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Detailed information of PE_Scaf10553_0.17 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf10553_0.17	STEROL DESATURASE	Superscaffold10	22822559	22830306	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf10553_0.17

GGTACATCACTTGATAATCAGCCATGGATGTTGCCCTGAAGTACTCCGACGAGTACTTCTTCACGCCCTATGTCTACCCGAAGACCTGGTCTGAGGACAATCTGCTGAGGCAGTTCATCAGCCTCAACATCATAGTGGATGTGGGAGGCACACTGCTCTACCTCATCACTGCCTCACTCAGCTGGTTCTTCATCTTTGACAGCCGCCTTCTGCAGCATCCCAAGGCACTCAAGGTACAGAGGCTGGAACAGCAACAATACATTCACTTTTTCAGTGTTGGCACGCAATTTAATAATTGTTCTAATAAATGCACCATTTCTCAGTAGGTAGTAATCCCTCATAATTTGTTTACCAAAATATAGTGGAGTTAGCACTATTTTATATTATTGCAATTAGATACAATACACAAGTGATGTGCCAGTATTGGAATATTGCTTGAACACTGATACTGTGATTTTTTTGAAAATTACACGTAAGTCAACTATAGAGTGGCTGATAAGATTATTTTTTGATTTGTTCAAATTGCATAATTTTTCTGCCCCAAATTATATAATGGGTCTTATTGAGAACAAATAAATTTAGCCAGATCTCCTGTTTTTTTAACAAATTTTGACAAATTTGGAGACATTCTACAGTGCAGTGAGTAGACCACATTAGAAAAAATTTAATTTAAACATTTTAAATTGTGTTTTAAACAGTTGCAACACATACTGATTTAATTTTCAAGCTTTTGATTAAAAAAACTTATATTCATTACACAGAGAAGACTAAGCTGATTGCAACATTTTTCCCAAGACGAAATATGATTTTGAGAAAATGGCCATAAAAATGAATAATGGGGTTGATTACTTTATATTGGTATGCTTGATCTATGAATAAAAGTGGCTTAGAGAATATGGGTAAGTAATTGTTATAATTGTGTAAATAATAAATATATATACAAATCTATTGGAATCACCTTGCTTAAGTATGGGTTAAATACGTTTTAATGCAGCTTAGTAGGCAAGATCAATATGCTAACATTCTGTAACAAATATTAAGTTTTCACTGCGATGAGCGCAAAAATACTGCCTGTACTGGTACTCTAAAATATTAATTCGTCAACCGCATATGAATTGGTGAATCGTAATATTGTTCGGCACGGTAAATGTGCTTTCTAAATTGGTATATTGATTGAAAGACGAAGTTAAGCCAATTGTGAGCGTACTTATAGCTTTAAATCCTTAATCAACTCTAACACAGCGTTTGTCAACTCATTTGTGTATTGGGCTGCTGAGTACCAGGTTATTATTTTAGATCTTATGTCAGCGGTACCATATTACCGTTCAGTTGACCGTGGCCTGTTGGTCCGTTGTTTATTTGAAAACAGTACACCATTCATGAATTTTATTCAGTTCAACATTCAACAGTGTGCAACAGTGTATGTGATTTAAACATAATACACATTGACATTGGCTGGCAGCTTAATAAGCTTCATAAACTGCATATAGACTGCGTGATGTGCACACACTGGCTTCGATGGCATTCTTCGTGCAGCAGCAGTGTCGGTCGAGGCGTGACTGTATGCTGCAGAACCAGTTGTTGTGTTGACACTGTTGACATGTGTTAACTCTGTTGACGTGTTATGTTGACTCAATTGATATGGTGTGTTGACTGTATTGAAGTTGTTGACATGATGTGTTGGCTCTGTTGACATATTGTGTTGACACTGTTACACGTTATAGAACCAGGTGCAGCGAGAGATCACCTTCACCCTGCAGTCTATTCCGTTCATGGGTCTGCCCACAGCGGCTCTCTTCCTTCTTGAAGTCCGGGGATACTCACGGCTTTACGACAACATTGATGATGCAAGATTTGGTAGGTCCTAGTTAATTTCACTACACTCTTTGGTACATGTAGCAGTGAAGCAAAATCTACATATATATATAAAAGTGTGCATGGTAATTTGTTGGCCTATTGCAGTCTGTTGCCTTCCAGAAAGTTGGTTCGATGTATACAAAGATGGTACCATCTTGCAAGGTATAACCCCCAAATCTGTTTACTTATTCCTCTTCACTCTGAGTAGTGCACAGGACCAAAACGATGCTTCTTCAACACATTTTGTTAAATTTGCTTATGTCCATGTCTGCATTAATTAATTATAGGCTTGATGGCAGTCTTAGACGTAGTCGTGACAGTGGTCCTAGAACTAGTTGTGACAATGGTTCTAAACCTAGTCATGGCAGTGGTCCTAGACCTAGTCTTGACAATGCTCCTAGACCTAGTCTTGACAGTGGCCCTAGACCTTGTCATGACTGCAGTCATAGACCTAGTCGTGACAGCACTGCTTGTATTCTGCTCACCAATTTCCTGAACATGTTCAAATTTTACATACAAGTAAGTTTCAAGATTGACATGTGCAACGGACAAGTGAAATGTTTACCTAACTTTATAGAAATGACCATGAATGAGTTGGCGTGCGGGTGACGAGACATGTTGTGTTGCAGGCTGGTGGAGTATCGCGGGGACGCTGCTGACATTCATCATGTTCACAGACTTCGTGATCTACTGGATCCACCGGTGGCTGCACCATCCCCTCATCTACAAGAACATCCACAAGCCCCACCACCAGTGGAAGGTGCCCAGTCCATTCGCCAGTCATGCCTTCCACCCCCTCGATGGCTTTGCACAGAGTCTGCCCTACCACATCTACGTGTTCCTCTTCCCCATGCATAAGTTTGTCTACCTGCTGCTCTATGTCTTGGTCAACGTCTGGACGGTGTCCATCCATGACGGCGACTACCGCGTACCAAAGATCCTCCAGCCCATCATCAATGGCTCAGCCCACCACATGGATCACCATGTGTACTACAACTATAACTATGGTCAGTACTTCACGCTGTGGGACCGCGTTGGAGGGTCATTCCGCTACCCTACAGCCTATGAGGGTAACGGACCACTCGATCAAGTGAAGAGGATGAAGGGCGGAAAGTTCGCAAAGAAAGCCGAGTAAAGGTGGGGGTGGTGTCTAGTGGTATCTGCACTGTGCTATCTGTGGTAGGCCTTACATTTCATAAGCAGGTCATTCATTATTCATAGGAGATGGGTAGGAAATTGTCAACAAACAGTGTGAATGGCTAGAAATACTATGAGTAAAAAGTTATACTACAAATAGGTGCAAGATTACACCAATCACTGCAACATTTCAGGTATGTTATGTTGAAGGTTTATATGCTACCGGGTGTATTCAAGAGTTACTGAAATAATCCTAACACTTTGTTTTACGTAATCAAATTTATCATTTGATAAGATGAACTGGACTGATCACAAATGTAATCTGGCTATGTAAGGCATGTGTGAAGTGTGACCAGCATTTATCTATCAAAACTGCAACATTGTCTTGCCAAACTATGTCACCACTGTTACCAAAACAGATGGTATTTGGTGACATTTGTTTGAAAGGGTGTCTTGATTAGCGTGAAATCTGATGTTTCTACAGTATATCCAGTTATTGACCAATGACAAATATATTATGTGGCTGATGATAAAAATATCAATTAACCAAAGCCATGGTTATCCCAAGTAGCATTTCTATCTTAACTACCATGAGTTGACAAAATGAAGTTTCTACCACTAGTCTCTGGCGGAAAGGGATTTCTATGCTATACCCTGTTTCTGTCCATCATAGTTTATGGCACAGAAATACTTTTTTACTTTAATGTGTGCTATCCTGAGTGTAAATGATATATATATATTTGTGTACTTGCAGTATTGTATGCCCATAATATGTATGTGTCATTTGTATTTGTAATTATATGGGTATATATATACATGTATCTAGACTAGAAAAAATATTTATATTAGTCATTACAACTTTACTCACCCCTCTTTGTAATGTGCTCGAAAAATTGACAAGATTCGTTTCTCGCAATGATGTAGTAGTTTGTTCAGCATTAACTATGTATCAAATTCTACTGTTTAATTTGAACAGTTGAAATAGCAAGACGAATCTCTTTCAGGGTATTCGCATGTATTGAAAGGTTGTTTGAAAGGAGTAATTCGACAACTAGATCACATTGTTGTCACTTGTTTGACATCGTTTATTACTTGTTACAACAATGTTGACCTCATGATTAGTGCAATCACAAGAACACCTTCAGATTTCTAAATCAAACTGATTGTAATTGAATTAAGATAGCTGTCTACATAGAAAACATGGCAACAAATCAGCCAGTTTTTCTGACTTTCAGACATGATGTTATATTAATTGCAAACTTGTTCAGAAAGATGTTTTTTTTATCTGTACACTTATATTATAAAAATAAATAATTTTTTGTTAACTGCATCACCTGCAAGGCTTAATCATCAACATAATAGTGTGATCTGTGACTAAACATTGCCCTTGTATTCACCAATAGACAGCTATCTTAATTTGGAAAATGAAAGAATATTATGGACTTAAAGGGTAAAACTGTTCAAACATAGCAAGTTTGACTTGACTGAATAAAATGCATACATTTTGTTATGTAAGTAATTTGACAACTATTGTACATGACTTATCACTCGGCCAGTGATAGTTTGCAAGGTAAACAGCTATTTCTAAACTACATTAATATGAACTTTTTCTTTGTTAACTACAATTGGTGCTGTTTAGGTTGGCTCTCTGTAAAGTCTACATGTGAGCACTAGCACACATATATACCATTTTAATTGTTTGTTTAACGTTATACATGTCGGGCTGATATTTAGATTTGTAACTAAATTTAGTGTCGTGTTTGAAATTTTACAAATAAAATAGCAATGTTTTAAACTTAACAGTGTGAAACAAATACAATAAGTAATTGATGATCTGGAAAGTTGGAAGAGATGTTGTATCAGTCCATCTCTCGGGAAAATATAATTCGTCTTAAAAGCAAAGCATGGTTTAATGTAAAATACAGTTATGGTGCTTCTTAGTTGAAATGTTATTACAGTGATGGCTAGCTCAGTTCACAGAGAGCGAGCACAAAGTGGTAATATCA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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04116	FA_hydroxylase	Fatty acid hydroxylase	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR006694	Domain	Fatty acid hydroxylase	Interproscan
IPR050307	Family	Sterol Desaturase and Related Enzymes	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11863	STEROL DESATURASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000248	Molecular Function	C-5 sterol desaturase activity	Interproscan
GO:0005506	Molecular Function	iron ion binding	Interproscan
GO:0008610	Biological Process	lipid biosynthetic process	Interproscan
GO:0016020	Cellular Component	membrane	Interproscan
GO:0016126	Biological Process	sterol biosynthetic process	Interproscan
GO:0016491	Molecular Function	oxidoreductase activity	Interproscan
GO:0033490	Biological Process	cholesterol biosynthetic process via lathosterol	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf10553_0.17 global RNA-seq network