Gene detail

Detailed information of PE_Scaf2852_8.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf2852_8.3	MPS ONE BINDER KINASE ACTIVATOR-LIKE MOB	Superscaffold5	18386285	18391574	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

PE_Scaf2852_8.3

ATGCTGTATGGCACAGTGACAGAGTTTTGCACGGAACAGAGTTGTCCAGTGATGTCGGCCGGCCCCCGCTACGAGTACCACTGGGCCGATGGTCACACAATCAAGAAACCTATCAAATGTTCAGCACCAAAGTACATTGATTACCTGATGACATGGGTGCAGGATCAGCTCGATGATGAAACGTTGTTCCCTTCAAAAATAGGTGAGACTATCATTTGAATCAATAGCAAAGCCAACGAACGCCAAGTCTAAACATCGGCGGCATAGGCACCGGCAGTGCAGTTTTCAAAGAGTCATAGTAATACCGGGCGTCACATTTCAAAGTTTTGCCGCCTTTGGGCTAAATTTTAATGTTTTTTAAAGTTGTCTCGGTTGTAGGTCAGGGTTAGGCACGCTTTTTGTTCTTTATCTACAAATAAATACGGCCAAATTTGACTGGTGACATACGTGTATTTTGTAACGTTGTAACAAAAAAATATACGTACACATACTAGTTTTACGAACAGGTAGGCAGGGCCGTACGTACATATGTACATTAATCCAGATTATATTATTTAGTGTTAAATTTTGACTAATACTGATTAAGACAGTCGCGAAATCCATTAATTGTAAATGGTGTCATATCATTGTAAACACGAAGCAAATAGGTGCGATGTGGAACAACAATTACCTTTGCATTTATATAATAAAATTCTAGAACATGTGCTAAACTAATAACTAATTAATTCAACTTTAATCAAGCTAATGTATTAGGGAAGACTGCGGATTGTTGTCAGTTTTTTCTCTTTCTAATAACATTTCCATAATTTTTGTTGTTGCTAAGTTTTACTTTAGGATATCATGTAGGCCCTATATGTAGTTTTATTCAAAATATGATATTTGGATCGTTCAGAAGGTGTATCTGCGAAAGCAACATGTCCCAACCATATATATATATATATATATATATATGAGTAAGTAAGTATTATGTCTCCAATAAAATTGCATTAATTATACTGTAGCGAAAAATCCTGCCACTATAAATACTGCCGCACCGACCCTTAATGCGCATGTCCGCAGAAGTTCGTTGTGTAAAGAAATATTTTGTCGTATTCTAAATATATTAATCTAATCGCGGTCTTCAAGCTTTATTGTGAATATTTGTGATGGGATGGGTGTAAAATTATTAGAATGTTGTTCATCGGAGACATTTGGAAGAAGGATATATGTGGAAATATTTATAAATGCTAGCCAACTAATGTAAGTTGTATTCAGCACAAATAATGTACAAACTACCAAGACACATATTTGGTGCTAAAATAAAGGACTATACACATTTCAGTTAGTGTATGTTATATCTTGTGTGACTATCACATTTACTCGTGGTTTACTTGTTTACCTGTTACGTATTTACTTATTTATTGTGGTTTACTTATCTATGTGGATGTGATCTATCACTATATCCTATTGTGCATGTGATATGAATATTATGTGACAACCTTGCTCTTAGTACTTATCTTAACCTTGCATACATACATATGTAAGATTTTATATGAACAAGCCTAAAGGAAAGTTTCTGTAACCCAACAGAAAATAAAGTTATTGTATTGTATTGTATAATCACAAAATTGTCATTATATTATATTAATTGCATGCACCAGCCAATGTTACTATCTATCTATTATTCATGGATACATGCAGTAAACATGCTTAATATTAATTACATTAGTTATTTAGTAATTACACAAGGGGTATGTTGACTCCTTATTGTGCCACTACTAACTACTTACACTACCAGGTGATAGCATTTACGTTAAGTCGACACAAACATGCACAAATGATTGCTGTCTCTTGCACTGCATGTATTACGAGTGACTGTCACAACGTTGACATGGCATTGGTACGATTGTCACCTTGTTGTTGTTGTCCACCCATGCAGGTGTGCCGTTCCCACGCAACTTCCTGTCGATGGCGAAGACGATCCTGAAGCGTCTGTTCCGCGTGTATGCACACATCTACCACCAACACTTCCCGCAGGTGATACAACTGGAGGAGGAAGCCCACCTCAACACATCCTTCAAACACTTCATCTTCTTCGTCCAAGAGTTTGGCCTCGTTGACAAACGTGAACTAGCCCCTCTGCAGGAGCTCATAGACAAACTGACGAGTAAGGACCGATGAGCCGTCACACACCGCAACGACTCATGCTCCACAGGCGTGGGTCACGTTTTAGACAACCGTTGTGAAACTGGATTACCATGCCATGGCTGCCTTGGCTGTTCAGGCATGTGGGCATGCTTGCACATGCTTTTAGAAGACATGCCAGTGAGCCCAGTGGTGGCAAGTAGTATTTTTACACAAAGTGTCAACACGATGACATTTCGAGCCTCTTCATCCTAACCCAATGCTTCATGGATTTGTGGCGGATTGCTGCACTGCTGCATGTCACTGAAACTTTGTAAATATTGATCAATATACGTATTATAAACCGGCTTTCATTAACCTGATGTTGATGCGGTCGCTTTCCGATTGGATGTGACGAAGCACAACAAATTGAAAGGTGCAACAAAGCAACATGTTTTAGTCATCAGATGTACTATTAAGACATATATTTGTAAGATATTGCTTGAGCTAGCTCAAGACACCACTTGTGCTAGCTCAAGAATAGTGTGGATGTGTTCATGTAACAACACGTGGTAGTGTCGCCACGCAGCTAGTCTGATAGGGTGTGGGTACAACATGCCTGGCTTGTACCTCTGAAACGACCCATGTGATTGTCTGTGGTGTACATATCAAGCATTCATCTGTAATATATCATTAGATGTCGCCAGAGGCTAGCATGTGTATCAAGTTGGTCCTGTATTCTCATTCATAAGTTACCAATTTCATAAGTCATACTTTCTTCACTCCCTGTACCATGGTATATATAATTGTACACTGCACAAAAACGTGACTTATGAACTTGGTAAGTCTATCAAGAAAACGACTGCTGGTTATATGGCATAATTTCACTAACATTTGAGGAGCTCTTCTACAATTACAACTATCTCAATTATTCTATAATTCAGAGGTAAATGTTGGTCCAAGGAGCTCCTTGCAGTGAAATGCCTCTGTTCTGCTGACTGCTGTGTCTTGTCATCATGGTGATTGAGTGGTTCTGTCAAGAATCTGTCTGGTCAATATTTTATAACAAAACTTCATGTATATATTATGGTCTTCACAACACATTCAATCAGTTGTATATGTACATTATGTATCTATAATTAGATGAATAATTATTGAACTCGTTGATAAAATAGCTAATGGATTCCTTGTCCACATGTTGTCTGTAGCTTCTTTTGGATGGCAGTCATGTTAAATCTTGTCTGTTATTATGTTTTTCCTATCTGGAGTATCTTAACTAATCTTGTGTGTCTACAGTATATGTACCGTTTCAAGTATAGTGGACTTTTGCTATAAGGATTCCTGATGTAAAGGAACATCATATGTACAGAACAACTTATCTAATAACTAATCTTATTCTGGCATGCACTGTGTCATGTCCCCTGGATATAAGGAACAGTTTGACCCAGTCCCCGTGTGTTCCTAATAGCGAGAGTGCACTGCATTTATATAAGTATCTGCTGTATATACACATTTTCACCGGTAGACCATTTAAGGGTAGCCACTACTCAAAAACGGCCATAGGCCATATCTGTTAGTACTGAACACATCTTAGCCAAATTTGGAGTACTAATTAGTTAAATGAATAGTACATGATATGTGGAATGTGGGCTCATTTGCTTGAGCAGTGCCATGACAATCAACATTTCTAGTGTGATAGAGGGGCATGCATCCTTGAAAATTATTCTGAGCTAACAACTGTATGTGTGATCATGCAGTTGTCAAGAATCATTAGCTAGAATACTCCTTTGTGCAACAAGGTGGTTTTGGGCTAGGAAGTTTGACTGCAATGAATGTGTGTGAGATGGGACTAGTTTTGAGCTTTTTTTATGACGTCTTGAAAAATGCTCAAACCTGAACAACAGTCATTGAAGTCAGATATCCTTGTTCAAAACCATATTATTGCACAAAGGAGTATTCTAGCTAATGATTCTTGACAGTTGCATGATCACACATACAGTTGTTAACTCAGAATAATTGTCAAGGATGTGAAAATCCATCTCACTTGAAACGTTCATTGCCATGGTAATACACAACCAAACGTGCCCATATTTCACACATCATATACCATTCATTTTTCTAATCAATGCTCCAAATGGTTATATGTTCAATATTAACAGAGATATGGCATATTGGTTATATGGGCATTTTCGAGTAGTGGCTACCTTTAAAGATGAGTCGCTGGTTTAACTAACAAGCAGCTACTTAAATACAGTTTGCTATAATTGTTGAAGTGGCCATTAGTTTATTTCAGTATTAGCAAACACGTCCTTGTCTTCGTGTCTCCAAACATGGATTGTTCTTCCATTATATTACCTGGAAGAGTAATGGAATGTAGGGCTGTCCTTAGCACATACCCTTTTCACTTTCTCTATGAAAAGTCACCCGATTGTTTGCTTTCTTTTCTTCTCAACATGTGTGATGTGCTGAGAATTGCTTTATTAACCAATTAAGGAAACTGCAAGGCTAATTTTATTGCGTTAGGTAAGCATAGTTATGGCTGTGACAGAGTTAGGCAGTAGCTAAGCCGGGGAGTGCTTTAATGTGGACACTTTTCTGTTTTGAGGTATAGTTGAAGCATAGTGATGGAGGTCACCAAATCGACCAGACAAGATGCTTCGAAATGACACTGTTAGAGAGAACAATATGTAATACCATAGGTAGTTTGTTTGGAAGATGATCATTAAATGGACTAATATAATATATAAGTAGAGAAGAAATGATTGTTGCGTGATGTACTTGTTTCTGTTTGGTATCTGCTATGTCGCATATGATCAACTGAAGTCATGCGTTTGTTTAAATGCAAGGAGCATAGTAAACAAAGAAATGAACTAAACATTATGGTAGAAGATATTGACCCTCACATAATAGGTATAACCGAATCATGGGCCACCACTGATATATCAGATGCTGAATTGGGACTAACAGGCTATGTAATGTTCAGGAAAGATAGAATAGGAAGAATGGGAGGTGGAGTTATTTTATATGTTAAAGAATCTATCCAGGCTTATGAAATAACATTAGAAAGAGAAGCAGACTGCAAAGAAGCTGTTTGGTGTAACATAGTTACAGGAAACTCAACGTTAACGGTGGGGTTAGTTTATCTAAGTCCAAACATAAGTGTAGAAGAGAACGAAAAAGTACAAAA

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03637	Mob1_phocein	Mob1/phocein family	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR005301	Family	MOB kinase activator family	Interproscan
IPR036703	Homologous_superfamily	MOB kinase activator superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR22599	MPS ONE BINDER KINASE ACTIVATOR-LIKE MOB	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0001934	Biological Process	positive regulation of protein phosphorylation	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0007165	Biological Process	signal transduction	Interproscan
GO:0030295	Molecular Function	protein kinase activator activity	Interproscan
GO:0035329	Biological Process	hippo signaling	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf2852_8.3 global RNA-seq network