Gene detail

Detailed information of PE_Scaf11796_0.9 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf11796_0.9	NUCLEAR RNA EXPORT FACTOR	unanchor2888	10046	14426	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf11796_0.9

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF03943	TAP_C	TAP C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR005637	Domain	TAP C-terminal (TAP-C) domain	Interproscan
IPR009060	Homologous_superfamily	UBA-like superfamily	Interproscan
IPR018222	Domain	Nuclear transport factor 2, eukaryote	Interproscan
IPR030217	Family	Nuclear RNA export factor	Interproscan
IPR032710	Homologous_superfamily	NTF2-like domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10662	NUCLEAR RNA EXPORT FACTOR	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0016973	Biological Process	poly(A)+ mRNA export from nucleus	Interproscan
GO:0051028	Biological Process	mRNA transport	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf11796_0.9 global RNA-seq network