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Detailed information of PE_Scaf12422_0.6 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12422_0.6	DNA POLYMERASE ALPHA CATALYTIC SUBUNIT	Superscaffold10	44775316	44791680	+

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CDS

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PE_Scaf12422_0.6

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00136	DNA_pol_B	DNA polymerase family B	Family	Interproscan
PF08996	zf-DNA_Pol	DNA Polymerase alpha zinc finger	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006134	Domain	DNA-directed DNA polymerase, family B, multifunctional domain	Interproscan
IPR015088	Domain	Zinc finger, DNA-directed DNA polymerase, family B, alpha	Interproscan
IPR017964	Conserved_site	DNA-directed DNA polymerase, family B, conserved site	Interproscan
IPR023211	Homologous_superfamily	DNA polymerase, palm domain superfamily	Interproscan
IPR038256	Homologous_superfamily	DNA polymerase alpha, zinc finger domain superfamily	Interproscan
IPR042087	Homologous_superfamily	DNA polymerase family B, thumb domain	Interproscan
IPR043502	Homologous_superfamily	DNA/RNA polymerase superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45861	DNA POLYMERASE ALPHA CATALYTIC SUBUNIT	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000166	Molecular Function	nucleotide binding	Interproscan
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003677	Molecular Function	DNA binding	Interproscan
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GO:0003688	Molecular Function	DNA replication origin binding	Interproscan
GO:0003697	Molecular Function	single-stranded DNA binding	Interproscan
GO:0003887	Molecular Function	DNA-directed DNA polymerase activity	Interproscan
GO:0005658	Cellular Component	alpha DNA polymerase:primase complex	Interproscan
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KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12422_0.6 global RNA-seq network