Gene detail

Detailed information of PE_Scaf10553_0.16 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf10553_0.16	SUGAR KINASE	Superscaffold10	22794511	22798549	-

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf10553_0.16

GCGTGTGGATGTCGTGAACATGGCGTTCAGTACAGGCAGAACGCTCGTAGGTGCCGTTGATCAAGGAACGACCAATACACGATTTCTGGTGTGTGTTTGGTACTGGCCATGTGTCGTTTTTAGTTAGACTAGAACGTTTAACACATTGGCAAACATTTAGTTTAGCCCAACTAGTCTGACGCAGGGACGAATGTGGAACCGAGCGGCGAGTCTGACTCTCTGACTGAGTCTCGGAGTTTGTCTATAAGACTAACTTATAAGTGTGACTCTGAGTCTGACTCTTCTCCCCCAGGTCAGGCTGGAATGAATTATGTGATTTATGAAGCTGAGACGGAGTCTTGTCTGGATTTTCTAATTTGATAATTCTTGGACGCAAGACGGTGACAACATTTCCCTAAAATTGCTAAATGGCTAAAATGTGTCAGTTACATGTCACATCACATGACAGTGTCACTGTCATTGTTGTGTTGGAAATCTCGCTGGAACTTCGGAAGTGGTTTTATTCTATAATTGTGTACGTATTTCGTTGAATTAGTGATAGGGCATTCTATGCCCTCGCAATGCCAACATGTATACCATATGTGAACATGTACAACTATAATGTATACTAGAGTGTCCCCCAAAAAAGACCCAAGTTCCTGCATCGTGTATTCTGTGGCAATGCTGTAACTTATATTGTGTTGGGTTTCTCAAACCTAAAATGTTTACTTTGAGTTATATTATACAATCCAGGTTTATGACCTGTTGTAGCTACTAGTTCAACATACATTTTAACCAAAGCAGTCAAATAGAAGAAACCATAACATTATAATAGTTTTAATACCAAATCCAAGGGAACACCAAATTTGCTGATGCACAAACTTAACAATTATGTGATTTGTTTCAGATTTTTGATTCCCAGACTGCTGAACTGATTACATACCACCAACAAGAAATACACCAACACCACCCCAAGGCAGGGTATGTAATTAGTTTTTACAGTTAACATATATTTGCACTTAATTAATGGGTAAAATCCAAATTTATCTGCTCAGATACAATATTTTTCTATTGTACATATATTATCAATGACAAGTTTTTTATTTCTCCAATAATGTTGTTTAACAGCAGTGAAGATCAAATTTAAACAATTGAATAAAAATGTTGATAGAAGTATTTTATTCTAGAAGAACTAGAGAACACAAATTACTAATAGTGAAGAAACAGTGTGTAGATTTAGATATCATAATCACAAAGTATTTGTTCTCACAGATACCCAGAGGATCATAAACAACTGGAACAAACAATATATAGGGTCCTACCATTAATGCTAAATATGCCAGTGTACAAATGTATCAGAAGGGCAGACCTGTTACATATATCTAGATCTATGAACAATTATTGAGTTCTCTTGAAGCTAATGGTTTCCTTGTCCAGTTGCCATGAGTTTCTTTATGCTTAAATGTGGTTATCGCTAATCATTCCACATTAACATGATTTCAGTCACCATGACCAGTTCAGTTACATTTAATGAAAAATATCCATAAAAATGATGTTTGAAATTTGTACAGTTTTGCATTTAATATAATATGTGAGGAATAAAGAGTAGATTTGTTTCCATTATAGATGGGTAGAACAAGACCCGCGGGAAATACTCAAATCAGTGAGAGACTGCATACAAATGGCAGTCTCTAATCTGACGGCACTCAACATGGACTCCAGAGACATCAAAGGTGAGTTTTGTCTGCAGTAAATCAGTATTACAGAAATTCTACAATATATATATATAAGAAGAACTAGTAAATCAGTAAATAGCATCTCCTTTATGAATATGCATACATGCTTACATTTACTAACCGTACTGTTTTACAAACTGCTAAGTTATATCTTCCGGAGGATAGGTAGTGTTACTTACAAGTATTCATAAAGCCATCATCTTCAGCCCAGATGTATTATTAGTGCACTGTTAGCAATGTGGTATGTTGCTACTCTTCAGCCTGGGTATATTTGTAACAATATGTTATTTTGCTACAGCCATTGGCATCAGCAATCAAAGAGACACAACAATAGTCTGGGATAAGAAAACTGGCAAGCCTCTACACAATGCTATTGGTAAGAACCAGTATGTAATATTCTAATCATTATGAGTAATCAGTGTAACCTATATGGATGAAATTCATGTTATTTATAATGTCAGGTTATGATCTGCGGCTGCACACAGCTGCCTGCAATACATCTGGGCTGGCCACCTCAACTAGCTGGATACTGTTACCTTAGTGGTGTCACATACCATGTTACATATTGAGTACACTATATACTTTCATAAGTTGTTAAGTTTTACATTTTAGTTAATTATTTGATTATACTATTTAAAACACATTTACTGCATTAGACAATCTACCCCTAGGTACTCTGATATGTAGCAGGTAATTGTTTAGTTTTAAGTGTTAACAAATGTACGTAATTTAGCACCAGTATATTTATGTTTTAAATTGACAACACCAGGAAGATAAAAAAATGTGTACTTTATGAAGTTTACAGTGAACATTATTATTATTATAATTACCTAGTAAAATTAGATGTTTAATATGCAAATTATTGACCTACCGATGTTAGTTTGTATTTGTGTTGTTTCTGATGTTGGTTATATTAGCTACCAGATAATGATGCATTGACTCCACCACATGATCTTTGTTTGTAGTGTAGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACAGGTGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACAGGTGATCTTTGTCTGTTTGTTGTGTAGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACAGTTGATCTTTGTCTGTTTGTTGTGTAGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACAGTTGATCTTTGTCTGTTTGTTGTGTAGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGCATGGTTAGACAGGTGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTTGTTAGACAGGTGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTTGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACAGGTGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTTGTTAGACAGGTGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTTGTTAGACAGGTGATTTTTGTCTGTTTGTAGTGTTGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTCAGGTTAAACAGGTGACCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACATGCATGATATTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACAGGTGATCTTTGTTTGTTTGTAGTGTGGTTAGACACGCATGATCTTTGTCTGTTTGTAATGTGGTTAGACAGGTGATCTTTGTCTGTTTGTAGTTTGGTTAGACACGCATGATCTTTGTCTGTTTATAGTGTAGTTAGACAGGTAATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTTTGGTTGGACACACGTATATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTTATTAGACACATGATCTTTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACACACATGATCATTGTCTGTTTGTAGTGTGGTTAGACACACATGACCTTTGTCTGTTTGTAGTGTAGTTATACACACATGATCTTTGTATGTTTGTAGTGTGGTTAGACAGGTGATTTTTGTCTCTTTATAGTGTGGTTAGACACACATGAACTTTGTTTGTTTGTAGTGTGGTTAGACAAAGATTATATTTGTTTGTTAATAGTGTGGTTAGACATGCGGGCTACAGAAACAGCTCAGATGCTCATCAAGAATTTTGCAAAGGACAACAAAGACTTCTTGAGGGTCAGTGTTGATCCAGATGTAAAAATTAAGCACTGGAGAATATTGATTATAAAATGGAACCCCTTTGATTCTAAGAATAATTGTAAACAAGTAGTGGTCAGTCAGCAGTGGTTTGACCATCTGGATGCACTGATCTACACTGTTGACTTCTAG

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00370	FGGY_N	FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR018484	Domain	Carbohydrate kinase FGGY, N-terminal	Interproscan
IPR043129	Homologous_superfamily	ATPase, nucleotide binding domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10196	SUGAR KINASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004370	Molecular Function	glycerol kinase activity	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0005975	Biological Process	carbohydrate metabolic process	Interproscan
GO:0006071	Biological Process	glycerol metabolic process	Interproscan
GO:0006641	Biological Process	triglyceride metabolic process	Interproscan
GO:0016301	Molecular Function	kinase activity	Interproscan
GO:0016310	Biological Process	phosphorylation	Interproscan
GO:0046167	Biological Process	glycerol-3-phosphate biosynthetic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf10553_0.16 global RNA-seq network