Gene detail

Detailed information of PE_Scaf1420_1.8 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf1420_1.8	DISKS LARGE-ASSOCIATED PROTEIN DAP SAP90/PSD-95-ASSOCIATED PROTEIN	Superscaffold3	48316780	48322964	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf1420_1.8

TTGAGACGGCCGTACCTGATGAAGGTGACGACTAACCCTAGATCCAGCTGTCAGTTCTCTGGGTTAAACTACCCAACTGTCACTGCAATTACAGTAGACTGAAAAATCTAGATTCTGGTTGCACCATCTGAAATGCAGTGTCTGTTTGATTGCCGAGTGTCCGTGCTACACCGGAAAGTACTAATTAAGACACACAGTCTGTACTATGTGGTTGGTTGAGCACAGGTTGTCTACAAGGAACACTGAATGTTTGGCTCAAGTTTCTCTGTAGTTTTAAACAGATACACGAATCTCCTTCAGTGTGACCAATTTCACATGTAAATCACAGTGATTTCAATATGATTATGACCATAGCCTGGATGCAGTTGATAGTTTTACACGGTTACTTGTTGGTCCAAAATGCCAGCTGATCAGTGCTGCCATCTGGTGAATGGTGCAGAATTAAAACAAATAGTTTGTTTTCTATTGTCTGCATTCACAGGCTGGGCTGTGATGGCTAGACAGATGTGTTGCGACAACAGTATTTCTGTGTTTAGCAAGCACTAACAATATAGGGTAGAGGGGTAGTTGAGGTGGTGTTGAACAGTTTGTACTAGTATTGCCCCATGTGTACAGAGAAGTGGCACTTTCTTAATATTGTGAATGTCCTCTGTAAATCCTGGCTATGTGCTGTTAACTATGCTCCTCTCCGTCATCTATTGTTGAAGTTGCCACCTAACACTGACCCCGTGGCATCTGTGCTTCAGCGGCAGGGAAGATGCGAGCAACTGTCGGCAAGGCAAGGCTGCTGACAAACAAGAAGTTCAAACAGTTTGACGGCCTGTGTCGACAGCAGATGGTAGGTCTTCCTGGAAGGTGGTCGCGTCAAGTGGTGACCACTTTTAATCTGCAGTGACATGTCCTAGCAATATGACAGGAAACACCAAGTTGAGTGAACAAACTAAACAATGTCGGCAATATGTGTACATCGTCTCGTAAACTTTCAATTATAACTTAATAATAATTACTAAATGTTGGCACTTTGCTGCTTTTGAAAGTGCAGTATTTGTAGTGTCCACAGTCACTCAGACTGTCCAATCACATCAATTTATCAAAACAGATTTGTATTCTCAACATTTGAATCATAAATTCACTTAAAACTTTCTTAAGTACACCGCTGTCAGTTCGTAATTTTGTAGTATAGCGCACTCAATACTTCTAATGTGCTCAATAGATATTTTGAAGGTACCTGCCAAATTGTGTTTAATAAGCAAAAAAGTTTGCAAATTGAATGTTGCGCCCTCGAAATGTTCAAGTTGTAAACAAAGCATCACCCTTTATTGGCAGTAATATGGAGGCAGGTGAGGCTAACCGCAATAGCCCTTTCACTTGGTTTCCGCACAATCAAGACCTGATTCTGTGTACTTCCTGCTAATGAAATGTTACCACCCCTGACATGAGAGGATGCAGGGCTACGGAGCAGACAGCCTTGCTGTAGTGCATAATACAACTTCAGTCCTAGGCTGCTGCTAATAACCCTATTCAACTTGTGGTGCTGATGACATTAACAACACAGCTCAGTCATATACACGTGTCAATGACATAGTTGCCTACTTTGTCACCAGGAGCAGAACGACAACGAGAAGTTCAAGACAACGTCGCAGGACCTCGAGGGATTTTGGGATATGGTCCTACTGCAGGTCGACGACGTCTACTCAATGTTTGCTGAGATAGAAACACTTCGTCGTAACGGCTGGACACACACAGAGGATGCAACACTGGTGGGTCTGACAGGCATGTGTGTGTGTGCATGTGTGCGTGTATATGCATGTGTGTGGTGTGGGTGGTTCGTGTGTGTGTGGTACGTGTGGTGTGTGGTGTATGTATGTAATTGTGCATGCACGTGTGCCTGTGTGTGCGTGTGTATCTGTCTGTGTCTGTCTGTGTGTGTGTCTGTGTGCGTGTGTGTCTGTGTGCATTATGTGTGTGTGTATATGTGTGCGTGTAATCTGTGTATATGTGTGTGTCTGTGTGCGTATGTGCATGTGTGTCGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGCATGTATGTGCATGTGTGTTGTGTATGTGTGTAAACTGTCACTGCTGGATGGTGGTTCCAGTATTTTATGTCGGTGTATATGCCAAGTCTTAATTTGGACTGATTATATTTTAAGGCAGTATTTAGTTTTTTAAATTGGAAGTTTTTAATGGCAATGCGATAATTTGACAAAGGTGAAATGGACTGCATATCACATGTATCAGTTTAATCATAAAATAAATAAATAGCTCATAGAGTGATCCAGCAACATTTATTTAGTATTGAATTTATCATTTTTTAAGTGTTTTCCTTAAATCAGACCAGCCTGACTCACTTGTGGTTTCATAATCTTGAGTAATTTCACTGGAGATGTTATTACAATCTGGGATGTTACAATATAATGTTACATTTGTTGCAGAGATCCACACCGAGCATGCTCAGTGACCCCGGGTCAGTCAAGTCCAAGAGTTCAGGTAAGGTCATACTCATGACATGTGGATTGTGGTGACAGTACACAAGTTTTGTCCTGATATGTGGTCTGTCATACTTGCCTCTGGGTCATACACCCAAAGTTCATTTCCAAATTTATTCAGGACAATATTCTTGATACACAAAAGCAACATCGCCTGGGGAATAAGTGAGTGGTGTTAGTCATTGAAGCCCTGGGGCAATATACAGTGTAGTAAGGGTAACTGCCCTGTTTCACCAGCTTTCATGTTTTTGTTGATTCATCATTGAATGGTTATTTACTGTAACTGTCAATAATCAAGTTACATTGATGTTTTTAACTGTCAATAATCAAGTCACATTGATGTTAACTGTCAATAATCAAGTTACATTGATGTTAACTGTCAATAATCAAGTTACATTTATGTTAACTGTCAATAATCAAGTTACATTGATGTTAACTGTCAATAATCAAGTTACATTGATGTTATCTGCATAATAGTCTTAATTTATGCACCTTTGTTTCAGGTGATAAAGTGAAATTGACAAAATCTAAAGAAAGCAACTCGACGCGAGCAACAAAGAAGCCATCGCAGCAGTTGTCAAGAAACGCCCAGAGGGACGAGGCTCGCAAGCGCCTCCTACTGGCAAAACGTGCGGGCCGCCAGCGCAAGGCGTCACACAGCGAGACAGAGGTGGAGATATTTGTGTCGTAGACCATGATTTGTGACCCGGGTTGTGTTGGCCGGTGCAGACGGGCTCTGCTGTCATCAATCGTGACTGTTGAGAACCACGCAAGCAGAAGAGGGACATTAAAGTTTCTGCAGTCACGCTGATGCAGAGGATTTCCTGAACACGGGTGGACACTGACTGAACTCTGTCACCCGGTACAGCTGATACCAACTCATGTCACACAACTCACATGACGGTTGTCATGATGATGTCACTAGGCAATGACATGGGACCTGTCTATACACACAGCCCCTCAAGGCTGTGAGATAGTATACACACAGCCCCTCAAGGCTGTGAGATAGTATAAACACTGCCTCGCAAAGGTGGTGGTTTCCATCCACGTCTACCGGTATAATATGGGTCTCATGTGCAGCACGAAAACCTCGACTGTCGTATCGATGCAATGTATTACCAACCGTGACTGTGTCATATTCTGGTGATGACTGTACACCAAGTGTGAAGAAGACACTGATTGTCTTCCGTTGAGTTTTTATTTTATTTCAAGTATAGGACATTACTGCTGTTTTGTTTTAACCATCTGTGATATGCCTGTCAATGTTACACCCGGCTTGCTGACAAATGCATGTCAGCGCTTTTACATGTAAATGTTTTAGTTTATTCAGATGCCATTTATCCAGATCACATTCAAATACAATGTTTTGGGGTCGCATTCAGATGTTTTGGTGATACATTTGTAAATGTGTTGTTTATTTCAAATGTTTTTATATCAAATTAGTAAATGTAGGTTTTTATCCACAATTAATAAGAATCAAACAACTATGCACCTCACACAGCAGTCATGTAAAATGTGGAAAAGTTAACCCGAAACATTCAAACAGTTGTCTGCATTTAAAAAATGTGGGATTTCATGCTAGTGTTTAGGGTGTGCATGCAAATACACTGAAAATGTCATGGCTTTATTAACAAGCCTGGTTGGCACTGTGCAGTTTGCCAGAGAAGTGCGATGTGCTTTCTGTGCTCACAGAGAAGGGACCGTGTGGTTACTGCACATGGAGGGAGCTGTTTGGGGACTGCCCAAGGCAACAACTTTCTTATGTTTACTCTGCTTCATGCACTGATAACTCTGCAGACCACCAGTACATGTAGTGAAGGGTTTACCATACATAATAGAGAAATATACTGTGTTTTAAAGTATTAAGCACCATGATGCCGGCTCCTTGTTGGTGTCTGGATGGTCTTGTAAAATAATGTTTACACATGCAGTCATGGAACTTGCCGTTTAACCAACACAGACTATTTCTTGTATGTAATTTCATATGCATGAGATTGGATCTCCTTCCTAGGCACTTTGTATTTTTGTAATGACAAAATGTCCGTTGAAGTGCCATGCCCCTCACGATGTACTGCAAGTAAATCAAGTACTTATTCTCACCATGTTACATTTCACGTTAGTTCGCACTATGTATGCGTTACCTGGTATATTACTAACCAATTGTGGTATATACAGATAAATAATTATGACCAACACACACCAATAACAACGATATACTTGGGAATACCTAGGTAATACAGTTATTTTAAAATATATAATGTCAAATGTTTTAAGCTGTGCCAAGTCTGTAAATAATGCTGAAGAAACAAGAATATTTAAGTTGACAAGATTATTTTTGTACATTTGTATGTGGAAGTTTTACACAAACGTCGCAGCTGCCTAGATTGAGGCAACTTCATTGTCACCAACTAGACTGTTTGGCAGCTGTTTATACTGTAACAGCTGAATTATGACGGGCTTCAATTAATTAATGCAAACACTACTCTGAAATACGGGT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03359	GKAP	Guanylate-kinase-associated protein (GKAP) protein	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR005026	Family	SAPAP family	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12353	DISKS LARGE-ASSOCIATED PROTEIN DAP SAP90/PSD-95-ASSOCIATED PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0023052	Biological Process	signaling	Interproscan
GO:0060090	Molecular Function	molecular adaptor activity	Interproscan
GO:0098962	Biological Process	regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity	Interproscan
GO:0098978	Cellular Component	glutamatergic synapse	Interproscan
GO:0099572	Cellular Component	postsynaptic specialization	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf1420_1.8 global RNA-seq network