Gene detail

Detailed information of MBSQW58_g8135 in Bathyacmaea lactea Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
MBSQW58_g8135	SPHINGOMYELIN PHOSPHODIESTERASE	ctg231	1112650	1120865	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

MBSQW58_g8135

ATGTTCAAACATAATTTATTAGTCAATGAAAAGAATGATGCTGACATTGTCACAAATATTGGTAAGTTCCACTAAATAAATTAGAATTTCGATTAGGGCGGTGACTACGTTCAACACTAAATAATATTACAATTATAACACTCAACACCTCTGCGGAAGTCAAAGTCCATCTTCGAAAGGTTTGTGAAATAAATGTAATTTAAGAACTTTTACTAAAGGTTTTAGGGCTGGAGAAGAATGTTATATCAAGTTAAAACATGATCGATACATTACAACCAGTCAACAAAAGTAGTAACTGTTTTACCTCGGGATGAGACGAGTGTGTGTGCACTATTAAATCACTGCTGTAATAAATTTAAAAACAAAGACCAGTTACTGTATTAATCGATTTATAAATATATTTAACTATGTATATAATGATTTATTAGAATTGACCTACATTTCTGTCATGTTCAGTTTTTAGTCTGCATTCTAATTCTCAATGGTTGTTAGCATGTAAATGAATCAAGCATACAAGTAATAAAACATGTTTTCCGATAAACTTATTCTAGTTATAATATTGTCCTTATATTTATTAATTTAGTAATTCACACACATGTGTCTTAATCAGGGCCAGTTTAATTAAGGCCAGCTTGACCTATTTCCCCAATTAGGGTCCAGTGCCAAAAGGAGCTCCATTAGCATTAGTGTCCATTAGCAGGTGCCTTTAGCTTGAACTCGGGTCACTATCATCTTGTCTTTAGTTTAATAACTCTGCTATTCTtattctttcctgatgaaggactaaaaacgtcaaaaataaagtatcaagaagtgagatatccatattatgcgtatttattgtgtttccacttctaattgccacttaaataaagaatctacatgctttgtgaaaaatagatacacaggatttccaaatctttttgtagctttttgttacatagaatgattagcatgaattccccgtgtaaggagtgtgtggagtaattattacatatagaggagtcagagttgattacaccaaaaatagaggagtcagagtcgatctttttcctaccgactccgcagccctgATTCAAAGCTTGGTCTAATCGCTCCAATAATATTGTTCAAATTATGGATTAAGTAACTGTAATACCATATGTAGTAGTATACATATAAGATCTATTATGCAAGGTAtactaggaacaatatttattggaaccactttacttttaggaatatgaaagtgctattctgggcataatcatcgaacatggatagcaaatgctctctctaactttccacattgcacctgcagatcatactgttcacggtgtcacatcctgattacttgcacttgccgataccacattgatcattcatcggttgaaacataagaaaatggctcttaaagtgtacctggcggaaaatgagaaattgcttgcaatgggcatgtatgaatatggcaaatcacagaatgcgattgtcagacactttagtaaatcttaagagtgtgatttctcgactggtaacacgttacccgcaaacgggtggggttaagatttggatgggtagagggaggcctagatagactactcccaggcaggaccgcaatatacgcattgagaaacagatgtatatatgtttttgcatctgaactgagggacgaattcagggttaccacaggaatccgaatttcaaagtcaatgattcgaaacagctcaagagcatgggcctgaaataaagacatccgttcagagaaatgtgtcttactggggcacactggaaatccaatgggcacagcagtttggaATTTTCTTCAATACAGTTAATATGCCATATTGCTTTCATGATAATAAAAACATAAAACATTTAAATTTATCTTTACTAAATTTCCTAGATTTCTGCAGTTGAAATAAAAATCATAGAAATTATATTTAAATCTTTTATTTTTTCATGCTGCTGTTTTTGGCTACATTTACAAAAATAAAGAGTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGTATGCTTGGTTAGTATGATAAAAAGTAATTTAAAAATCCAGACATATGACAAATTTCAatatgatatacatatgtaattatatgtatatataATTATTTTTCAGGTTGTTTTTGGCAGGTAACAGACTTTCACTATGATGAAAAATATAGTGTTGATGGTGTTCCTAGAAATATGTGTCACCAAAGTAAACAAAACCGTCAGTCTAACCATCCTGGGATATATGGGGACTATTTGTGTGATGCACCATGGAAACTTGTGGTCTCAGCAATAGAAGGAATGAAAGTGATTCATAATAAACCAGATTTTATCATATGGACTGGGTATGGTATGAAATGTATTTTACTTAATCTTAAGACAATTTTTCAGGGTAAATGACAAATATTTAGAGTTATGTTAATTTTATAAAATGTCCACAAATAGTACAAgatagactgcatctaatttataaacatactaagtttctatttgcttaccggaataatgactaacaattatttacagaccaatatacatgtatattaaaactgcagtgaccatagttaggataaagagtaactttgataattgacaaatatacattggaaggtggtatcctaaagaaatataaattaaattagatataataactttgtaaagaaaattattacttaacaaggattctggtaagcaaatcgaaacatagtatgtttataaatcagatgctgtctatccattttatatcttgtttcctgtatcatacaaagattataAAAAGTATTAACACCTTCATTTGGACAATTCAGCAGGTTCAATTATGATTGAATTATCAAATGAaatactagacatcaagagaaaagtgtaggaattaaaagaaatatgaagtggtggtgtggtccttgaaaaatgctaaattttcctaatcaatataaacatgtttctcataaaaactaaatcatattttatctaatagcagtgctattctgtgaggaataatgtggccagtgagcaaataaagaggtgttcatcctgctaaaatagttTTTAAAAGGGTCCCATGTTTTACATTTTCAgaatatgggcacatatctgtgaatttttcataaaataaacaaatcagcctctgtctaatattttgttAAATTGCATTATTGGGTCAAGAATCCATACACAGAGTTCAATCTATGATTTTATTATATGTTTCTTTCTTTTTGAAGATTGATGAATTTATTCTATGTAAAAAAACAAATTGTTGAtcagttcaaaaaagaaagtagtttagtcttttatgtagaccattacttccacttctccAAGTAACTTGACGTGATTCAATTTATGATTGTTTTTGTATTTCAAACTTTGTGAAAGTAAATGTTCATAATTGATTATCGAGGGCCTTTATTAGGATGCAATCATCTGACATCTATAATAAGACTGGTTGTTTATGATGGGAGATTTTCAGTGTTCAGATTGTTCATGACAAATTAATTGGATTAATTTCAGTGATTCGGTACCACATGTTAACAATTCTGAATTGAATCAAGCAGAAGTATATAAAATCATCAGAAATGTTACTGACAAGTTAGCAGAAGTGTTTCCAAATATCACAATATATCCGGTCCTTGGTAATCACGATCCATACCCAGAAAATCTAATGTCTCCCAATGCTGGTGATGAATATTATAAAGGAATTTTAAAGACTTCTCACTGGGAAAAACTATTAGCAGAAGATCAACAGAACCAATTCATGCAGGGTAGGTTATTTTTGTTGTAAATATAATTACTCAGAGAATTAATGTGAGAATTAACCCAATATGGATCATACAAGCTCATCAAACTTGAGGACAAAAGAGCACGATTCTGTGTAAGATATTACCGAAATTCTGGAGGATTCTGATTTAGCTCTTAGTGATGGAACAAATTATTCTGGGCAGCTTTATTCTATGTATTTTTTCATACCTTATTTTTCTACAAATTTTTGGCACTGAAGTTATTAGGAAACCAGTTCATTAGGATTGTTAAAAGTTGAAAGAaaatgttgcaatggagcttattgtctatgtaacaccaattgggttattactgctgaggtgtctttaacatgtactaccaatcgcacacaggtctatggattttatcatagcatccgatggactagacaccttttccgccccaccgactataccactgccaagggggaactggattggaaaaggcaccacagttgaaaccagcatttaccaagatttgaacctactgcagctccctgtttatagttgaaccagtTCTAATTTTCTCTGTACTTGTCAAAGCAGTAGTGCATTAAAAAAAGAAGAAAACTGATGTTTTACATCTCAAATTTTGTTGATGAAATCAAACAGAATTACTCATTTCAATAttcaataaataagtataacttttgaaatagagtaaataggtgctggtctgacaaatattaagaattttaaaatgctggtagtggttataataaagacaattggatctcagttattgttaagcaCCAAAATGACTGCTTTGTCATTTGTTTGGATATCAGTGTTGTCAaataacaatagctattttaaaatctgcttaaataaaccagtcctttttgattattctgtaagtatgctattgtcaatcttgatggttcaaatcttcaaAATTAGTATTCAAGTGAATTATTAGTATCTGGAttttattctatgtggttattatagttctatgactaaacctggtttactgctactgggattaatttactagtgtcttgttttttatactactggttattataattctatgattaatactggtttacgacaactgggattatattactagttttttgtttttattccaggtggtttttatagttttacgattaaacttggtttccagttactgggattaaATGCCAACCGTATAATCTACTAATTTATTCTAGATGGTTCTAATAGTTCTGTGATTAAACCTGATTTACAGTTTCTATGTGGTTTTAGACAACTGGGATTAAATTACTAGCATCTTGTTTTTATCCCAGGTGATTACTATAGTTATATTATTAAACCTAGTTTATGGATTAAATATCTAATATATTGTTTTTGTTATAGGTGGTTAATTATAGTTCTATGATTAAACCAGGTTTAAGGCTACTGGGATTAAAGTACTACTATCTTGTTTTTATTCCAGGTGGTTATTATAGTTCTATGATTAAGCCTGGTTTACGGCTGCTGGGATTAAATACCAATCTCTATAATCAACTAGATACATTAGTAGTAGATATGCAAGATCCAGCTTCACAATTCAAATGGATGGAAGAACAATTACAGGATGCTAGAGCTAAACAAGAAAAGGTATTAATTATTATAGTTCTAATTAAAGCTGCTATTTCAGTACTGAAATAGATTGTCTATTTTCTGTATTTATCTATTTAGCTATCCATTGCCAGTTGAAGTTGACCTATTATCTTCAAATGACCTTTGTGAACCAACAATCCtgatctttcaccttgtgacattcgacttttgaccttgactgttgtccttCATAACAGAATATTCAACACAATATAAGCCCGCTTTCACAATATATTTGACTGATATTCACTGATTTTGTTCATTGAGAATTATAAAAGGTAAAGATCAAAGTTATTTTCAATGTAGTGTATTTTAATGTTTCATAAACTTGTGTAGGCTTACTTTGGTCATGAACTTTCACAATTCGACCTTTCGACTGACCTTGACCATTGATCTTCTTATCAGCacataagagtaagcgatggtgctactggtgcaaaattattttgtgtggcacacctagtaataaatatatattggtaaccatatgttttgaaatgacccaattgggtttgagtaaacaataaaccccattcatttctgtccatagccaattgggtttgagtaaacaataaaccccattcatttctgtccatagccaattgggtttgagtaaacaattaaccccattcatttctgtccatagcatatttataaGCTATATATTTATTTCACAGGTTTACATTATATCTCATGTTCCACCAGGAGCTTTTGAAAGATTGAAGGGTGTAGCTTGGTTTTATCCGCAATTTAATCAACAATATTTGAAGATTTTACTCAAATTTACTGATGTAATTGTTGGACAGTTTTATGGTCATGAGCATACAGATAGCTTTAGACTACTTCGTAATGATAAAGGTTTGTATTGAATGTTGTCAACTTTGTAATCTTTTCAGATTATTTTTCTGTCTGCAAATCAAGATGTTCTTATAGGTGTCCtgccctgtcccctagcatgcatgaaaaactaaaagcattttgagaagcttgtgattggccatgatgcttgtttgtaataaaaatcaatcttggtgtgtaatatccaatttctcatttaaattagcatatctgatataaattGCTGTTTGTTAATATTGTTGCAGTGAGAGTTTATTTCAGCTATCAAATTTTGATTAATAAATTAATGTTTAGTGTGTTTCATtgaggagttgcgtgccagacaggcgaatatgccagtacctcaaaaatatgtttccttccttaaccggaataccaatcaataattttatcttctgagcaatctgctttgcctgtccgatgcagcatGGCACAATTATTGCCATGTTGTATCATTTTATTTGATGATTGACTTTGAAAAATAAACCATTTTTATATATTCATATTTGCTTGGAAAACaaagttggccatttgttgctgccctggcaatattctcctgtatagcaaatataataaacatatatatagcgatatgtatgtctcttaatgtcccaattggtgttcaattttcaccatttcatttTTGTAACCATTGGCTAATTAAGCCCCCAAATACTCTTGCAAGCAGGTATTACAAACTTGTTCACCTCAAATACTTATATAGgggagccgcggtggctcgatggtcatgacactagactggttcgattcccggaaaatgccggttcccccttggcagttgataggttggtgggggctgtcaaggaaaagtgtctagtccgtcggatgggacaataatatttggatacccgtgtgcaattggtagtgcacgataaagacacctcagcagttgaaaatcgatataagtgtaggcgatggtgctgctgcccaggcaaaattatcccacattgcacaccaaacaaaccaaaccttttgtatgtctcaaaatgacccaattggtgttgagtagacaacaagccctatttcatttTCAAATACTTACAGAAGCTTATATGCAACTGTCTGATTGCTGATGAGAAACCCTTTAGCCAGTTTCTCAAGAACTTAGGAGAAATGGATCTTTATCTTCATAAATTAATGATTTATATATACTATTTCACAGAATTAATTGTTTTTGTCACACGTCCACATACACTATTCCAGTGGCCATGTCAGTAATTGTTAAGTTTTGTGCTTGGGTCTGTTTACAACAACTGCTTATCTCACATTGTTAATTTTACTCCATGAAAATATGTTTTATGATTATTTATGTCTGTAGGTCCTCGTGCCACGTGCCAATTTAATCTTACAGCCAAAGTTATCTTATTTTTCTTATATTTTGCAGATAAAGCAGTAAGTACTTTATTTTTGAGTCCTGCTGTTACACCATGGAAGAGTAGTTTTCCTGGAGTTGGTGCAAACAACCCTGCTATTCGATTATACTTGTACCGTAAAGATACAGGAGATATTCTGGACTACAATCAATATTATATCAATTTGACTGAAGCCAATATTTTACATAAAGCATCCTGGAAGTTAGAATATAAAGCCACCGAGTTGTTCACCCTTTCAGACGTATCGAATTCTGAACTAGATCGTCTTGTGCAATCTTTTCAGAAAGACGAACCACTGTTCGAAAAATATTTAGTTATAAATACAGTTAGCTACAATTTAAAACAACATTGCAACGATACATGTAAACAGCAACAAATATGCTCAATAAGCAATATTGATTTAGATCACTACCACCAGTGCATCAATCAGATTGGTACACCAAGACAAAATCACACAACTCGCAGGCATATTCATACAAAAAGAGTTCCAATTTACATGTTTTATGTTATTAGTGGTATAGGAGGAGTGATTGTAACACTTACAGTATTGTTTACCTGTTTCTGCATCTGTGATAGAAAACAAAAACTTCCTTACAAATACCACCACTTTACTACACTTGTTAATTAA

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00149	Metallophos	Calcineurin-like phosphoesterase	Domain	Interproscan
PF19272	ASMase_C	Acid sphingomyelin phosphodiesterase C-terminal region	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR004843	Domain	Calcineurin-like phosphoesterase domain, ApaH type	Interproscan
IPR017064	Family	Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase, predicted	Interproscan
IPR029052	Homologous_superfamily	Metallo-dependent phosphatase-like	Interproscan
IPR041805	Domain	Acid sphingomyelinase/endopolyphosphatase, metallophosphatase domain	Interproscan
IPR045473	Domain	Sphingomyelin phosphodiesterase, C-terminal domain	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10340	SPHINGOMYELIN PHOSPHODIESTERASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004767	Molecular Function	sphingomyelin phosphodiesterase activity	Interproscan
GO:0005615	Cellular Component	extracellular space	Interproscan
GO:0006685	Biological Process	sphingomyelin catabolic process	Interproscan
GO:0008081	Molecular Function	phosphoric diester hydrolase activity	Interproscan
GO:0016787	Molecular Function	hydrolase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-