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Detailed information of PE_Scaf12268_0.15 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12268_0.15	TRNA MODIFICATION GTPASE GTPBP3	Superscaffold11	60584044	60594855	-

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CDS

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PE_Scaf12268_0.15

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF10396	TrmE_N	GTP-binding protein TrmE N-terminus	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR018948	Domain	GTP-binding protein TrmE, N-terminal	Interproscan
IPR027266	Homologous_superfamily	GTP-binding protein TrmE/Aminomethyltransferase GcvT, domain 1	Interproscan
IPR027368	Homologous_superfamily	tRNA modification GTPase MnmE domain 2	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR42714	TRNA MODIFICATION GTPASE GTPBP3	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0002098	Biological Process	tRNA wobble uridine modification	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0030488	Biological Process	tRNA methylation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12268_0.15 global RNA-seq network