Gene detail

Detailed information of PE_Scaf12378_2.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12378_2.2	-	Superscaffold10	29348641	29370871	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf12378_2.2

ATGTGTGCAGTGCGTCTCAACGTAAGTAAGACCCGCGCTGGGAGCGATCCGTTGTTTGCAGGAAGCAAAGAAACGTCTGTTCTGTTCATCTTTCCCAGATGGACTGAAACTGAGAATCCACAAACTGCTCATGTTGTGTCACTGAACATGGCAGAACTTGCATTTTCGAAGTTCATGGTCCTATGTGAAAGAGTCACTGGGCATGACGAGGAGGTCCTAACGCTAATAAAAAAACGCCACCAGAGGGCTAAGCCTGATTTCATCCAATCAGACGGCTTTCTGAAATTGCTACAGCACACAGCCGAGTTGATCACCAAGGATGTCATCAACAAATATGTGCACATCAAAGATTTACTGACTGAACTGAAGGCATACCAGGACCAGCCTGCGAAGCCCAGCCGGTTAAGTAAGATTCATGCTGAAACTCACACTGATAGTTCAGCCAGAAAGCGAATGTTTGATTCCGATACAGACAGTATTCCAGACCAGAAGCGACACCACGCCGATGTGTGTAAAGACCTGGACGAAAACAGCAAAGACAGTAACACGAACGAGAGAACCTCAGAGGGACAGAGACAAAACAAAAATAATCATGAAGGAAATAACGACTCAAACGCCAGACTTGTCAACCTGGTGGAAAACGTTGAAAAATCGAGTGCCGCAAATGGGGAATCGGTGATAGAAAAGCGGAAACATGATGTCTCGTCGGTCGAATGCGTGACGAGTAAACGGTGCAAAACATCCGGGGCTGGCGATGTTGAAATAACGGAAACAAATGGGGGAGATGGTTTGGGAAACAGGAGGAGTTCGACAGAAGGTGCATTGGACACAGGGGATATGTGTCGGTCAAAGGAGGGGACGGACAGTTCGGCAGGAAAGGCAAATGGGTCAGAGAGACAGATCGTCAAGCTCGAGGGTCTCTTGAAGGAGATCAGTAAGCGAATCAGGAAGTTGGAGGAGAAAGATATATCACTGGATGAGATGGAGGATGACTCGGCCTACACACTCGTGGAGCGCTACAAGGCGAAATTTGTCAAGGTGTGGAACAAGCTGTGCAACATCAAAGGACGTGCACCAACGACGGGTCGACCCATCGAGAGAAAATTCCACTTTGAAGGTACCCGGTATCCAGAGGTGAATAAACGCATTGAACGGTTCATAAACCAGCACCGGATATTCCCAGACTTCCACGACATAGTCGAGATTGTGACTCGCAGCAACATGAAGCATTGTCTACGTCTAGGGAGGAAATCAATTAACGTCATTGCGCGAGAGGCATTCATCGATGTTGGCAACCAGTTACAGGAGAGGCGCATCAGAGACTTCCATGGCAACTTTGGCTGTCACCTCACGGAATCATACAGGGAACGGAATGACCCAGCACTTTATGACAAGGAGTTGCACGCAAAGTTGGACTGCAACAAAGTTCAATGGAAGTCAAGCTTGGATGAGGTGATAAACAAGTTTGCGAAACAGCAAGAGATGGGAGTCGATATGTCAGAAGATGAGGAGGAAGAGGAGAAGGCTGGCAGTGATGAGGAGTTGCTGCCTGAAAGAGCTGATGAGGAGGAGGGAAAGAGGGAGACGTCTGGACTGAAGGATGGGGACAGGGAGGAGAAAGTGGGTGATGAGGATGATGAAAAGAAGGATGAAGAGGAGAGTAGGACAAAGAAATGGGAAGGAAAAAAGGATTCAGAGGAAAACGAAAGTGAAAGAGAACAAGTAGAAAGGAATGAGAAGGAAGAGGAACCAAGAGAGGAGGATGGGAAGTCCAGCGTTGTTGATGACAGCTGCAAGGAAGACATAGGAAAGAACAAATGCAAAGGAAGCAGCATGCCAGAGATAGAGGGGGAGGATATCTCGTCATTTTCCCATCGAGCTTCTGATACAGCAGTTTACACGGAAGTGAGGAGTGTGGACAGAGAAGTTGTCAAGGAGACGTCGTCTTCACACATTGCCACTGATGGCAGCACTGGTAGTTGCAACAAATGTGAACATCTTACACCAGACAACAGGGATGGTAATAATGTGTGTGACGGGAATACAAACACGAGAGAGTGGCACAACACAGACGATGATAGCAACAGCTTCAACAGCTCTGATATGAACATTGTGGAGCGAGACTACAGCAATGACTCAAGGAAACAAGACGACAGCAACGACTCGAAGAAACACGATGACATACAGTGCTACAATTTATCGTCTTCATCGTCATCAGCAACCCCGTCTTCGTCGGAAGTCGACAGTTCATCGTCGGACGAGGGCAGTAACTCGCGACACAAGATGAAAGCACGCTCTCCCGATCCGTCCCATGGGAGAAAGTCTGTCACAGACTTTGCTGGTGTCATTGACAAGGAGAAATTAAAAGAAGTAGAATCAAGAAATGAGGAGAAAGATGCAAATATTGATCTTGACACTAACGACAGGAATGTGGACCGAAGGGATAGTCAGACTGATGTACTGATAATGGATGAACATGAGGACCTGCCCCACTCGCACGGCATATTTTCTCCGTCGAAATTAAAGATTAAATCACAGCCATTCCACCTGCTGTCATTTCCTGGTCTGCGCAGTGATTCTCCAATCATCATTGATCAAGACGACAAAACAACTTTGCCGAACGAGAAATCGCCACATGACCTCGATAAGGTGTTATCATCAAAAGACCTTGATGATGTATCGTCGATGGCTGTGTTGGCAACACGTGGTAGATACAGTGACCATTCGTGTAGCGATGGCGAAATGAATATTAAGATAAAAAACTACTGCTCGCTTTCATCAGACATTGTCGTTAAAGTTACGACGCCTGACAGCATGACATTAACAGATTGTCTGCCACCGTTGGAGCCACAAATCGGTGCACTTAACGCTACCGAGTCTTCTCGGCAAAATCCTTGGAAGTCAGTGTCCTTACCTGATATCTCTGACGAAGTCATAGAACTGTCTGACTCAGAATAA

Transcript

PE_Scaf12378_2.2

ATGTGTGCAGTGCGTCTCAACGTAAGTAAGACCCGCGCTGGGAGCGATCCGTTGTTTGCAGGAAGCAAAGAAACGTCTGTTCTGTTCATCTTTCCCAGATGGTAACTAATTGTAATTATGTGGAAAATGTGTTTAAGGCCTAGCCCAATCAATATATATTGGACTAGTGTCGCTAGTATTAATGCAATTTCCTCACACTAAATGCTTTCCGTAATTTCAGTTAAAACAAGTTGCCATGTCATTTTACATTCTTTTTTATCTTGAGATGTGACACCTTCAACTTCAAGTTCAATCTTTTTTAACTTATTCAGTCCTGTGTTCATAACTTTAGTCGGGAAGCCAACAGGCCTATTTAGGCTGAACCTTAGATCGAGTATGAATTATGTTTTTTGACGGATTATTGACATCAAGGGTGACCAGAATTTCATGAACAGAATTCGCATGAAAATAATGAAAATGGAAATTCTAGTGTATGTCACATAACAGGAACAGGGGTACAGTGGTGTGGGCAATATTCGTGGTTCCAGTTGTGTTTTGCCGTTTTTACTAACACCTAAATTCATCCGTAAGATATTTATGTGCTAAATGTCTAACACATATTCCTTACAATTCCTGCAAACAAACTGTTGTGTACAAAAGTTGTTTGGAGTGAAGTACTTACGAGAATATACCAGTGAAATCCAAATCTCATCGAAGACGCTTGCGTAAAAATTCGTGGGTCCTATCTGCGCTATGTAAATTGTTCGCGTGTCATGTGAATCAGTGCGAGACCATGCAGTGTATTAAAATAGGCTAAGAACGTTGGAACACAAGATTTCAGTACCACAAATTTTGACCTGCCCCGAATATTCCGGACGTGAATATATTTAAGACAGTCGACCTTCTCCAAAATGGTTCCTTCTCTGGTCACAATGTTAATGTTTTCAGGGTGGTTCTAGGACATACACTTGATTTTTCTAGAATTGATGTTCAAACCAATTTTACACATGATGTTTCAACTCTCATGAGTAACTCTTAAAATGCCTGTGAGAGCTTTTTATTGACAAAAAGCGATGTCGTCGGAACATTCAACATCTGTGATGACTGAAGGGGTTGACACATCTACTTTTCTTTCTTGTGAGTTGAATCCCGGTTCGTCTTCCGTCGCCCATGGCTTCTCTCAGTGCATGGTCAAAGACTATTATGAAGAGGTACGGTGCGGTTGTGTCTCCATGCAGAACTTTTACCAGTTGTTCTGGAATATTTACCATAGATCTTTAGACTCTTCATAATTTTGTGAAAGTGAATTGTATCAAATGCTTTTTGAAAGTCTATGGCTGGTATGAGTGCAGGAAGAGTTGTCGATCTAATTCTTTCCATTAGCCTTCCCCTGGTTATTATAGCAGGCTGTAGTCCTCTTGGCACGCAATTCATTCTGATTTGTTCTTAGAAGGTGATCACTTTCGCAATGTATTCTGTTCAGTATCGTCTTGTTAAAAGTCTTCACAACGATGGAGTTCACACTACTTCCCCTGTAGGCCTACTTCCCTCACATATATATATTTTGGTATCATCATTATTTTCAGGCCATATAATGCCAATAATCATGAACAAAATGTTTAACTGCCTCAATATGTTTTCAGTATGTGACATAACTGGATTCAGTACATAAATCTTGGCTCTTTTCATTTTAGATGGATTGAGTTTATTTGTTCTTTTGCATTTAACATTGTTGTGATGAATTTCTCATGACCCCGTGCAAATAAGATAAATGCAATTGTTTAATTCAAAATGCAAGCACATCTAAATTGTGGATATGTGGACGAACGCATGCACGCACGCACGCACACCCGTGCGCACGATATGATAATAACACTGAGGAGGCAGACATATTGGATTTATACAAATAAACAATGAATGACCAATCAATGCATTTGTTGAAGTCGTAGAGGTCTTAATCATCCAGAAACTAAATGGAATTTAGAATCACTGGGAAAATGCAAGTATATTTGGAGATAATGTTTATAATAAAACACTGATGCCCAATCATTTTTTACAGGCATCGATGCCTCGAACCCCCAACTAAATGGCATTTGTAATAATTCTGGTAAAATGCAACTATATTTGGATATAATGGTAAAGATGGAATCATTCTGAAACTCCAATTATAATTGAATATATGGTCAAGACACTGATATGTTGGTGGCCATATTGGATTTATGCAAATTAAAAAAATGCCTGATCATAATGTTTGTTTCACTCTTTGATGGCACAAGCCTCCAGACAACTACTGTATTTAGAATAAATGTGAAATTCCAACTATAATTGGATATATGATCAAAATACTGATATGGAGGCGACCATATTGGATTTCTGCAAATAAAAAAAATTGCTCAAGGGTGCCAAGGTGGCATCCGCCAGATTCTGTTTCTGGGCACCTTGTTGTCAATAGTCCGTCAAAAAACATTCATACTCAATTTCTAGGTGTACCCTCTTGGCTGTCCCACTACTTTTTAAACAGCTGTGGTTTTAGTAATCTGTGTTCTGTATGAAAAAGAGAAACTTATGGTCCCGTTTTAAGTGGTGCCAAAATATAAGATATATATGTGAAAAATCACCAAGTTAAAACCTGTCATTTTAAATCAAGCAGACAGTTAAGTTAAATTTTTAAATTATATGCTGGGGCATATTTTAATAGTTGTGTTTTGGTCCTTGTATTATTCTTGGGGGCTTTGTACCATACTTGATTTACCCAGTACATTGTTTTTGCAGGACTGAAACTGAGAATCCACAAACTGCTCATGTTGTGTCACTGAACATGGCAGAACTTGCATTTTCGAAGGTAGTTGTTCTTGCATACTTTTTATCAAGACTGTTGTCTAGTTAACGAGTTTGGCAGAAGATGCAGCATACTTTCTGATGTAGTTCTTCTACTTAGCCTGTCAGCATTACATCCATCATTGCTTATTTTGTAAATTATTATTGTAATTCATTCCTTTAGAACAGGTTTGATTTGCTGCCTTCGAGTGGCTTTCAACATGTTATGAAGTAGCAGCAGGAATTCTTAATATTGCTTTATGGTGAGCATCTAACATTATATTTATGAATCTTTGATTACCGACTTACCATTAACTCATTTATCATGTCATATTTTGTAAAGGTATTCACACTAGTTTCAAGAGTTTGTTTGTTTGATAACTCTTTACAGGAGACAGTCATCAGCAAGTTGTGCTGATGTACACAGGGAATACTTTATTGTTCGAGGAATGTTCGATAATGTATAGTTCCTCTTCTTTCAGTTCATGGTCCTATGTGAAAGAGTCACTGGGCATGACGAGGAGGTCCTAACGCTAATAAAAAAACGCCACCAGAGGGCTAAGCCTGATTTCATCCAATCAGACGGCTTTCTGAAATTGCTACAGCACACAGCCGAGTTGATCACCAAGGATGTCATCAACAAATATGTGCACATCAAAGATTTACTGACTGAACTGAAGGCATACCAGGACCAGCCTGCGAAGCCCAGCCGGTTAAGTAAGATTCATGCTGAAACTCACACTGATAGTTCAGCCAGAAAGCGAATGTTTGATTCCGATACAGACAGTATTCCAGACCAGAAGCGACACCACGCCGATGTGTGTAAAGACCTGGACGAAAACAGCAAAGACAGTAACACGAACGAGAGAACCTCAGAGGGACAGAGACAAAACAAAAATAATCATGAAGGAAATAACGACTCAAACGCCAGACTTGTCAACCTGGTGGAAAACGTTGAAAAATCGAGTGCCGCAAATGGGGAATCGGTGATAGAAAAGCGGAAACATGATGTCTCGTCGGTCGAATGCGTGACGAGTAAACGGTGCAAAACATCCGGGGCTGGCGATGTTGAAATAACGGAAACAAATGGGGGAGATGGTTTGGGAAACAGGAGGAGTTCGACAGAAGGTGCATTGGACACAGGGGATATGTGTCGGTCAAAGGAGGGGACGGACAGTTCGGCAGGAAAGGCAAATGGGTCAGAGAGACAGATCGTCAAGCTCGAGGGTCTCTTGAAGGTAACCGTAATAGGAAATATAATTAATACATTTCTTGGTGGTTGTGTTTCTATTCAAACATAATCATAACCAGTGTCTCAAATGCATGGTTTGAAATCACATTTTGAAGCTGGTGATCAATAATCGTATTATTTTGATGTGGTCTAAAATGTGTGCGCATTTACAGTTTTTGTGTTGTTCAGGCACATAAAATAATTACAATAGTGGTTGGGGTGAACCATAGATATTACGTACTGAACTCCCATTTATTTTTTTCTAACCCGCCAATGTATATATATTCTTAACTGAATCATGCGTGCTGCAACCTTTGTAATAATTTGTTATTTATGATATTATAACTGGGTGTTAGAAATAAATATTGATTGACTGATTTGATTGATTGATCCTGCTAAATTTCTAGGTGCATAGTGTTTCGAACTGTTTGTGTTTCACCATGCATAGGAGATCAGTAAGCGAATCAGGAAGTTGGAGGAGAAAGATATATCACTGGATGAGATGGAGGATGACTCGGCCTACACACTCGTGGAGCGCTACAAGGCGAAATTTGTCAAGGTGTGGAACAAGCTGTGCAACATCAAAGGACGTGCACCAACGACGGGTCGACCCATCGAGAGAAAATTCCACTTTGAAGGTACACGGTCAATTCTTAGACTTGCTAGTGTATTGGGTGTTTCATTTACCCACAATTGTTAGTGGCTTGTTCCATATTGCATGACAAAAATCAGTTATTAAAGGTGCTCTATCAATTTGATTTTTGCACGTCTCATTTCAAGCTCATATAGCAAAAACTACGACATGATAGTTCATTTGTGCAACTTTTTTTTGTAATTTCTGTGAAATCATCAGCGAATTACTGGGGTGTAACTTAACTAAATTTTGGATTCAACATCAGTTCATATTACTGTGCACATTTAACATCAAAGTCAGTTCTTTGAAAACTGTACTGCATAAAACAATTCACTATAG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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03344	Daxx	Daxx N-terminal Rassf1C-interacting domain	Domain	Interproscan
PF20920	DAXX_hist_bd	Death domain-associated protein 6, histone binding domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR031333	Domain	Daxx, N-terminal Rassf1C-interacting domain	Interproscan
IPR038298	Homologous_superfamily	Daxx, N-terminal domain superfamily	Interproscan
IPR046378	Domain	Daxx, histone-binding domain	Interproscan
IPR046426	Homologous_superfamily	Daxx, histone-binding domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
-	-	-

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0042393	Molecular Function	histone binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12378_2.2 global RNA-seq network