Gene detail

Detailed information of PE_Scaf12102_8.2 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf12102_8.2	NACHT, LRR AND PYD DOMAINS-CONTAINING PROTEIN 12	Superscaffold14	1321391	1348117	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf12102_8.2

ATGTTTCAACACTTTTCAGGCGAGTTGGATACGTGGAGAAAACAGCTGATTGATGCGCAAAGGCGGATGCTCGAACGCTATGTAGGGAGAAAGAATGACGAAGAAGACACCACTTTACAAGACCTAAACGACATGTTCGTTAATTTGCGGATCCACAACAGCACGGACAAGTATAATCGGATAGAAACGAGAATACATCACGACCACCTGCAGCTGCAGATGGAAATTGAGAGGTGTCCCGAAATCAGCGTAAAAGAACTGTTTGAGCCTGAACGGCCAGACATGGCGACACCTGTCAGGAGTTTAGTAGTCGGTTCTGCTGGAATTGGAAAAAGCATTTTGAGCTTGCACATTGTTGATCAATGGTTGCGTAATGAATTACTGCCAGAAGCCATCTATCAACTGTTCCATTTTCGCTTGAGGGATCTTTCAGAGAGAAAAAAGTGTTCGCTTGAAGAGCTTTTTTTTGAGTGCCAAAAGGTCGGAAAGCCCAGCCCTCAAGCCATCGGTCTATTTTTCGACGAATTGCGAAAGGATCCAACAACGTTTGTAATGATCTTTGATGGCTTAGACGAAGCCACGGTGACACCGACGGAAAACAGGGCATTCGCTTACGACGAACAAGTTGAAATGTCGAGGTTGATAGCCTCTATCATCAATGGATATACCCTTCCATCTGTCAGACTACTGGTGACGTCACGGCCAGGTGGCGTCACAAACTACGACATGTATGACAAGAAGGCTGAGATATATGGGTTTACACGAGAGAAGATGTCTGACTACATCACGATGTTCAGTGGCACCAACGAGAAGGTACAGAAATCAATAAACGACTACATCGATCACCATGTGAACATATGTAGCTTCTGCTACATACCTGCTCATTTAATCCTTGTCTGTCGCATTGTGAAAGCGCGCATGCAACAAGAAAGCAATCTCGAATTACCGGAGACGCTCACAGAATTGTTTGCCGAGTCAATCAGAAACTTTCTAGTCAATCACCATCCCGAACTCAAAGATCACAAGGCAGACACAGCGGTGGATGTGATTGCGAGACTTCAACGTCCTATCCTCGATCACGCCAAATTGGCACTTTACGGAATGGAGCAAGAAAGCGTTAAGGTGACCTTTTCCAAAAAAGAAATATGTCATTTCCACTTGGAGCATGTTGCTACGCAATGTGGCCTTGTGTCACAATCGAGGGAAAGAGGCGATGTCTTGAACACACCTTCTTCAAGTTTCTGTTTTCATCATCTAACTGTGCAAGAGTTCTTGGCCGCGGTTGCGCTAGTAACAAACATCAAACTAGTGCAGCGCGTGACGACTACGGCATCGAACAGGCAACTTGATCTTGTTCTCATATTTCTCGCTGGCTTACTTGGTAACAGCAGAAATCACCATTTCCTCTGTGCACTGCACAGCAGATGGTGGAACTCATTTCAGAGGTCACTTCAACAGAAGAGTGCAGAATCCTTACAAGAACTCATAAAGTCAGTCGTTGCACGAGAACGGACCAATGAGGCTAACACAAGGGACACATCTGAAGCTCACAAGTCTAGTACAATGCTGCTAGTAACGATGATCCACGAATCGCGCCAACCTGAGTTATGGCACCTTGTATCCGACTACATCTTGGAAGGCGGTACGAAACTTGATCTAAGCAATCAACACATCAGCCCCACAGAACAGCAAGCGCTGGCGTACGTTCTGCCACAAACCGGACTGACGTGTTTGAACTTGACTAGATGTGACTTAAAGGGGGACGAAGCTAGGAATATGTTGGTTGCCGTCGGCGATCTGCACGGACTGACAGAGCTAAGCCTCGGCTACAACCCCGGCCTGCACGACGCGACCATGTCTATCGTCAACAGTCTTGTCAAGTTGTCACACCTGGAGCGACTAGACTTGACGAGATGTGACCTAAAAGGGGACGAAGCTAGGAATATGTTGGTTGCCGTCGGCGATCTGCACGGACTGACAGAGCTAAGACTCTCCGTCAACCCCGGCCTGCACGACGCGGCCATGTCTAATGCCAACACTCTTGTCAAGTTGTCACACCTGGAGAGACTCGACCTGGGCATGTGTGCACTGGATGACGAAGATGTCGCACAAGTGGCGACAATCGTGACGTCACTACAACGACTGGAGTGGCTATGGTTAGGCCACAACAACATTAGTGATGTTGGCGCACTGAAGGTGACACAAGTCGCAGCAAGACATCCCAGTCTGGAGCGTCTCAGTCTCTACGCCAACTGTGTGACTGAGACAGGCGTTGAGGACATTAGACGGGCGACACACGACACACCCCGACTGAGGCTGGTGTGCGTCGACTGGCAGCGACGGCCGGGAGAGGGCTGGTACAGGGCCAACGTCGAGGGCCTCCAGCGCCAGCTGACTGACCTAGAGACGGCCCTGGCCCGGCTACAGACACGTGCCCTGTTGGACAGGGACATGTGGTGGAAGGAGGATGTTGACGAGATACGACGGCAGGACGTCCGTTACACAGCTGACCCGTTTGGTGAGTCAAGTCTCGTTGTCGCTACTGGTGCCGGTCGTGACACGTCTGACGTCATCGGAGAGTCAAGGTTATGTCAATACATAACCGTCCGTATATCATTGTCACTACACGCGCCGTCCGTGACACGTCTGACGTCGGTGGAAAGTCAAGTCTCGTTGTCACTACTCACGCCGTCCGTGATTCGTATGTCTTCCGTGGAGAGACAAGGTAATGACTTAGCCAACCGCATCTCTTCGTCTGTATGCACACCGTCCGTGACACGTCTGACGTCAGTGAAGAGTCAAGGCTATGTCGTAATTGAACAAATCTCAGAGTCTCTACCCAGGACGTCCAAGACACGTTTATCGTCACTGGAGAGTCAATGTCCTGACGTAACCGACCGAGTCTCAATATCTCCACTTATAACGTCCTTGACACGTCTGACGTCATTGGAGAGTCAAGGTAATGAGGTAACCAACCGAGTCTCAATGTCTCTACACACGACGTCCATGACACGGCTGAGGCCAGCGATGAGTCAAGGTACGGCATATGGCGGTCATTTAGTTGGTTAA

