Gene detail

Detailed information of PE_Scaf2346_4.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf2346_4.3	SMALL UBIQUITIN-RELATED MODIFIER	Superscaffold13	21753462	21757781	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf2346_4.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	ULD\|UBL\|SUMO

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF11976	Rad60-SLD	Ubiquitin-2 like Rad60 SUMO-like	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000626	Domain	Ubiquitin-like domain	Interproscan
IPR022617	Domain	Rad60/SUMO-like domain	Interproscan
IPR029071	Homologous_superfamily	Ubiquitin-like domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10562	SMALL UBIQUITIN-RELATED MODIFIER	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0016925	Biological Process	protein sumoylation	Interproscan
GO:0031386	Molecular Function	protein tag activity	Interproscan
GO:0044389	Molecular Function	ubiquitin-like protein ligase binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf2346_4.3 global RNA-seq network