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Detailed information of PE_Scaf3111_10.9 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf3111_10.9	MITOCHONDRIAL RIBOSOMAL PROTEIN S18	Superscaffold8	7323606	7329942	-

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CDS

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PE_Scaf3111_10.9

TGGCAACAAGCGGATGCAATCGCCTGTGAAACTCGGCACGAAAGCTTTGATATTTCTTAACTGGTTTGTGGAATTCACTGTAAAATAAACTATGGATGCCCAGGATCTACATGTTTCTGTTGATTATGTCGGTACCAGTGGTATTATCTTCAGTCCAGAACAAAAAGCGTGTCTCCAGACATCGCTCTGCATTCTTCAGAACAACTACAAATTCGACCGTGTTTATTTCTGGGGGAAAATTCTTGGCATCAAGGATGATTATTTCATTGCACAAGGCGTCGAGAAAGACGAATTTGAACTGAAGAAGACGCTGTACAGGTAGGCACAATGTGTGCGAAACAAGTGATTGACACAGAAACATAACATGAAATTGAATTAACGACAACGTTGGGCACCAAATAATAATCATGGATGAGTTTCTCATAACATTAAGTTTAACATGTCTACAATGAAATTTGTTTGTAATGTCTTGTTTGTATTGATTATATATGTTAGAATGAGGACACAAGTTTATGATGTTTGGGTCTTAAGACATGTCACCATTTGCAGTCAATATATTGATCCGACTGACATACGTGTGTCCAGTTTATTTAACATATTGCAATTTAAGCCAATTGTGCAGTTGAAGAATTATATATTTTCTTAAATTGAGTCATTCATGTAATGCCTCAATATTACCCAGCATAGACATACAACTGAGCCAAAACATAGATCAGCTAGGAGCCTTGTGTTGCTGATTAAACTAGTACTGATTCACTGTGGACAGTGTGGTGCCACCTATTGGTTGCCAAATATCTGCATTGTTAACGGGAAGAACCATCAGGTACATAATCTCATGAGTCATGGTAACTCCAAAATATGGCCATCTGCCACCAATCTCTCATCGTCCATAACAAAAAAATGCCTTAATCTATATATTCTTCCAAATTATGAAAATTATAATTATACTGTTATCTTTATGCACACCAGTAGCATTATCCATCCTCACAAGCCAGGGCTGTTTGCCATGCAAAACTAGCCCTGGCTGATCCCCTACGCGAAGTGCGGAAGTTAGCCGAGTCAAACTAGTAATTGACTTCACCAGTTGTGACTGCATCAACCGTGAGAACTGCGCAAATACCCGCCCCAATTTGAAGACGTATAAACGATTTCTGGGAATCCCAGTATATAATGACCTGTTCGCCCATTAGCACAAGCAGCTGAGCGGTATTTGTATTCAAATAATTGCTTCTACTTCCTAAACATTGCATGTAACACGAGCCACAGTTGGTTAAAATTAGCTTTATTATGACCACCTGACCTGCCGAGATCCAGATCTAGTGAGCGATTTCTTAGGCTGAGCTTAAATTCAGAGTTTCGCAAAGCGATCAACCAGGGGACACTCCTGGCTGGCACTAATCAGCAGCAGTGACCCCTGGCGCGCAAGGATGGCATTATCAAACACTTAGTGTTTCATGTCTATGTCAGCCTGTTTTCCGGGTAATATCAATGCCCATTCATGCGTAGTACCAGGTACTTCCTAAAAGCCAGTCATGCATATGAAATACATGTATCTATTTTAAACATGTAGCACACATGGATCTGTACAGGCTGTTTTTTTTTAATTATTAATATTATATCTACTACAGACTGTGATCTCCAAAAGGGTAATCATGTTGCTTAATTATAGCTTGATAAAAATGTACTGCATTAGTTAAATAACCCTCTTCTCTTGCAGCAAAGACTGCGTACACTGGGGCCTGCTGCCACCAGCGACACCTGAAAGGAGGGAGAATGCAAAGTTAGCAAAAGGTCGATTCACTGGTGACCCCTCCTTCGAATTTGAACACACTGAGAAGAAAGATGAAAATGCTGAAGAGGAGATGGTAAGCACAGCCATTTCTGTTTATAATAATGATTCCATAATTTTTTTTTGTATGTATCAGTATCATCTACTCCTGTTTAGTGTATCATTGCTATGTTTGTTAACAATAGTTTACAGTGTACATATCCTATGGAAACTTAGTTTAAAGGCATAACAAACAAGGGGTGTTATAAAGGCAATAGATCATGAACATGAACACTCAAGTGATCATCAGAGCAAGGAACCACAAAGATTTATGGGAAAGGCACTTTTGAACAAACAGTTGTTCAAAATTGCCTTTCCCATAAATCTTTGATACAAATCTTATGTTTTGTTACCTAAAGTAACTATAATTTAAGATTATTTTTAAGTAATGGGGAATTCATTCCATAATTTTGTTGCAGTCACATAGAAACCACTCTTGCTCATGTTAAGTTTAATCTTAAAAACAATTACATACTCGTTAGTGTAAACCATTTGCCTTCTAAAAATAACTGTTCATAAAGTTCAGTGAATTGCAGCATGGGTATTTAAAATATTTATTACTTCTTTATTAGTATAAATAAAAATATTGGAATCAAAAGTAACTCTTGTGATTCAGGTCTCAAATGTGTGATCTCTGTTCAACAGATCACAATCAAGGAGGAGAATCGTTTGGCTGCGGTCATTGCTGAGATTGACAATGATGCCAGAGTTGTGCCAAGAGCAGCCTTCATCAAAACACCTACTGGCGAAGTCTACGTAAACAGATCATTCCAAGGTAATTACAGATGTATACATGTTGAGATGGTGAGTAAAAAGTTGACAGAGATGAAGAAGCTGTGGAAACCAACGAATAAAGATATGAAACTACAAATTATCCGAATCTGCATATTTCCAACTACATTTTACTACGTATGGATGCGAAACCTGGACTCTTAATAAGAACATTACTAAATGTAAAAATGCATTTGAAAACAAGTGTTATAGAAATATATTACAAATTTCATGGACTGAAAGTACAACTAACAAATCCATCGCAAATGAGCTTGGTGTGTACCCAAGACTTTATTGAACTTTGTAAAGAAACAGAAATTAAGTTATTTCGGCCATGTGAAACAGCTGAAGCAGAGGAAAACCTAGGAGACAATGGGAGAAGGACATAGAGGAATGGATGGGAGCAGACATCTGGCGAGTGGGGAGACTAGTAAACAAAAGAGCTGTCTAAAGACAATCCATCAAGGCTGCAACGTCCGGAAATGGATAAGCAAACCCATTAGTACATGCTAAGAACAAAATGTACAGTTCTTGCAGTCAATATTATTTATGACATAAATACAGAATTCTGCATTGTTCATGAATCATGATACATAAAATGAGAAATACACCTCCAATGGTGTAGAGATTATAACTTCCCACACAATACCCAAACATCCAAGAATCTGGCAGAAATGGTTTATCTGAATATGTTCCGTCGTCTTGTCAGCAAATCACAATGTGTAAACTCACAGTGTCTTCTGTTTTGCCAGCATTTTCTTTATATAACCATCCATTGAGACAGTGCAACTAAATTAATGTCACTACAACAATATAACTACACCGTACACAATGTAACATACCCACCCGTGTACCAATATCGTTGTAGGTTTGTCTGTGGCCGAGTCGGCCAAGTTGTGCAACTTCTTCCACTTTCGAGAACCGGAGAAACTGAATGAGAAGTCTCTGCTACAGCGTGCCAACCTGGACAAGGCCATCGACTTCATGGACAGCATTGATGAAGACATCCCAAAAGGTACAGGCTTCATGATCATTTGTCGTGCAATTATGTTAACAGTACAGAAGTACTGTGACCGTACATACCTATTTTCTTTCCATATTTAGATTGTTTGCTGATGTGTTCTGCTCTACAATGATAAGATGAGGGATATTAAACAATCTTGCGAAATTGATCAGAGATAAAAGAAATATTGTTTTATATTGCTGTGTGCAAAACAAAAAAGAAAACAACTAGAAAAGTCCAGTCCTGCTGACTGATACATCAATTTATTATTACATGTTCATCATTGTTAGTGTTATGATCATGCGGACTATGGTCATTGTTGCGTCATCCTACCGGCATGTTCATAAATACGAGTGTTGCCATGTTGACACTTTATACATTACATCCATAATTGACAGTGTCCTTTTTTAGTCCTTTGGGCATCCCTTCCGAAAGACACATGCAACTTGGTGTGAATGAAATTGTCCAAGTTTCAAAATGGTGGTCGGTAGTAGGATTCGATCCCTGGTCCCTTTGACTGGTATTTTACCTCTTGACCACAGCTCCCTACAATAATTGTGTCATGACATTGACAGAATTTGACACACGTCATAATGATGTCATTGTTTTTGTTTACCAGGTGCCTGGTCTCCTTGACTGGTATTTTACGTCTTGACCACAGCTCCCTACTATAATTGTGTCATGACATTGACAGAATTTGACACATCATAATGATATCGTTGTTTTTGTTTACCAGGTGCCTGGAGCCTGCAGATGGAGCGAGGTAGTGGACTTGTTACACTTCGCAGTCTGTCCTGGCTCGGATACGTCTTCTACCATGTTCCAGGCACACGCAAGTTCGGCTCCCTCTACGTGGGAACAGGGGAGAAAAACATCGACCTACCGTTTATGTTGTAGATGCTCATTCCTCACATTTGTTAACAGGCTGCAAGTTATATTTCTTACAAAGGACCAGCTTTGTACACAGGGATGTATATTGCTGTTTGATGACTCCACAAACGTAAAGTACGACTTTGTATTGCCAGTAATAATGTACATTAAGATGATATCGACTTTTGTAATGATCTAGACAAAATTGTACTCGGGTAAGGGGCCATCTGAAAACACTGACGTATAACACTACAAAAATAATAATTTAACATCAGACCCCACGACATAACAGTGGATATATATCAGTAAAATGTTTCTTATCCTTCAAGCTGCAACCGTCACACACCACACAAGCATACATACACTACCATGGTTGTGGCAAAAAGGGATTTATTTGTTAATCTTTTTCATGATAATAAATGTGGTTGGAAAATAAATTATTTTAATAAAACTACATCGATATACAATACTAAATGAAATGGCTGCTAACCTAAACCAATTAAACAAGTTTTATTTGTACTTAACAAT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04712	Radial_spoke	Radial spokehead-like protein	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006802	Family	Radial spokehead-like protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR22069	MITOCHONDRIAL RIBOSOMAL PROTEIN S18	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0001534	Cellular Component	radial spoke	Interproscan
GO:0005930	Cellular Component	axoneme	Interproscan
GO:0035082	Biological Process	axoneme assembly	Interproscan
GO:0044458	Biological Process	motile cilium assembly	Interproscan
GO:0060271	Biological Process	cilium assembly	Interproscan
GO:0060294	Biological Process	cilium movement involved in cell motility	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf3111_10.9 global RNA-seq network