Gene detail

Detailed information of PE_Scaf12423_13.13 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12423_13.13	PROTEASOME SUBUNIT ALPHA/BETA	Superscaffold2	6986814	6993618	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf12423_13.13

CCCAATCTGACATACAGACAGACGACATCCGGAAAGCTTAAACTTTCTCATATCATATTATCACATACAATAAACGTTTGAAAATGGAATGTATAATTGGTATACAAGGCAAAGATTTTGTTGTGATCGCCACAGATACAACAGCAGCCAGGAGCATAGTTGCCATGAAAGCAGGTAGTTGCACAAAAGTGGACGACGATTACAGCGTGGCGTTGCTAGTAGAATCAAGAAATTCAAGAATGACTTGCATGTTGTTGGTTGAACCACATTATGGCACATAGATGCTGTTAAATACATACATCAAAGCTACGAGTATTAAAAATAAAATAGGTGTCGCATATGCAACTGCAGTTAAAGTTAAACTTTTGAAGTAAGTAAATGTCACCTTGATTGGCTAGCAGTATCTGAAATTAGCAAAAAAATGAACTGGCCCAGATCAATTTTGAACTGACCCTACTGAATTTGAACTGGCCCTAATTTGAATTTTACATGTAAGTACATAAGAGGGAGCCCGGCTAGTGTAGTGGTAGCACATCCGCTTGGCATGCCAACACTCTGAGTTCAAAACCCGGACCGGGCAGGCATGATATTTGGTGTAAAAACCTGGCTCTCAACATTGGACTCGACACGGAGATCATGTTAATGTCGGTCCAGTCTCAATTTGGGACGTAAAAAAACTACTGAGGACGACAAGCACCCTGGCAGTGACCACCCTCAGTGCCAGCATATAAAGGTCGGTTTTTCAGATTCAGACTGTTTATTACCAAGTAGCATTTAAAATGTAATCAATACAAAACAGTACAGCATTTAGTGATAATGTCCTGAAACAGACTGCCTGGGGTAATTAGTTGAATGAGACCTCATAAGACCATTACATTGTAACCACAATAATACAGACTAGTCAGTTAATAGAACCCTGCCGAGCGCTGGAAAAAGCTAGAACTAGATATTAAACAATACTAATTTTAACATTAACTATATGTACACTACCATAATAGATCTAAGTTACACTAACATAATATAACTTTGCATTGCATATATATGTATGCATAAATAATTAAAATTAGGCCTATTTCCATTGTTCAAAGTATGTAAGTGGAGCAGCTAGTCCGCCATTCTGGAGGCAGGCAAAGCCAGAACATATGCACTGATGCACGTGCTAGCCTCCCAAATGGCGGATAAAAACTCCAATTGTAGACTGCAATGATCTCGCTCAGTGACGCCTCCTGTCTAAATGTAGGCTCCTTGGTGTCAACCGACGTAAACAGGGACGCGGGCGGAAGGCGCTAACATAAACTGTTTTGCGATCGTTGTCTGGCTGTCCGCTAAGCGCATTGAAGACATGTTGCTAATTAAATGTAATTGTTACATCGTTATAACACGCATAAATGTACATATTCTGGTTTCGAACATAAAACTTGAAGAAATAATAACAGCCTAGGTTACGCTGGCTCAAATTGATATAGCCCGTGTTTCGTAGTTGTAACAAATTCCATTGGATGGCTAGCTAAAATGAAACGGCATCAGTGATTTGAACAGTCATAATTGTTAATGATTGCTTGTGTAAATTACATTTGTCAATGTATATAGTAAGCACTGCTGCATGAGAAACAACCAGACATTTATGTTATTGTGTGACAGGAATTATTTTATTATCTAAATTGATTATGTACGGTTGTTATTGTGTTGCAAATATTGCACAAATACATTTTTTAGAAAAGTTAATCACAGTAAAACAGTATTATTTAGATGCATAACATTAAGATATTTTAAATATTTGACACGTTTTATTTTTCAAAGTTTTATTTTTCTGATCAGGGATTGGCTTCTTTTTTCACTTTTAAACAGAAAATGGTACTTTTAGTTTATTTATATATTTTATGATTGGACACACTAAGTATGATTACAAAAATTTACCATACTTATATATATATACTCATCGTTGCATGTCATATCGCGCATCCGATCGTGCGTTCGATCGCGTGCCCGACTGGCAAAAATTTGATCCTGGGTGAGGCCCTGGTAAGCACACTATAATAACAAAGTGCAAAATTATAAAGTCATATTTTTAATTACCCAACTAGCCTATAATAATAATAAATATTGTTCCAAATGTATGTCCTGATTGTTCAAACTCTGCCCAAAGCTAGTACTTGTATTTAACTGTATTAGTGTTGCACTCATATGAATGTATGTTGTACATTTGCCACTTCTGTTTACGGGTTTCCCGGTTTATTCGCTAGGTGACACTACCAAACTACGTTGCATTCACCTTGCCGATGTTGGTCACGTTACGTAATACCCGTTTGTGACCTGTCAAATTTAGATTTAGGCCGTATTTATTTGTAGAAAAAATTATAAAAAGTTGCCTATCTCTGACCTACAACCGTGACAACTTCCAAACACCGTAAAATTTTGTCCAAAGGATGCGGCAAAACTATGAAAAATGGCATCCAGTCTGACTCTTGAAAAAGTGCACTGCCTGTGGCGATGCCACAGATGTTTAGACTTGGCATTCATTGGCTTTCCTATTGAATACAACCGTTTGCATGATAAGAGTTCAGTTTTGACGAACTATTGTTGAATTATTTCCAAAGTTGCGTTTACCATCTGCTATAACTGAGTCGGGTCTAAGAATTGTAACAAACTATGCATTGGATGCAGCCTAGCCATTTCCGCCGAGATATATCGGTGACGTTTGTGAACCGGCGGTGTCTGGGTGATAACTTAAACATTTTGGCGAATTGAATCGGTGGGATGGTTTTTGAATCAGCGGCCGCCGAATCAAAGTCCTTTTTGAATACTGGCTAGATATGAACACAATTATAAATGTAGTGACAGAGTTACAGACAGTGCAGTTGTTTATTTTGTTCCTTGTAGGACTAATAAAATGCTTAAAATAAATAATGAGTTTATTGGGTTTTTAGGCACCCATATTTTATTGTTTTTTTTTGCATTTGCTTTGCCTTCTGCCTTGACTTTGTTGTTATAACGGTATTTTTGTTTAAATTTGATACTCCGTCCTTACTGCGTTAATTCTGTAATTAAATTTAGTTCAATCCAGATCTTCCCAGCCACTTTTACATTATAAAAATATTACATCTTAGTGCACTTTTGTGATTTAATTAGCATCCCAGTTTGCACCAGTTGGGTCTAGAGAGTCAATGGCACCACATTAAAAATAATAAAAAAATACATAAATAATGTAATTTTCTAAGTGTACTTAAACTGAAATTGACTGAATGTTAAAACATTGTGTGTCTTATTTGTAGATCATGATAAAAGTCTTCAGCTGAGTAACAACCTGGTTCTGGCAGCTGTTGGGGAGGCTGGGGATGTAGTCAACTTCTCAGAGTACATAGCCAAGAACATCCAGCTGTATAAGATGAGGAATGGTGAGGCCCTCTCTTGATCTTGTAAAAGTAACGGAACGAAAGTAACACATCAAGAGATTAATTTTACAAATAAACAAACATGGTTAACTGGATTAATTTTAACATCTTAGGCAGTTTTCACATAATTTGTTTTTTTTCATTTTCAACACATCTAAACCTCAAAAATTATTTTTTTTATTAAATTTTCCGAACAGTTCTGAATTTATGCTTTCAACATCATAAACATTTTATTTTCCAAACGTTCTCAAACATTTATGCTTTTCAATGTCATAAAAATTAAATTTTCAAACAGTTATGCTTTTAAACATCTTGAAAATCACACTCCTGCCATTCTCTGAACAGTTCTCAGCATTTTATGATTTAAATAAACTGTTTCTTTTTGTCTGTTACTTTCTTTCCTCTTACTTTTTGTTTGTTACTTTCTTTCCTCTTACTTATTGTCTGTTACCTTTTTCCATTATTTCCTACATCTGCTGTGAATAGGAGTTTTGTTGAAGCGTCATTGTGCCTACCATGATGTAATCTGTTTGTTGGCTGGCAAAACATTCACAACATATTACATAACTTCAACTATGAAAGTATTAATACTCATGAGTCGTTATAAATAAAGCAGCTAGATGTTTCACCATCATAGTCAACTTTGTTTGGTGTGTCACGGTGATCAAAATGTCACGGTGATCAAAACACAGTTTATTTATGGGTTCAAACTTAAGACACTACCTGGAATTTTCAAGAAATGTGAGCATGTATTCAAAAGAAACTGGCTGGCCGCTTTGTGGGAATAGCAGTAGAGATGAGAGCTAGAGATACAGACATTGTTGTTTATCATGTAGAGGGTATTTGACACATTTGTAGGGTATGAATTGTCCCCACATGCTGCTGCCAACTTCACACGCAGGAATCTGGCAGAGTCACTCAGGAGTAGGGTAAGTTCATTCATTCGTCATACAGGAGCAGGGTGAATTAATTCATACACCACTCTGAAGTAAGCTGAGTTTGTTCATATAAGTCTGCAGAGCAGATCGAGTTCATTCATACTTCACTCCCGAGTAAGATATTAAATTCATATATATATATATATAAGGTACAAGACAGTTTGCAATGGACAAACGAAAGATCTTAGCAAGGCATATTTGTGAAGTAAACAACACCTGGGAGAAACTAAGGAGAGTTCATTCATACATCACTCCTCCAGAGTACACCAAGTTTATTCATATATCACTCCACCCCCGTCTCCATGGTAAAGAGAATTCATTCATACATCATTCTGGAACTAGGTTAGTTCATTCTGACCATCCATAAGATATAATGTAATCACATAATTTTTATGCATTTTTTATAGTTGTTAATGTGTCAGACTTAAGTTAATCATTGATGTGTTGTAGACACCTTACATGGTAAATATGTTGATGGCCGGCTATGACGAACAGAGCGGCCCCGTGCTCTACTTCATGGACTACTTGGCCGCACTTGTAAAGGTGCCCTTTGGTGCCCACGGCTACGGTTCTTTCTTCTCCCTAGGTATCATGGACAGATATTACAAGCCAGGTATGTCAAAACGTACAAAATATTTCATGATCAAGTAACATTTTATCAAAGGTACGT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00227	Proteasome	Proteasome subunit	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001353	Family	Proteasome, subunit alpha/beta	Interproscan
IPR016050	Conserved_site	Proteasome beta-type subunit, conserved site	Interproscan
IPR023333	Family	Proteasome B-type subunit	Interproscan
IPR029055	Homologous_superfamily	Nucleophile aminohydrolases, N-terminal	Interproscan
IPR035206	Family	Proteasome subunit beta 2	Interproscan
IPR050115	Family	Proteasome subunit alpha	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11599	PROTEASOME SUBUNIT ALPHA/BETA	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0005839	Cellular Component	proteasome core complex	Interproscan
GO:0010498	Biological Process	proteasomal protein catabolic process	Interproscan
GO:0019774	Cellular Component	proteasome core complex, beta-subunit complex	Interproscan
GO:0051603	Biological Process	proteolysis involved in protein catabolic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12423_13.13 global RNA-seq network