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Detailed information of PE_Scaf11629_8.8 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf11629_8.8	2-OXOISOVALERATE DEHYDROGENASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL	Superscaffold8	33448851	33478431	+

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CDS

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PE_Scaf11629_8.8

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00270	DEAD	DEAD/DEAH box helicase	Domain	Interproscan
PF00271	Helicase_C	Helicase conserved C-terminal domain	Domain	Interproscan
PF00676	E1_dh	Dehydrogenase E1 component	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000629	Conserved_site	ATP-dependent RNA helicase DEAD-box, conserved site	Interproscan
IPR001017	Domain	Dehydrogenase, E1 component	Interproscan
IPR001650	Domain	Helicase, C-terminal domain-like	Interproscan
IPR011545	Domain	DEAD/DEAH box helicase domain	Interproscan
IPR014001	Domain	Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR029061	Homologous_superfamily	Thiamin diphosphate-binding fold	Interproscan
IPR050771	Family	Alpha-ketoacid dehydrogenase complex E1 component	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR43380	2-OXOISOVALERATE DEHYDROGENASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0005947	Cellular Component	obsolete mitochondrial alpha-ketoglutarate dehydrogenase complex	Interproscan
GO:0009083	Biological Process	branched-chain amino acid catabolic process	Interproscan
GO:0016624	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf11629_8.8 global RNA-seq network