Gene detail

Detailed information of PE_Scaf1206_2.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf1206_2.3	DOLICHYL-PHOSPHATE-MANNOSE--PROTEIN MANNOSYLTRANSFERASE	Superscaffold10	26812830	26839590	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf1206_2.3

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Transcript

PE_Scaf1206_2.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02366	PMT	Dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase	Family	Interproscan
PF02815	MIR	MIR domain	Domain	Interproscan
PF16192	PMT_4TMC	C-terminal four TMM region of protein-O-mannosyltransferase	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003342	Domain	Glycosyl transferase family 39/83	Interproscan
IPR016093	Domain	MIR motif	Interproscan
IPR027005	Family	Glycosyltransferase 39-like	Interproscan
IPR032421	Domain	Protein O-mannosyl-transferase, C-terminal four TM domain	Interproscan
IPR036300	Homologous_superfamily	Mir domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10050	DOLICHYL-PHOSPHATE-MANNOSE--PROTEIN MANNOSYLTRANSFERASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000030	Molecular Function	mannosyltransferase activity	Interproscan
GO:0004169	Molecular Function	dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase activity	Interproscan
GO:0005783	Cellular Component	endoplasmic reticulum	Interproscan
GO:0006493	Biological Process	protein O-linked glycosylation	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0035269	Biological Process	protein O-linked mannosylation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf1206_2.3 global RNA-seq network