Gene detail

Detailed information of PE_Scaf215_0.5 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf215_0.5	BREAST CANCER ANTI-ESTROGEN RESISTANCE PROTEIN 3 HOMOLOG-LIKE PROTEIN	Superscaffold10	64173196	64198921	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf215_0.5

ATGCTGCATTTGACGGAGGCTGACATTCGGGACATGGGTGTGAAGAACAGTGCCCACCGAGCTCGAATCATCTCCAGTCTTGTGAAACTGCGCCAAAAACTACTGCAACGTCATCCCCGACGCAGTTGTGCTGCGGTTCACTGCGCTCCAGAAATCTACAGAGGTGTGATGCCTCCAGCTGACGTCAACCACTACAGCTATACAACAGTGAACCAGGCGACCTACCAACCACTGGACATGCCACCAGAGACACCTGGTGACCATCTGGTGAACTCTGTGTCGAAGCGAGACATACCGTTCAGTCCCGCCTCCCTGCCCGACCTGTCCCGCTACTTGTGGTACCACGGAACGATCCCGCGGACACAGGCAGAGACCCTGGTGGTGAATGAAGGCACGTTTCTCATCCGCGACTCGATCAGCCAACCCGGGGACTACGTATTGACGGTGTACTGGAAGGGGGCGCCACTTCACTTCATGCTCAACAAACAGGTGCAGACGGACGGAAGACTACTCAAGGTGCAATACCAGTTTGAGGAGGCACTGTTCGATACAGTTCCACAGTTGATACAGTTTTATGTCGACACCAAAGCGCCGGTTTCTGACGCATCAGGTGTGGTACTTTGTCAACCGGTGGAGCGGAGTGGGCCGGTGGAGTACTGCGATGTTCGGTTGGCGGCGTTGGAACAGTCGTTGGATGCGAGGTATCTGTCGCCGAGTGTTAGACCGCAGCGTTCGTCCAGTAACCGCAGTGACAGCCCCCAGACAGACGGACGACTGCGGATGGATGGACAGCCGCGTCGTGTCGGCAGTCAGCCACTGTTGTCACTGGACTACACAGATGCCAGTTTATGTGGGCAGAGGGACAAGTTTGGTAGTCTCCCCTCCATAGCCCCACAGCCTGCTGGGAAGGTCGAGCCACCTCACACGCTACCAAAGACTCTGCAGCATTTCCGGGCCGGCAGCGAACCGATGCTGTCTCCAACATCGGCACTGGAGGTAAAGAAGCAACTGTTTGTTCACAACGCTACTGATCTTGCGGGATCTGATGGCAATCTTACAAAACCCCCGCCAGCCAAGCCTAGCCGGGTACCGACTATTAAGTACAGTGCCAAAACTAATAAACCAGTCGTAGCCATAAGGAACAAATCGCTGTACGAAGACGATGGACGTGACTACAGCGATTACGACCAAGTGAAGTCATGGCCCGCCGCGCTCAAAATATCCATCGATTCCGGTGACACAATGCTAGAAAATGGCAAAACCGCAGATGTGGAAATAGGCGATTATGATGTGCCAAAATCACTCGACGATGATTCTAGTCATTACGATATCCCGAGGTCATCGAAGGAGTCGAGTCCAGTGCACGGGACACACCAAGACAGTACGTGCAATGAACTCCCTGTCAAACTGCCGCGGCAAGTCGTCAAGTTACCAGACGTTGACGAGAAGTCGTACTTTGACATCGAACGTTATATGTCGAGTTTACTGACTCCAAACAATAAACCACTGGAGAGCTCGGCTGTCACTACCATCAGGATGTTGTTATTGGAGTGCGACGCAACACAACTCTCACAACACATCACACACATTGACCTTGACCTCTTGAAGGTCACCGGCAGCCACGACTTCGGCGTTGGCGTTTTCTCCGGTTTGGAATATATGACCTTACCTCAAGGTCATCAGCTGCGACTCGACCTGCTGGAGAGGTTTCACTGCCTCAAGCTGTTCGTAGCATCGACGCTGCTGATGTGTACAAAGTTAGAAGAACGCAGTCAACTTCTGCATCAATGGATCCTCGTGGCATCCCACTTGAAGGGCATCATGGGGAATCTGTTCGGCTTCTCAGCAGTCATGGAGGGCTTGCGACTTGAGCAGATATCCCGTCTGACTCAGACCTGGTCTCGACTGAAGCAGGACTTTGCCGACAGCAATGCATCATTCACGACCCGTCTCCAGCCTCTCCTGCACTCGATGGACGAGGCTGGGAGTATGCTGCCTGTACAAAACATCACCGTGCCGCACATCGTTCCACTCATCCGGCTTCTCATGCGACCTCTGTATGACCTTGAGGCCGCGGTGATGTCATGGGAGGTGACGAGCGCCGACCTTGGGTTTGACATCATGCTCGCTCACCTTGACACGGCACGGATCATCACGGAACACTGCGGGCTGTACCGTGTCACTGCTGCCAGTCTTTTGAAGTCGTTCGCCGTCGATCCACATCTCAGGGACATGTTCTGTACAGAGACGCACATGAAGTTGATGTGGGGCGCAAAGGGGGCGCAAGTGGGTGCCGAGTCACGCTACGCAAAATTTGAGGAGGTCTTGACGGTTCTGTCGGAGCGACTGGAACCGAAGAATTCGGCACCGACGAATCGCGAGACGTCGCTGTGA

Transcript

PE_Scaf215_0.5

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Protein

Gene family

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-	-

Pfam domain

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InterPro

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PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
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KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf215_0.5 global RNA-seq network