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Detailed information of PE_Scaf11008_0.5 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf11008_0.5	ZINC FINGER RNA-BINDING PROTEIN	Superscaffold1	29501398	29514334	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf11008_0.5

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12874	zf-met	Zinc-finger of C2H2 type	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003604	Domain	Matrin/U1-C-like, C2H2-type zinc finger	Interproscan
IPR013087	Domain	Zinc finger C2H2-type	Interproscan
IPR036236	Homologous_superfamily	Zinc finger C2H2 superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR45762	ZINC FINGER RNA-BINDING PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003725	Molecular Function	double-stranded RNA binding	Interproscan
GO:0003727	Molecular Function	single-stranded RNA binding	Interproscan
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding	Interproscan
GO:0071011	Cellular Component	precatalytic spliceosome	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf11008_0.5 global RNA-seq network