Gene detail

Detailed information of PE_Scaf1990_8.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf1990_8.3	F-BOX ONLY PROTEIN 3	Superscaffold9	51053315	51066362	-

Gene Structure

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CDS

Transcript

PE_Scaf1990_8.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04379	DUF525	ApaG domain	Family	Interproscan
PF08755	YccV-like	Hemimethylated DNA-binding protein YccV like	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR007474	Domain	ApaG domain	Interproscan
IPR011722	Domain	Hemimethylated DNA-binding domain	Interproscan
IPR036623	Homologous_superfamily	Hemimethylated DNA-binding domain superfamily	Interproscan
IPR036767	Homologous_superfamily	ApaG domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR14289	F-BOX ONLY PROTEIN 3	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003677	Molecular Function	DNA binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0042645	Cellular Component	mitochondrial nucleoid	Interproscan
GO:0070987	Biological Process	error-free translesion synthesis	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf1990_8.3 global RNA-seq network