Gene detail

Detailed information of PE_Scaf11765_1.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf11765_1.3	RNA LARIAT DEBRANCHING ENZYME	Superscaffold6	70256550	70277711	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf11765_1.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
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PF05011	DBR1	Lariat debranching enzyme, C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
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IPR007708	Domain	Lariat debranching enzyme, C-terminal	Interproscan
IPR029052	Homologous_superfamily	Metallo-dependent phosphatase-like	Interproscan
IPR041816	Domain	Lariat debranching enzyme, N-terminal metallophosphatase domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000398	Biological Process	mRNA splicing, via spliceosome	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0006397	Biological Process	mRNA processing	Interproscan
GO:0008419	Molecular Function	RNA lariat debranching enzyme activity	Interproscan
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GO:0016788	Molecular Function	hydrolase activity, acting on ester bonds	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf11765_1.3 global RNA-seq network