Gene detail

Detailed information of PE_Scaf11136_4.10 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf11136_4.10	TRANSPORT AND GOLGI ORGANIZATION PROTEIN 6 FAMILY MEMBER	Superscaffold7	33930247	33955402	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

PE_Scaf11136_4.10

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Transcript

PE_Scaf11136_4.10

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF10304	RTP1_C2	Required for nuclear transport of RNA pol II C-terminus 2	Repeat	Interproscan
PF10363	RTP1_C1	Required for nuclear transport of RNA pol II C-terminus 1	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR011989	Homologous_superfamily	Armadillo-like helical	Interproscan
IPR016024	Homologous_superfamily	Armadillo-type fold	Interproscan
IPR019414	Domain	RNA polymerase II assembly factor Rtp1, C-terminal domain 2	Interproscan
IPR019451	Domain	RNA polymerase II assembly factor Rtp1, C-terminal	Interproscan
IPR039600	Family	TANGO6/Rtp1	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
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Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0009306	Biological Process	protein secretion	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf11136_4.10 global RNA-seq network