Gene detail

Detailed information of PE_Scaf11275_12.18 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf11275_12.18	RAB FAMILY	Superscaffold1	40615122	40627473	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

PE_Scaf11275_12.18

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00071	Ras	Ras family	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001806	Family	Small GTPase	Interproscan
IPR005225	Domain	Small GTP-binding protein domain	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR47981	RAB FAMILY	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003924	Molecular Function	GTPase activity	Interproscan
GO:0005525	Molecular Function	GTP binding	Interproscan
GO:0005764	Cellular Component	lysosome	Interproscan
GO:0005770	Cellular Component	late endosome	Interproscan
GO:0008333	Biological Process	endosome to lysosome transport	Interproscan
GO:0045335	Cellular Component	phagocytic vesicle	Interproscan
GO:0090385	Biological Process	phagosome-lysosome fusion	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf11275_12.18 global RNA-seq network