Gene detail

Detailed information of PE_Scaf145_9.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf145_9.6	HEME TRANSPORTER HRG1	Superscaffold3	6024054	6029337	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

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PE_Scaf145_9.6

CTAGCCTGCGGCACTGCGGCTGCTTGCACCGAGTCTTGCGGCGAACAAGTCAACAATGGGGGCAAAGTGTGAAATAGGGTTCTCCATTGTCGGCATATTAGTTGGAATATCTGTATTCTTTTGTTTTGGTATTGTCTTTTCCAACTGGGATTGTGCTGCATGGGGTCTCTTGTCAGGTACTGGTAATTTATTGTGCATGTTAAAGCTTTATTTGTTAGTTATACTGTTCCGTATGCAAGCAAGGGCTGGGCTAAACCTGAATAACCCTGGCCCTGCCCTGGCTGGATGTGGCCCCAAGCCAAGGCTGCGGTCTCGTGACATTAATGTAAACAGACTTTTACTCTTGCTTGCTGACCTCTCAACAGTGCTGGTAGTACCCTGGGTATATAAAAAATATGTTTATGACGGTATGGTCAGTATATTATATACTAAATTTAATTATAAGAGAGTGCGTACATTTATTTATTATGAAATTGTTGAAGCCTGAGGCTGAAGGGACAAACGTTGTCGTGGATTGTTGCATATAACTTATAAGGGTACCCATATAAGCTGCCTTGCAAAAGACTGAGTAGATTTAATCCACACCCACCCTACTAAAACCACACTACTGCCTACAGTACTACATTTCTTTTCTTTCCTGTTGCAAAAAGATGTTACAAAAAACAATAACATTTTCAACCAAAAGAAGTGTTTCAAAGAAGTAAATTAGTAATGTGATAGTGCTGGATAACTTTTGCAGGCTTTTTGCTGAAAGTAATTTTTCTGTTATACAAACACTATTTCCACTTGTTCCAAGCCCCAATTGATGATCTAATTAAAGCATATTTTCATCTTATCCATAATGTTGCAGTGTGCTACAACAAAAGATGATAACGTAAATGCAAGATGTACAGAATTATTGCACTACTTTCAAGAGTAAACTATCAAAGATAATATTACGTAACAATAGATCACCCCAATTGACAATATTCTAGTTTTAAAACAGTGAAGAGTTCAATATAAGAATATGCACATGCCAGGAAATGAATTTGATTGGTTGTTTCAGGTGTGTTGGCATCCATCACGCTGTATCTACACATCTGCTTCCTGCATGATCGATGCAAGTCTACGGCGACTCAACTTAGTGGTCTCATGCTCACCGGCTGTATTTTTCAGCTCGCTGGCACTTGTGGATTCGTTGCCTACCTTGTTCTTGCCATATCGGAACACCAGGGTGAGTAGAACATTGTCAGAGACCAAGATATTCATCAAGTTCATAGAGATATGTCAATAATTATCTTTTCAAAACACATTAAACAAGTTTTAAAGTCTCAAGAAGCGTACTGTTTTTTGTTTTGGAATATGTCTGTCAGTGAAGCATTGTTGCTGCACTACAGGTGTGTCACATGATCAGATTCTTGAACCAAGCTGCAGCAGGACAGGTCACATGACCGGTCATATGACATGCCCATAGTGCAAGAACAACACTTTGCTAATAAAAACTGTACAAAGCAAATTTAAAATGTTCAGAAACAAAATATTTGTTAACTTACTATGAAAAGAAATCTTTGAAAAAAATGCCAGGATCATACTCGAATGAAAACATATTCTTTTTGCCTAAAGGAAATAAAAACAAGGCATTAGCTAAAATCAGTTTTCCATGTGTACAGAAAGTTTAATATTGCATGTAACATTCGAGAACATTAAAAAAATACAGAAAAATACATTTGTAGCATAAATTCGATTTTAAACTGTGTAGCGATTCCCGCGGAAAATAAAAATTTAATGAGCTAGGCGATCACGTGGTATCTTAATGTCACACATGACTCACACTCGCAGCAGACCGACCCTTTCTATGCATTCAGAGCATGTTTACATGGATAATGTTGGGGTCGAAACGAGCGTCAGAATGAGTTGTTATGCAATAATCCGATGTAATACAAACACTAGTCATCATAGAGGAACAAGCAGTTATCTTACGGTTCCACATGAATTCAATTTTATTTAAAACAATGATTGCGAATGAGCCTACAAGTCGACTAGGTTTCGCCAAGCTTGGCCCTGGGCTCGTTTTCAGAATAATTATATCGAATGCAACCAACGGGAGATAATGTACACCAATATACATACATAGCAAACATATATCGTATCCTGCTACAGAAAGTAACGTGTAAAATCTCATAATATCACTAGAATATCGATGTATGAAGGAGGAGTTGTACAATTTATCATAACAACTGAAATCAGTCAGCGAATTTCTGTCGGACTTGATAGCTCAGTTGGTAAACGCGTTGGTTCCTTTGCGTCTGTTTTACAATCGGGCGACGCCGGTTCAATCCTGACAGCATGTAAACTATTGATTTTCTTTACACTTTTGTTGTTGATGTTTTCACGAAGTAATATAAACCAAATCATTTAGTATACTATGATGCACTGTTTGTAAATATTTATATATATTTTTGTAGTAATTATTTATTCGCCACAAAAATGAAAATATGGTCATTATATACAACGATGTTTCTAAATTGCATTTATCCAGACAGATCACAATCTGTTTTCACATATATAATTACAATATATTACTGTACAATATATTTACAATTAATAAATTAGATATCCATTACATTATATTTGTTTGGATAATATAAAATTTAGAAACATCGTTATATAATGACCATATTAAATTTTTTGTGGCGAATAAATAATTACTACAAAATAAAAATTATTTACAAACAGTGCATCATAGTGTACTAAATGATTTGGTTTATATTACTTCATGAAAACATCAAAAAAAAGTGTAAAGAAAATCAATAGTTTGCATGCTGTCAGGATTGAACCAGCGTCGCCCGATTGTAAAATGAATGACAAGTAACCAACGCGCCTACCCACTGAGCTAGCGGGACCAGCGGAAACTCTCTGATTTAAGTTGTTATGGTAAATTGTACAACTCCTTCATATATCGATATTCTAGTGATATTATGAGATTATACACGTTACTTTATGTAGCTGGATACAATATATGTTTGCTATGTATGTTTATTGGTGTAGATTATTTCCCGTTGGTTGCATTCGATATAATTATTCTGAAAACGAGCCCAAGCTCGGCGAAACCTAGTCGACTTGTAGGCCCATTCGCATACGTTGTCTTGAATAAAATTGGATTCATGTGAAACCGTAAGATAACTGCTTGTTCCTCTATGATGACTAGTGTTTGTATTACGTCGGAAAATTGCACAATAACTCATTCTGATGCTCGTTTCGACCCAAAAGCTATACTTGTAAACATGCTCTGAATGCATGGAAAGGGTCGGCCTGATGCGAGTTTGAGTCATAAGTGACGTCACATCTCGGCATCCTGAAAAGCGCGCCAAAAATATGCATATTCGAAAATGTCCGGATGTACAGCATAAAATGTGGAATTTCTAATTCATTTAATTTTTTTGATTTTTTTTGCTTGGTGGACGTGGAAATAGATAGCAGGATGTAATATAACATAAATTCAAGCAATAGATGTTTTTATTCCCTTAATGCTTCAAACACATTTGCTGACATTAACTGATCTAAAGTTTCTCGTTATTCTTATAATCCGTGAGTTGTTATCAAATAATCAACGTAGAATACCTAAAGTTCTACAACACAAAGGAGTCTTTTTGACCTGAATACCTGTAGACAAGACCTTGCACTACATCTTGACATATGTACACCAGTAAACGTTGCCTTTGTTTCCCCTAGGCCTGGTGATCAGGGGTCGGGGTTACTACCTGTCGTGTGTTTGGTGCTTCATGACCTGGAAGTGGGCGTTCCTCCAGTTCTACTTCGCACGTCGCTACAAGCGGTGCTTCGAGAAGGAGACCGGCATCTCCAGCGATGTGCCCTACATCAAGATCTAGGCATGCCAGAGAGAGGCAGAGGACCTCGTGAGGAACTGACAGGGCAAAGACAGATTTCTTGTTGGGAAAGAGGCTCAGTGTGTAATAATGGGTATTATTACAGTATTACCCCCCTGGTACCTTAATACCAACCCTGAACCTGTACGGAAGTGTCTCATTTGGAAGGTATTTGTGACAGCCATGGTAGTGTTTCTCTTTTTAAATAAATGCTACAAAATATATAATTACTAACATACTATACAGTTAATTGTTTTTTAATAATGAAATTTGATCAATGATTGTTTCTCGTGACATGGGATGGCTTCCTCAAACTACATGAAACACTTAATATTATGCAGAATATTGCAAATAATTTGACATTCAGACATATATTTTTTTTTTTCATGTAACGTTATCTTAATAGACATTGTTGATGTGTTAATTTGCTATATTTCTGATGAGTCGTGCTTTTCTAGTAACCTGAAAACTATAGTTGTTGCAAAATATATCTTCCTACAATCCATTGGTTATTTTATGATGCCTGCACTTATGACAACTTCAGAGTGATTACGAGTATGGCAACAGGACCTAAGTGTATTTCCAATCAGTTGCAGAAGTGCTGTGTGTTATGATTATCCATCTATATAAACAATTATGTGCATTTATTATTCAATGTTATGTTTGTGTAACAAGTTATTCTGATACAACTTGTATGGATAGGGTGAACGGAGGGTTTGATGTGGTTGAATTGTATAGCATGAATTGTAGTTATGTGCCAACGTGTTAACCTGACTTATGTTAAAAGAAGGCATCATTCGACTGCCGAGATAAATGGTATACCTAGCTATGCTATAACCTAGTTTTTACATAGTACTGATAAATTGTGATTGACAAATCATTATCCCTTATCATAAACATATAATATAGACTACCCAGGTAGGGACTAATGAATGTGGATTGTTACATTGCAACGTTGAATGTTGTTGGAACAAATTTGTGGCACTGTTTGTAACAGTCAAGAATGCTATTGCATAGTTGTTTATTGCTCCAATTTATATATACTTGATACATTCATTTAATAAATTGTTATTTCAAAATGTTTTTGTTGCATTTAAATGTTGGTGTATTAAAGACAGTCGATCCCCTTAGCTT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF16954	HRG	Haem-transporter, endosomal/lysosomal, haem-responsive gene	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR026218	Family	Heme transporter HRG	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR31525	HEME TRANSPORTER HRG1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005765	Cellular Component	lysosomal membrane	Interproscan
GO:0005886	Cellular Component	plasma membrane	Interproscan
GO:0015232	Molecular Function	heme transmembrane transporter activity	Interproscan
GO:0015886	Biological Process	heme transport	Interproscan
GO:0020037	Molecular Function	heme binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf145_9.6 global RNA-seq network