Gene detail

Detailed information of PE_Scaf10975_0.3 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf10975_0.3	SERINE/THREONINE/TYROSINE-INTERACTING-LIKE PROTEIN 1	Superscaffold9	10894995	10901615	-

Gene Structure

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CDS

Transcript

PE_Scaf10975_0.3

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00581	Rhodanese	Rhodanese-like domain	Domain	Interproscan
PF00782	DSPc	Dual specificity phosphatase, catalytic domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000340	Domain	Dual specificity phosphatase, catalytic domain	Interproscan
IPR001763	Domain	Rhodanese-like domain	Interproscan
IPR029021	Homologous_superfamily	Protein-tyrosine phosphatase-like	Interproscan
IPR036873	Homologous_superfamily	Rhodanese-like domain superfamily	Interproscan
IPR053272	Family	Serine/threonine/tyrosine-interacting-like protein	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR46659	SERINE/THREONINE/TYROSINE-INTERACTING-LIKE PROTEIN 1	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0001691	Molecular Function	pseudophosphatase activity	Interproscan
GO:0004864	Molecular Function	protein phosphatase inhibitor activity	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0016311	Biological Process	dephosphorylation	Interproscan
GO:0019903	Molecular Function	protein phosphatase binding	Interproscan
GO:0062030	Biological Process	negative regulation of stress granule assembly	Interproscan
GO:2001244	Biological Process	positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf10975_0.3 global RNA-seq network