Transcript

PE_Scaf12102_8.2

CATCATGCGTTAATTGTTTTGAAACGCAAGATGTTTCTATTATACAATGTTTCAACACTTTTCAGGCGAGTTGGATACGTGGAGAAAACAGCTGATTGATGCGCAAAGGCGGATGCTCGAACGCTATGTAGGGAGAAAGAATGACGAAGAAGACACCACTTTACAAGACCTAAACGACATGTTCGTTAATTTGCGGATCCACAACAGCACGGACAAGTATAATCGGATAGAAACGAGAATACATCACGACCACCTGCAGCTGCAGATGGAAATTGAGAGGTGTCCCGAAATCAGCGTAAAAGAACTGTTTGAGCCTGAACGGCCAGACATGGCGACACCTGTCAGGAGTTTAGTAGTCGGTTCTGCTGGAATTGGAAAAAGCATTTTGAGCTTGCACATTGTTGATCAATGGTTGCGTAATGAATTACTGCCAGAAGCCATCTATCAACTGTTCCATTTTCGCTTGAGGGATCTTTCAGAGAGAAAAAAGTGTTCGCTTGAAGAGCTTTTTTTTGAGTGCCAAAAGGTCGGAAAGCCCAGCCCTCAAGCCATCGGTCTATTTTTCGACGAATTGCGAAAGGATCCAACAACGTTTGTAATGATCTTTGATGGCTTAGACGAAGCCACGGTGACACCGACGGAAAACAGGGCATTCGCTTACGACGAACAAGTTGAAATGTCGAGGTTGATAGCCTCTATCATCAATGGATATACCCTTCCATCTGTCAGACTACTGGTGACGTCACGGCCAGGTGGCGTCACAAACTACGACATGTATGACAAGAAGGCTGAGATATATGGGTTTACACGAGAGAAGATGTCTGACTACATCACGATGTTCAGTGGCACCAACGAGAAGGTACAGAAATCAATAAACGACTACATCGATCACCATGTGAACATATGTAGCTTCTGCTACATACCTGCTCATTTAATCCTTGTCTGTCGCATTGTGAAAGCGCGCATGCAACAAGAAAGCAATCTCGAATTACCGGAGACGCTCACAGAATTGTTTGCCGAGTCAATCAGAAACTTTCTAGTCAATCACCATCCCGAACTCAAAGATCACAAGGCAGACACAGCGGTGGATGTGATTGCGAGACTTCAACGTCCTATCCTCGATCACGCCAAATTGGCACTTTACGGAATGGAGCAAGAAAGCGTTAAGGTGACCTTTTCCAAAAAAGAAATATGTCATTTCCACTTGGAGCATGTTGCTACGCAATGTGGCCTTGTGTCACAATCGAGGGAAAGAGGCGATGTCTTGAACACACCTTCTTCAAGTTTCTGTTTTCATCATCTAACTGTGCAAGAGTTCTTGGCCGCGGTTGCGCTAGTAACAAACATCAAACTAGTGCAGCGCGTGACGACTACGGCATCGAACAGGCAACTTGATCTTGTTCTCATATTTCTCGCTGGCTTACTTGGTAACAGCAGAAATCACCATTTCCTCTGTGCACTGCACAGCAGATGGTGGAACTCATTTCAGAGGTCACTTCAACAGAAGAGTGCAGAATCCTTACAAGAACTCATAAAGTCAGTCGTTGCACGAGAACGGACCAATGAGGCTAACACAAGGGACACATCTGAAGCTCACAAGTCTAGTACAATGCTGCTAGTAACGATGATCCACGAATCGCGCCAACCTGAGTTATGGCACCTTGTATCCGACTACATCTTGGAAGGCGGTACGAAACTTGATCTAAGCAATCAACACATCAGCCCCACAGAACAGCAAGCGCTGGCGTACGTTCTGCCACAAACCGGACTGACGTGTTTGAAGTAAGTGTCAATGTTTTATTAATAGCCTGCGCGTATGATAAATTTTATTGTGTTCTCCCCTAATGATACAGTTAGGCGAGAGCGCCGATACTACTATGAAAGGTAGAAACGAGTTAGACATTTCACAATGCGTCAATAGTAATTACGGTAATAAAGAAATATATTACACCCATCCTTTGATGCAAGGTAAATAGCTGTTGAAATGTAGTATGAATGCAGATAATTCGTATATAGAGACCTACAAGTAAAATCGCATAAATAAGATAACATTTTATTTCAACTATTAGTTTAGCATCGCAGTCACAGTAACCTACAGGGTCTGACATGTAGGACATAACTTATTTCGTGAATAATAACTTTTTTGTTGTCCTTTCTTTGTATGTCGCCCTAAATTCATCTCGTAAACTGGTTTCGAGTGATAACATTTCTTGTAGTTAAATGTCATTGTCCATGTTCACTACAAACTGTCTCGCGACACGTTTTGTTTTGTAAACAATCTTATTGTAAATAAATCTCTCACCTCGGTATATATATATATATGTATATTAATAATAAAAATAAACAGTATTTATTCACGATAACCTTACAAAATATACATTTTATCTTCCTAAGGGTCGTGATTGTAAACTATTAGAGTACAGGTAAATTTTATAGAAATGCTAATCAAATTAATTCAATTAAATAGTATATTGCATAATGCAGTTAAAATATACTTAAATACGTATTATAATTTAGAAATTAGAATTGCACAAATAATAATGGTAAAATATGTAGCATCAATAAATAGAATAAGAAACGCTGTGTTAAAATGTTGATTACGTTGTGTGTCACTGTTGTCTAATTAAACACGTCCTGCAAATATGCTCTCTTAACCGCACTTAGAGAGTTGCAGTTTCTTAGTTCTGGATTTAAAGTATATATAAGGCAGTCCTTTATGCTTATTTGGTCGACGTATGCTGCTGTTAGGAGTATATGTATATATATATATTTATATATATATTGGTCGACGTATGCTGCTGTTAGGAGTATATGTATATAAATATATATATATACATATACTCCTAACAGCAGCATACGTCGACCAAATAAGCATAAAGGACTGCCTTATATATACTTTAAATCCAGAACTAAGAAACTGCAACTCTCTAAGTGCGGTTAGAGAGCATATTTGCAGGACGTGTTTAATTAGACAACAGTGACACACAACGTAATCAACATTTTAACACAGCGTTTCTTATTCTATTTATTGATGCTACATATTTTACCATTATTATTTGTATATATATATATATATATATATATATATATATAATGCATGGCTGCCTATCACACACATTTAAGGACGAGCTCATCTAATACGGTGTTAATTTTTTTTTAATACAAAGCTTGAAATGGCGCGAAAATCTTGAACATGGAGAATAGATTTTTTGATTTTGAAATATATACATTTTAAATTCTTTTTGTGAAAAATATTTACGATTATCGAACGATACAAACATGTTTAAATGAAACAGAGGAACACATTAAGGGCGCTATAAAACCTGTTTCACAACAACAAATTATCATCGGTCAGAAGAAAAAAGGATAAAAATCATAAGGTTAACGTCAAATGATTTTACATGAAAGGTTGAACAGTAATCGTTATGACGCCTATTTACAAAGTGTTACTATAGATCATCATTAGGCCTTGAATAAAAAATATTGTCTATTTAATGGATGGATACACAAGTCTGTATATATATATATATATATCTATAGTTTATGTTATGCTACCAATTTTAGTAATTATAATGTGTTATAAATTATATGTGGATTACCTATTTTAATATTTCAATGTGTAACTAAAGGAATATTAATGTGTTTAATGCAATGTTTTAAAATGACAATACAGTTATTACGTCGTAGAATACTGAAACTTGAACGACACAACCAAACGGGGCAAGTCAACTGCCAACTTTCACAAGGCAAATTACTCTTCCGCATCGCTTTTCCTGGATATGCGTACATATAATCTATTTGATTTTTCCGCCGTTCCTACAAATGTACTGTAACACAGAGATCACCTCGCAGGTGTTCCAGCACCTTCTCACCCAGCTGAATGAGCGATATCAACATTTACACCAGCTGAGTCGAGGTGCCGTGCTACATTCGATACTGCATTATTGTAATGGACAGAGAACATACCAGATGAAAACTTGGGTTTCAATTGCACCGTATAAATGGCGATAGCTAACGTCAGTGAATACATATCATCCAGCCAAGCAAACGTTGATTACCTTTCGGTTGTTACAATGTACATGTAATGTCGTTATACTTTATGACGGCGACGGATGTTGTTTCGTTGAACATGGAGTATTTTCTACAGAATATGGCCATTCAGCCGCATTATTTACGCCCACCAGTAAACATGTATTGTAAGCCAATACACAATAATTGGTGTTCAGTTGTGTGTTATGATATTTTCAAGCAATTTAAAATGTGCTATTATTATTATGTACGCCCTGACAACAGTTAATCAAATGTCTTGTGCAAACAATTTTGAGAAAAAGAAACGTTACGCGGACCACATATATTTACGTCGGATATAATTGCAATAGACACTTAAGGTAGTGTTTCAAACATCGCCACACAAGTTTAACGTTCGTCTGATGTATTCTAGAATCGATAAGCCTAACATAGCAAAGTTTGTCACTTGTTATTGTTTGTTTTTTGTTTGTTTATTGTAAAATAGGACGGACAGTTGTGTATTTGATTTGTGGTTTAAAAGGTCTGTTTAACTATGATAAGAATCCAGCGGAAATGTGAAAAGATTGTACACGTTTTGATTAAAGCAAAGCACTTTGCTTATCTGCTTTATACACCCACGGAACCATTTTAAAGATTGGAGGCATTCCAGATTTTGTTGCGTTCAGAAATGGCAGCCATTTTTTTTAATGGCCCCCAAATTCAGTTTCCTTATATCGTAATTACTGCGTTAGATAGAGCAATAATATTTGTGTCTAGATATAGATTATAGGGTTCAACGATTTCATATTTGTTACTTTTGGGCTTCTCCGACATTCACATCTGCCATTTTTAAAGATGGCGGTCGTCAATATAAATGTAAATATATCTTAATAAGTACGTTACATAGAGCCGCATAGTTTACGTTTTTGTATAGCATGGAGGATAGCGATATCAAAACGTGTAACGTTTTACCTTCGTCAACATGTCTATAT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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF05729	NACHT	NACHT domain	Domain	Interproscan
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InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001611	Repeat	Leucine-rich repeat	Interproscan
IPR007111	Domain	NACHT nucleoside triphosphatase	Interproscan
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PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
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GO:0005737	Cellular Component	cytoplasm	Interproscan

KEGG pathway

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-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf12102_8.2 global RNA-seq network