Gene detail

Detailed information of PE_Scaf12358_11.9 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12358_11.9	HISTONE ACETYLTRANSFERASE COMPLEX	Superscaffold2	52301023	52315129	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf12358_11.9

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF10637	Ofd1_CTDD	Oxoglutarate and iron-dependent oxygenase degradation C-term	Domain	Interproscan
PF13661	2OG-FeII_Oxy_4	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006620	Domain	Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit	Interproscan
IPR019601	Domain	Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase, C-terminal degradation domain	Interproscan
IPR039558	Domain	Prolyl 3,4-dihydroxylase TPA1/OFD1, N-terminal domain	Interproscan
IPR051842	Family	Ribosomal subunit uS12 prolyl hydroxylase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR12117	HISTONE ACETYLTRANSFERASE COMPLEX	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005506	Molecular Function	iron ion binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0006449	Biological Process	regulation of translational termination	Interproscan
GO:0016705	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen	Interproscan
GO:0016706	Molecular Function	2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity	Interproscan
GO:0019511	Biological Process	peptidyl-proline hydroxylation	Interproscan
GO:0031418	Molecular Function	L-ascorbic acid binding	Interproscan
GO:0031543	Molecular Function	peptidyl-proline dioxygenase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12358_11.9 global RNA-seq network