Gene detail

Detailed information of PE_Scaf10212_2.12 in Paraescarpia echinospica Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
PE_Scaf10212_2.12	MALATE DEHYDROGENASE	Superscaffold3	74124136	74131010	+

Gene Structure

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CDS

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PE_Scaf10212_2.12

ATGCACTCAACCTTAGAGACAACTGTTGATTGCTATGTTGCAGGTGCGGCAGACTGCCCCTACTTTGCAAAAGTGGAACTTTTAGCAGATACACTTGAAAGGAATCTTCGAAGTTTCAAGTTGCACAAGATTGTCATAAATCCTGGTGAATGGAAGGTTTGTAAAAGCAAGCCATGGCGGTCAACATGATATTGATTATTTAAGCAATCAAATAGAGTAGACTCTCGCTATTGGGACCATGTTGGGACTTAATCAAACTATTCCATGTAATATTTTATGTTGTAATGTCATGTGCCATAAGTGAACATAATTTTCTCTTTCCTTGTAATACCTAACACTTAAAAGGGATGAAGTTCTCTGAAAATCTAGAAACTTGTCCCGCAGTGGTCTGGAGTTTACTCCATTGACAGCATTTCCCCGGAAACAATATGAATCGCTTTGAGCAGTCCGAAGGACTGGATACTGCGCTAGATAAGAACATACCTTTTTAATCTGAATTAACCTTTAAAGTTGTTTTTTGAAGTAGCTCCTATTGTTTTGTTCACAGTTATAGATATGAATAGAAATCTGATTGATATTGTAAATACTGTCGCCATTGTAGACATGGCTTTCCCAGCTGTGCGAAGAGCGAGGTTGGGACCACAATGTGTCGCCTATAATCTGGCGAGAATTGGTCGACAGAGGCGGAAAAGGAATTCTCATCGGCGGCGCAAATGAATTCCAGGTTCGTAAAATAATTTTTTTGTTGGTGTATCAGTCCGCTTCTGTGCGAAACGTAGGCTTGTCATGTATGATATATTAATAGCTACCAAAATAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTATGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATCACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCATTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTGATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTTAGATAGTCGATGTTGTCATTACGAATGTGTTCGTTTAAATGTGCCTTGTTCAGTAAAATCACTCACAAACATTGGATATAAAGTGTCTCAAATGTTGTAGTGCTTAGGTAAAAAGTAATCACATTTGCCGTATTTTTATTGTTTAGTCAAACGTTCTTCTTTTGATTGCTTGATTTGAATGTATGACTACTTAAGCCCTTGCATCAGTTTCAATCAAACCGTCAGACTGGTGATATGAATGTGGTGTTTTGTAGAGTATCTGAGGTTGATCTCCATTGACTAGGAATTGTGAATGGATCTTTCATAATTGTTTTGTTCTTACAATTTATTTGGTAACCAATTACAAATTTTGTATATAAAATATGACATAAAGTTAAGCTTTGACATTACAGACGCCACCATTTTACTGTAATGTATTAGCACGATTGTTTCAAGTACCGTTGGCACCTTTGCCACTTCAATTACCAAAATGCACACATACTGCATCTAGGAATACGCTAACGGTTACTACGATATCAAGTCAATGATGACGAGTGACGACCTCATGATCATCGCTGCGGAAAACAAGGCTACGAAAATAGAAATAGACGTGGAAGAGCACGAGATGAAAGAACAGCGAAAGCCAGTGAAGGTTGGGAGTACCGAATTTTAAAACGATCTGGTCTGTTCCTCACTTATTGATATACTTCATGTAATACTAGAATAACCTGTTGATGTTTTGTTGCCAGCCAAATTGCGTTTAATAAGCTAGACACATTCGCAATGATCACCCAAAAAATTTCGAATTGAATACAGCATTCTGATCAAAGGGTATAAACACAGATCAAAGGAATGGATACTTTATTTTCTCAAAAACATACTCGTTGATTATTGCTGAGTGTTAGGCGATACTCAGAGTTTGCTCCTGCTCTGCTCGAACACATATCTTCTGTTTCTTGATTACACTAGAATGCTAGGCCTATATGTAACAAGTATGTAGCCTAGGGAGGTTTGTGTGCCATTTTAAGATCTGAGTTATTAAATGTCGACAAATATTTGTATGAGAACTGCCAACTATGCGGGCTAGATTTAGATAGTCTTACACCACGCTCCTAACAATGCGTACGACTATCCTGACTGGCACCTGTGCTCTAGAAACAATGGCATCTCTCCAGGTATGCATAACGAACGCCACTGGTGACGTGTGCTACCATCTGGCGGAAGCATTCGCGATCGGCGAGATTCTTGGGTCCAGCGTCGACATCGACCTGGTGCTGCACGAGTTCACGCGCAGCGAGTCGCTCATGAGCCTGTACACGACCGAGCACGAGCACACGGTACTGGACGGTGTCGCCATGGAGCTGGCTGATCTCGCCTGCCCTCTGCTCACGACCGTCACGCCGACAGCGGACGCCAAAGTGGCGTTTGCCGACTGCTGCACGATCGTTTTGCTCGACGAGGTGAGTTGCGTCGTACTCACTAGGGGGCGTGCACGTTGGTGCCGCCCTTGTTTATCGCGCACAATCGTCAGCGCACAGTAAGCAAACCCCGTTCACACATGGCGTATATATGATTCCAATACTACACGGCACGATGTGGTTCCTCACCTCACTTCATGATAATATTCTATTATTTTTAGACAGCGGAACACATTTGCTAAGAAATACGGCATCAATATATGATAATTATAATACTTTTATAGTAACATCCGTAATTGTATTTAATCACGTCACAGTGTCCAACACACTAACTCGCAAATTACACATAGGGATCTACTTAGCAAGGGAACATGGGCAAACGAATCCAAACAGGTGTTTGTAGCAGGGTAAGTAGATCCCACGTTATATTGTATATCACATAATCACACTCATGACTCCGTTGCAGTCGTATGTGTATCACTGACGATGAGTGTCACCGCTAGGTGGAGCAAGAGGAGGACGAAACGAAGCCGTCATGGCTGCGGCGGGTACACGACCGTTTCGTCGGCTACGCCTGCGTAATCAATGAGGTGGCGCCTCCTAACGTCAAGGTGATCGTCGCCTGCCGCGGTCCCGTCAACTTCATCGTGTCAATGATGATCGCGAACGCGCCTCGCATCCGACGTCAGAACATCGTCGGGTGCGCGCAGCTGGTTGAGTGCCAGGCTAAGGGTGTGCTTGCCGACAAACTCACCCTCAACTCAGCCGGCATCGTCGACGTGACGGTTTGGGGCAGTGTCAACGGCAGCTTCTACGTCGACACGACGCGCGCTAAGCTGCATGGATACGACGGCGCCGTGTGGGGGCCGAATTGGTTCGCCGTGTCGGCCAACGAGACGACGAGGAACGACAAATGGCTCGACACGGAGTACCAGCAACTCGTGAAGGCGAGGACGGCCAACACGCGGGCACAGACCGGACACTCGCAGTCCGCCATCGCCAGCGCCGCCGCCCTCGCGACGACACTGAAGTACTGGTGGAACGGCTCGCCCTCTGACCAGACCTTCTCTCTCGTCGTGCACACGGAAGGTACGCACTGGTTGTGATCCCATCTCACGTCATTTGTAAGGACCAACGTTCCACCTTCCGGTCTGTTATAGGGGTGTTTTGGTAATAGGGTAATCGTGGGATCATTCCCATATGTCAGATTTGTAATGGGAAGTTAATCCTGCGAAAGATACGAGCGTAGAGCGACTGTTGTTCAACAATTAAAATAATGGAGGTTGGAGGGGTGAGGGACTCCTAGGCAGCTTACTGAATTTTTAGCAAACATTCATGTCACGGCAATGCAAGGCACAGTGAGGTCATGCACCTACACGTGCGCATGCATACACACACGCGCGCGTAAGTACGCACAAGCGCAGCCGCACGCACACACACACCTTTATTATTTTGATTATTTTGTAGAACCTGTCACGTCTTGACGGCGCGGTTGTTCTTGCAGGCTGGTTTGACATCCCTGTCGGTCTCGTGTTCTCCTGCCCTGTGAAGTTTACGAGCAAAGGCTACTGGACAGTGTGCCAAGACATCGATCTCTCGCAGGAGAGCAAAGCAAAACTGCAAGATATCGTGCTGGTAAGTGTCCGTGAAGACCGCAACAGGACATCTACTTATAATCGAGTATGCTGGTAGGTTAACGTTTTCCCTCTTAGACGGCTTGAACCTCGAGAGCCAAACTTCATGGATTAATCTACGACCACTATAATAGGACGTAAGAACTATATTTTCAAGATACGCCACATATGTCAAGATTCTGACCTTTTATAGGGTAAATGAGTCGTTCGGACGTATAACGCGATGTGCACGTAATACGTACAACATAACC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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02866	Ldh_1_C	lactate/malate dehydrogenase, alpha/beta C-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR010945	Family	Malate dehydrogenase, type 2	Interproscan
IPR015955	Homologous_superfamily	Lactate dehydrogenase/glycoside hydrolase, family 4, C-terminal	Interproscan
IPR022383	Domain	Lactate/malate dehydrogenase, C-terminal	Interproscan
IPR036291	Homologous_superfamily	NAD(P)-binding domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23382	MALATE DEHYDROGENASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003824	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan
GO:0006099	Biological Process	tricarboxylic acid cycle	Interproscan
GO:0006107	Biological Process	oxaloacetate metabolic process	Interproscan
GO:0006108	Biological Process	malate metabolic process	Interproscan
GO:0006734	Biological Process	NADH metabolic process	Interproscan
GO:0016615	Molecular Function	malate dehydrogenase activity	Interproscan
GO:0016616	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor	Interproscan
GO:0030060	Molecular Function	L-malate dehydrogenase (NAD+) activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for PE_Scaf10212_2.12 global RNA-seq network