA-seq network