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Detailed information of PE_Scaf4051_4.12 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf4051_4.12	RIBONUCLEASE H1	Superscaffold2	3519953	3530896	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf4051_4.12

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00075	RNase_H	RNase H	Domain	Interproscan
PF01693	Cauli_VI	Caulimovirus viroplasmin	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR002156	Domain	Ribonuclease H domain	Interproscan
IPR009027	Homologous_superfamily	Large ribosomal subunit protein bL9/RNase H1, N-terminal	Interproscan
IPR011320	Domain	Ribonuclease H1, N-terminal	Interproscan
IPR012337	Homologous_superfamily	Ribonuclease H-like superfamily	Interproscan
IPR017067	Family	Ribonuclease H1, eukaryote	Interproscan
IPR036397	Homologous_superfamily	Ribonuclease H superfamily	Interproscan
IPR037056	Homologous_superfamily	Ribonuclease H1, N-terminal domain superfamily	Interproscan
IPR050092	Family	Ribonuclease H	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10642	RIBONUCLEASE H1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000287	Molecular Function	magnesium ion binding	Interproscan
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0004523	Molecular Function	RNA-DNA hybrid ribonuclease activity	Interproscan
GO:0043137	Biological Process	DNA replication, removal of RNA primer	Interproscan
GO:0090502	Biological Process	obsolete RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf4051_4.12 global RNA-seq network