Gene detail

Detailed information of PE_Scaf4194_13.11 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf4194_13.11	MITOCHONDRIAL RIBOSOME-ASSOCIATED GTPASE 1	Superscaffold2	34893806	34899481	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf4194_13.11

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01926	MMR_HSR1	50S ribosome-binding GTPase	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006073	Domain	GTP binding domain	Interproscan
IPR023179	Homologous_superfamily	GTP-binding protein, orthogonal bundle domain superfamily	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45782	MITOCHONDRIAL RIBOSOME-ASSOCIATED GTPASE 1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003924	Molecular Function	GTPase activity	Interproscan
GO:0005525	Molecular Function	GTP binding	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0006412	Biological Process	translation	Interproscan
GO:0032543	Biological Process	mitochondrial translation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf4194_13.11 global RNA-seq network