Gene detail

Detailed information of PE_Scaf411_1.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf411_1.3	UNCHARACTERIZED	Superscaffold11	16327083	16334242	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf411_1.3

GACCTTAGCGCATGTTTCAGGCGTTGATGCTGCTGACGATGTGCTTCTACGAATGCACGTGTTCAAGCCAGAGACATACAACGCTACAGATGAGACTACTCGACTTGCTCAAAATACACAATAAGTGAGTATCACTTATTTTATTAGGTCGATTCCGCTTCGACTGCTTTCGTCGCTGCTGCAACTGCCGCCGCCGCTGCTGCTGGATTTAACTGAAACAGTGTTTAATCTCAGTATAGAGCGTCTACCGGTGACCTTTCTTTCATCACCTTTCTTAAATATAATGGAATCTCGTTTGTGCAGGCCTTTTCGTCCCGACTGTAGGCGTATGTATGTAACGAGTTCGCCGAGTAAACGGCTCACGCGTATAACGGGATATATTAGCATTGGGACATTTTGTTCCCGTGAAGTTATGTCCGGATGCCGAAGTTTCCGGACTATCGGGATCCGGATTAATGAAGTTGCGCTGTAGATTTCTTAGAATGGGTTGATATCCTGCTTACACCGACGCCTCTACAACATGTGTGTAGGTGCAGTGTTTCAGATGATTCTCTTAGAAGCGTCGTGCAATTCTATTTGTTCACCCGTCTCTTTTCAAATTACATTTGCCAAAACGTATCCCAGCACAGTTGGCTCTTCCGTCACAACATGTTTGTGCAACTTTTTTGTATGCATGTAGTTTTTTTTATATAAACTCGTCAGAAAAACTATTAACTTATTCAGTTCTGGACCCATAATTAATTAGTTGAAGTGGTTGTCAAACTGGGAGTGTCCACGTGAATGCGCGATTTGATTACGAACAAACGATGTGTGTGGTTTTGTTGTTGTGGATTACCCGTGCTCACTCAACGACCGGATGTCCAAATCAGTGAATTGAAGGTTAAATGGTAAAACTATCCCAATCTTTCCGAAAGATATCTAATTGTGTCCAGCCCTCATCCTTACGAGCACCACTACCGGCTGTCTATGTCTACAGGAGGTCGTTTGTTCCGTTAAGTAATCATTAGCCGGAAGTTCGTTGTGTCAGATGTGCTCACTCCTAGTTTGGTTAAGCGCGAAGGAACAAGACAACGTCAAAACATATATATATATAAATGTATATATATATATATATACATTTATATATATATATATATGTATATATATATACATTGAAACCTCACTATTAAGGTCACCCTCGGGACTGGGCAAAAGTGACCTGAATAGAAAGGTGACCGTATTAATGGGATTAATTTCATATACTTTACAGTTATAGAAATAATTTGGAACTGTCCTAGGGTGACTTTAATTGTGAGATGACTGTATTACAAAAGTGACCGTAATTGTGAGATGGCTGTATTACAGAGGTGACTGTAATTGTGAGATAGCTGTATTACAGAGGTGACCGTAATTGTGAGATGGCTGTATTACACAGGTGACCGTAAATCGAGGGTCTTCTGTACGTATATATGCAATTATTATAAAATGTATGTATTATTATTAAAGTATTAATAATAAATGAGGAACGGACATTAATAACGAAAAGAGATGTCTCCAACGGATCTCAGCTCTCCGTAAGCACCACTTGAATATAACTGCGTCTTCCTCATTAGCTAATTTCGGCCAGTCACCAGTGGGTGTGCAGAACGTCTTTAGTTGACCTAATCACTTCGAGCACGACGTAGAAAGCTCCTGACCATCTTTTCGGCGACCGCTTGGACGTCGGGGGACATTAATATTGACGCTAGAATACGAGACGGTTTAGTCAGACACACAGCCACACAGATGACAAACCGAAATGTCAAAAGACACTTGTTAATTGGCGCATGAAACTGCTCTACTACTATTGCTGTCCAACTGTTGGCGCCCGGCTATTCCTTGCTGACTTCAAGCAGACGTGCTAGACTTGTATTCTTGGAAACAGTCATGTGAAAGTTGACTAAAGGTCTACACAAGTTGATTTCTCTTATAGTAAAAACAACGGACACTGCACCCAACGGAGTGTTCTCTAAAGTTAGATCAAAAGCGTGTTAAGCAGTTCGTCGTAACGAACACATTCGACTAATGACTTCGGCGCGTGCGCATGGATGAAGACGCAGCTATTTTAAAAACGTAGTGCGATAAAAAAAAAACGCAGTGCCAACCAGTGGAAGAGATAATCGCCTTACGCTGAAGCCCGCAGAAGTCTCAGTTGAAAACAGACTGTCGCCCTGAGAACGATGCCACTAATCTCAGCATTGATGGAATCACGGCGATATGGTTTTGGAAACGCATTCGGCATTAGAAATATATTGCGTAATGGAGGCATCGAAGAAAAAGAAAAAACTAAAATATTGTAAGCATCGTCGGGAAGATTCCGCATGAAGTCATATCCAACATTGTCTAACCCCAAAAAGTTCGGTGTTATCACCCCACCAGCAGTGACGAGAACTACGACACTACAACAAAGAACAATTCATCGATTTACTGAAATATACAAGCAGAAGTTGTTTAGGGAATTAGCGGAGTTATTCTTGTATTATATTATCATGTAAATTAATTAATCTGTAACTTTATGTGTGTCATTAAACGTACTGCGCACATTTCTATTTAATCTGTTCAGGACCTATACACATCTAGACATAGAAGAACCGGATTAGCGATGAACAAACGAGCAAAATGGGCAGCTTAAAAATAATAACAATTTGATCCGTCCAATCTGTATATAAATCTCTTCAGTCGCAATACGTTTGTGAACCAGCGTAGATGGAATAACTTATACGCGGTGATACCTTGGATGTGTTTCAACAGGTGCACCTTGCCAACATTACCATTCCCGTGATAAATATTTGAAAATAATTAAAATTAAAACGCATAAATCTAGAGAGCTCGTGTCATCTGTCTTTCTGAAGCCGAGAAACGAATGTCCAACTACTAGTGGATCTCGTTGATCGCTGGGTCGCTCATCTAGTCCATCCCAACATTTTATGAAGCTGGTAACGCCTAGACATCATTTACATATATATATATATATATATAAGAAACTTGGAGTTTTCTTCCGATAATTGGTAACTCTTTTTTAGTGCGCGTCGGCCCCAACTTCTGGTTAATTCCCGGAAAGAAAGTCCTTCTCAGTTAAAACCGTCTCTCCTTGCAATATGTCCGAACATTTCACGAAATATATGTTGTTCATTGTTGTTGCAGACATCCGTTCGAACGCCGATTACGATCGAAAGTGGATCTCCGTGAACACCGACTGTTCTACTCGGACGAGACGAGCGAGTGTTGTCCTACTTACACCGCGCTCGCGAGCCGGACATCCGGCATCAACCCACAAGGCATGATGGTCGAACTCTTCCACACTCGCAACTTTACGCAGACGTTCTACGAGACCCTCTGTCGACCGACGATCAAAGACCGACACTGTCAGTTCATTGCGCCCGAGTACGCGGGCAGCTCGCGATGTGTACAGCAATACTCATATATGTACGCATTAGGCCGAGTATGGGGCAAGCCTCACTATCAATTCAGCATCGACTTCATCCGCGTTGGAACTGGCTGTAAGTGTCAGGTAGATCGTGGTATCACGCGCAAGCAGAAGCAGCACCGGCTAAACTGAACGGACGCTACCGTCGGCCTTGGCGAGGCCTGCCCCAATCGCCGCCTCTCGTCTCCCACCATCTCCCACACGCACACTTCTAGGATCTGTCCCCCCGGAAAACCGGAAGATGACCCATTCACGACAACTCAGACTGTCTGTTAAGATCCCGTTTTATTCCACGAAATCCGTGCGTGTGTAATTCTTCCCCGAAGTGCTGGGGAAATAGAGATGGGAGGTCGGGTGTAGTTCCTGGAAAAGCGCCCCCTCGCATGGCCGGGGAAACATAAAAAAGAACGCGCCCTCCTGGGTCGGCGAGATGCAGGAGTGAGCGCATTCTTCAGGGCCAGAGAGTTGACTTTGAGCGCGCCGGGGTGTCGACACATTTAAAGGTGACTGCGCCTTCGTCGACCAGGCTTGGCAAGAAGGTCGAATGAGCACGTGCAAGCGCATAGACTCAACGTCACACACGCATACGCACGAACGCGCACATACACACACACGCACGTACGTACGTAAGTACGTACGCACTCAGGCTTACACGACGCTCGTGCGAACTTGCATAGGCACAGACATCCAAAGGCGTAGATTCAAAAAAACATTCATCAATGGTTGATGACTCCACAACGAATAGGTGGGCGAAGGCTGCTAACTATAGCAGCCGGCAGGGCTGGTCCGTCGCAGGTCCGGATATCCGTCTCGCTTTTGGTTCCGTATCCGCCATTCAAAGATAAATTGGCATCGATGTTCGCGTTTTCTCGACGTGTTCAAAAGAGCACCTACAAATAGACTATAATTTTCACACTTATCGTGTTTCCGCTCGAAACTATGGAAGCGACAGGACATGGCATAAGTCCCAAATCTTTATTTCTGAAGTAACTGGTAACAAAGCCATGACATTGTCGTTGCAAGAACGGTGCTTGTTATAGCGATACAGTAATTGCCTATGCTATTGTATCTCAAAAAACTAGTTATCCAATCGTTCATATATGATTTCTGTTTATAACTACACATTTAACTAGTTTATTTGATGAACTTAACCGTTCCTGTTGTATCAAGAGTATCTCGTATAACACGTTTCTTGTTATAGCAAGATATGTAACTAGTTTCTCGATTATAACAAAATATGTTTCGAAATAATGTGTTTTGCTATAGCAAGAAACTAGTTACAATGTACCTGTGTTGTTATATCACGAAATTAGTTATCACCGGAAACATGTTTTATGATTTGTGGCATCTGTTTTACTATTTACTGGCGTTTCTGTGCTAATCATTTGTTAATTCTTGGCACGTCACTCGCAAGGACCCGGTTGAGCATACGTGTATATTGAGATAATGCGGAGATAGAGTGACCCAGTGCAGTGATAACGTAGCAGTTGCGGAGACACGTTCAACCTTCTTTGCAAGTAGCCGGTCGCTGCTTTTGCACTTATCGGTGTACATC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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF16077	Spaetzle	Spaetzle	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR029034	Homologous_superfamily	Cystine-knot cytokine	Interproscan
IPR032104	Domain	Spaetzle	Interproscan
IPR052444	Family	Spaetzle/Toll ligand-like	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23199	UNCHARACTERIZED	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005121	Molecular Function	Toll binding	Interproscan
GO:0005576	Cellular Component	extracellular region	Interproscan
GO:0008083	Molecular Function	growth factor activity	Interproscan
GO:0021556	Biological Process	central nervous system formation	Interproscan
GO:0045087	Biological Process	innate immune response	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf411_1.3 global RNA-seq network