Gene detail

Detailed information of MBSQW58_g347 in Bathyacmaea lactea Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
MBSQW58_g347	PYRUVATE DEHYDROGENASE KINASE	ctg67	545122	556931	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

MBSQW58_g347

atgatacgaggcaataacatgaggtaatgatacaagacaatgatacgaggcaatgataaggggcaataacatgaggtaatgataaggggcaatgatacgaggcaatgatatgaggcaatgatacaagacaatgatacgaggcaatgataaggggcaataacatgaggcaatgattaggggcaataacatgaggcaatgattaggggcCATGCAAACCAAAGTATAAGCTATAACACCACCAATTTCTAAAAACTTGTGATTTCAACATTTATGTTTTCATACATCCATTACATGAAAGTCTATGTTTTAAAATATGACATTATTTTTAAACACTTACATTGTTTTTCTAATTCTTGTTTGTCTAATGTTGATATTAACAACAGTCACCTTATCCACCAAAATCTTCAAACCAGACTCCAGTCTCTCTTGACTATTACACTACAGGCTCACAATAATCCATTGTTGATATCCAATCAGATTTAACACCACAAATGAGATATTACTTATTGCCCAATTATTAACCAATAAGAACAATATGAATAGAAATCAGCTATGTTTTACCATGTTATATCTTATATCATTTAAGCTCATTAAGTTCTTATTTCACCAAATCTGGTTAGTGGTAATTCTCACCTTGTAGGTTGTTATTGAAGTTACACAGCATGTTAAAGATAGTTTGTACCACATCAATATTCTTATAGTGCCCTGTACTCTATAGCAAAACATGAAAAATATAATATTCAGTAAAACATACTCAGAATTGTTTCTCAGTTATTAAAacattagataagggccctacgtgccagacaggcgaagacaccactagcatgtttttagtaataactatgatTTTCTATTTCTAATTTGAGTTATTTCTTCTGATGTGGCAATTAAATTTTCTGTTCACTATAAAATGTCACTTGAGTGAAACTGTTCTATTGTAATGTTTAATGTAATTATGACTTCTGTAAATTTAGCCAGTCTTAGAAACCGGTAACCATGAAGTATCCAAGCACcttgtagtcagggcttgggagttggagtcggagtcgaagcaattttgggtcaacggagtcggagtctgtcattttcctgccgactccaactccgactgaatttggattgcattgtaaatttgtaacgaatgagcgccattttcctattgaccttattttgttagattttatttcaatttttgtttatattaattaaatcacttcagcccactgaagcagtgtcgtgataaaaacaaataagcaatataaatttcttgattatggagaaatctgtaggaatgcataaataattaaattaataaatacaaataaataaataaataaataattatttcagaaaatatcattcgggaaacaaaatgataactggtgtcagtggtgtggatgcgtcaagtcttgagtctttcactgtgtgacaggtttcacacgtcagattcgcgtccactcttgcccaatactcgtaaagtcaaccagtgtgtctgtgtcagttcacctttgctttgtgagatgccgaagtgtgctatattttcgcatcatttttgggtgtttgtagactcacatagaatgattagcatggattccacgtttaaggagtgtgtgaagtatttattacatatatagaggagtcggagtcgattacaccaaaaatagaggagtcggagtcggtctttttcctaccgacttcgcaggccctgCTTTTAGTCTCAATTTGCATGTTCAATTTCTCATTAACTATTTTTGCATTTATTTGCTAAATTATACCTAAGTAACACTGATTGTTTCAAGACATAGTAGGGTTGTTTTTAAAGACTGACAAGCTATCTTTAAATCACAGCACTAAAACAGTCTAAATTATTGATATTATTTTGTGGATAAAATCTGTTCTTCAATTTTTTTCTGCCAGTATGTGTTTAGGTTTATTTAGTTCGACCAATCCTCAAAGCTTAAAATAGACTACGTTAGAATTAAAGTTGGTTGCATGTTTCTATAATTCTTCATATTAGCTTGGATTCAATTTAGGGGACGATTGGTGAAAGGGAGTTGGTCTTATGGAATGTACAGGTACATTGTGGCCTTGGTGTGAGGGGGGAGATGATACAGCTTCAAATTCTGGTTGAAATTCTTGTGATGGCTGAAATAACCAAGTATTTTAATGTTAGGGTCTATAACAACCTGTATGTCTGAATGCAACGAATGAGGAGGGAGGGTAGATATTTTACACATAGTTTGTAGATGTCTCAATCAGTAGTTCTTTTAAGGTATAGACCAATCGGTCATGGttattgggcaagttcaattctattattagctgtcaattttccattatTTAAAGCCacgttggagatcactgtttgcaagttgacaaaacccatttaaataacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttgtaaatattaataactaaagtacaagaacagactaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataacaagaacaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtaaaggacagattaacactgatttctaaatatgaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtaaaggacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtaaaggacagattaacactgatttctaaatatgaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttgtaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaaatacaagaacagattagaactgatttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattagaacttctaaatattaataactaaagtacaagaacagattaacactgatttctaaatattaataactaaagtacacgaaaagttgttcgtagcagttaggaacagtttaatgttttcaagaaaaatgatcccatcaacttttagtctaacttttaacaatagtgaaatacaagatgaacttagtcataaacatttaggtgtataccttaatagtcgttgcaattgggacactcatattgataatcttacagcaaaattaagtaatatgatcaatagtttccggtcgtttaagtatcgtttaaaaggaaaaccttagaagtcctatacaaatcgtttattctttcattatttgactacacgcagattctgtctgggataattgctcactagaaaaatccaaccagcttgaaaaactacacctcgatgcaccacgcaccataacaggccttcctagaggaacatcccacagcattttgtacaatgaaactggaattttctccattcaatcaagacgatatcaacataaaatgacattgttttataaaatagttaataaattagttccttactctctatattcacttctccgccccttgtatcttccaaccaaccctatcaacttcgaaattcaaattatattaaacaaattcaatgtaagtcatccaattatcaaaattcatttttcccatcatcaataaaactttggaatagtttggaccccacatcaaaaattcaacgcctatttcgcctttaaaactaaactaaaatctcttacaatgaaaacaacacgaaaacgagcactataaaatagggaccaggcatgcgcaaatcgttcactgcaaatttgaaattctaaaagtgacttaaacctccataaatgtttaatgcatatttctaataacccgtcatgcacatgtggtcaccaagttgaagacgttgaacacttcttttttcattgtccactttatacagatcaacgcgtgcctcaacgattgatactccaatatgacttcaaaaactcccaaaccttgctgtttgggaacgatacctttaattacgacatcaacgtaactatcgtaaacattgtccataagtatatagccattacaaaacgttttaatataaaataacatcatgcaaaacacgaaaaagcatgacatcgatgaatatttatatatttttccctattcattttatttatctagcaatttatttatttattcttcttctctctgtacatttttaaattataattctgcttaattgtgattattttgttagccagtcattatgataatttatacatatatatatgaagcaccctgtggaagtgatttaatataagcatatacatgcttgttatcgtatccatagaaatttgtatgaaattatgtctaatttatgtgaataaaatattgtttaaatcagttaggaacagattagaactgatttcagatattaaaCATTTAGACCCTGTTTAAAGCTTCTAGTAAACAGAATGAATGAGAATCTTAATATGGGATTTTCATTAGCTGCCTGTAAAACCAACAGAATCTTTTAGAATTATTGGCTAAATTCTGCTTgaattaccaactagaatccatcagaattactgactagaatctgcttgtgttgctaaccagaatctgctagaattactaactagaatctactagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatccatcagaattactaactagaatctaccacagttactaactagaatccatcagaattactgactagaatctactagaattattgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatctgcttgaattactgactagaatctgcttgaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactcgaatccatcagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatctactagaattattgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactgaaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactaggatctactagaattactaactcgaatccatcagaattactgactagaatctactgactagaatccatcagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactggaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactaactcgaatccatcagaattactgactagaatctactgactagaatccatcagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatccatcagaattactgactagaatctactagaattactaactcgaatccatcagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattattgactagaatctactagaattactgactagaatctactggaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctactagaattactgactagaatctacttgaactactgataataatctgcttgaatattgacaataatACTATCTAGAATTTTTAacaaaatttgcttgaattgctgacaaacatttgcttgatttacagacaCGGTATATCACTGGTAAAACAAAGAAAAAATACCCATGTGGAATACTCTTGTGTACTGCCAACCATTGTAACTATTCTACAATAAACAAGATTATTATGATGTAACATGGATAATATAATGTTACAAGGATAATGTGTTGTAGTCTGATGTTTCAATAAGCACACTCATTAATAATTCATTTATCTGAAGTGATAATCATGCTGATTAGAGATTATATTTATGGAGCCTCAATCTGAAATAATATTGTCGCTTAGAATACAAAATTGTGAACTTGTTACTTAGATTATAAACTTGTTACATGGTGTGATGTTTGTTACTGAGATTATAAACTTGTGAATTGATATGATATCTGGTTCCTAAACCAAACAATACCGAAAGCACCTGCAGAATTATTGAATTGGCCAGATTTGATTTTCCCTTGAACATGAAAAATAGTTTTAGTGAGGGGTTGAAAGTTTGATAGGTTGGAGTGAGGGTTATGGGTTGTATTAAGGTAAATTGACAATCATTGAACAATTAGTAGGATGTGTTTGATCAGAAGAAACTATTAGCTTAAACCTAATTAACATCGAATATGGTAGATTAATACCAATAAATAGCTTATGGTTATTTAATAAGTAATTCTTATATATTTTATATTTGTTTCAGGGTATCGGATCGAGGTAGCGGTATTTCACAAAGTATGGTGAATAAAGTCTGGGATTATAATTTTACTACATCTGGTACTAACTCTGATGAGCGACTGGATGGAGGATTATTTGGTCAAGTTATGAACTCCTCCCACTCTGGTCCCATACCTGGAAAGATGCACGGGTAAGTTCACAGTAAAGAAACAATTTTTAATTTATTTTAAAGTGCTggttcaattttttgtatatgcggtttaaatattggggacttttctagcctggtttccccatggcagtggtatggtttgctagactatcaatgaagtgtctagtctgtcgataggacaatcaaattgaaagatacctcggtagttgataatcgaattgagagaaggagatggtgctgctgcactggcaaactgtcccatgtgcatacctaataacacaaaataaattaccatgtgagtgtctcaaaattacccaattgatgttgagtaggcaataaatccaatattattGTAAGTGCTAAATATTAATCGTGTGATTGATTTGATATtttaccaagattcgaagctgggacctcctgtttgacagtccagaaatgaaatgaaatgaaatggagcttattgtctactcaataccaattgggtcatttcgagacatatagttatttatgtattattgtttgttagatgtgaaatgcaggagaattttgccagggcagcgacaccatcgcctactcttatattttcatctgctgaggtgtctttaacgtgcactaccaattacacacgggtctctgaattttattgttccatcttaacacttatccatgacaacctcgccatgaccatcgagtcaccacggctactcttgacagtccagttacctggctgtcaagtccagttacctggctgtcaagtccagttacctgactgtcaagctgcgctgctcccatatATTATCTCTCAAATGTTTGAATCAACTTGGTGTCATTTGTTTGTCTAAAAGTTTATCTTTCAAATTAAATGAAAAGTGTTTGTATCCATAAATAGGATTCAACAATTGATGTCAAATTTTCAAATTTCATACAGTTTATCATTATGTTGTATGATATATTCAGATTCGTAGCTATATATTTGTAAATGTGGGTAGGTAGTTGTAGGTACATAACATATGTTCAtaactataggttcctatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactataggatcctatgtataggttttgtaactaggttcctatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactataggttcctatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtagtatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtatgtataggttttgtaactatagattcgtaAGTGGTGAACATTCATGAAAGTAGTCCTCGGTAGTTAACTGATTATTTTTAGAAGAATATATGTTATTTCCAAGATTTATACTTGTGATTTGAGGATTCCCTCGTTCCtacagtaaatttctgttaattgtatatcctatttgttagaaaGATTTATataccgtatttacccgtgtaaaccgcaaatgcgtgtataacgcacacccccaatttcagtcgaaaatttcaagaaaaaacccagttctcttgtacaatgtgcaatactttccgtctgagataaaaggtcgctacatatgaccaaaacgagttctatgatggaattttaaagaaagtttaagaaccatttctgaatgtttataatttgatattttttattatcgtcgagtatcacatgacctggacttggcactcgcatgttcttgatcatctttaaatgattgtttgttgtacgatattaataaagttgaaagaaaaataaataacagtgtttgtttcattttcatgataaatgaagatgtaacagcaacaacaattccatgaatcgtaaaaaaacacaatattttataacttcaagtgtcgtttgaacaatatggcagtaactgagtatgttttccttttgtaaattcttccgttgaaacccgtgcctcaatataataacattgtatataacgtaattgactctgtgtatttaatgttatctttaaagaaaccaagtatagcataaattataaacttataaattttagccgccgatatatcaagcgagtatggtttttcaaaatatactgtagaacattgacatgcgcaaaggtcattaagtagaatgtcaattggtggtcatacttccggttggatttcgatcttggaggtcaaatgatggccagaaaaaaagtggttaatatttgttctcttgtataatgcgcattagaaaaatagaggtagttttgaatgaaaaaaagtgtgcggtatacacgggtaaatacggtaatTAACAAGTACAATTTAATGTTAGAAAAGTCTCAAATTGGAAATTCTTGTAACAAATATAAACAGTGATATCAGATTTCCTTTAATATCCtatttatatatttatatatttatatattgataatttTACTAAATTTGAAAGATTTTCTGTCAGATTTTTTATTCCATTaatatgaatcaattagaatcaatagaatcaattagaatcatagaatcaattagaatGATTTGATGTTTGAGAAATATGTGCAACAGATATTTTGTtatatattaatattgtgtataatatattaatattgtatatattatatattaatattgtgtgtaatatattaatattgtatatattatatattaatattgtgtataatatatattaatattgtatatattaatattgtgtataatatattaatattgtatatattatatattaatattgtatatattatatattaatattgtgtataatatattaatattgtgtataatatattaatattgtgtataatatattaatattgtgtataatatatattaatattgtgtataatatatattaatattgtgtataatatattaatattgtgtataatatatattaatattgtatatattaatattgtgtataatatattaatattgtatatattatatattaatattgtatatattatatattaatattgtgtataatatattaatattgtgtataatatattaatattgtgtataatatatattaatattgtatataatatattaatactgtgtataatatattaatattgtatataatatattaatattgtatataatatattaatattgtgtataatatattaatattgtgtataatatatattaatattgCCTATAtccatcgttatctaaatatctccaaaaatgtcagaatcaactgcaagttaagctgtttgttgtcagaatatcttctcatggccgctgtcatatttatattttaattgatgtcacttccaggcaggtttttccatgccgctaaatatagaatgaatatgttatataatgAATTATGGCAATTTAAATGAGGGCTCTCTCCTGCCACTAATTTGCTCGTAGGTGTACTAGTTTATTTGTTTTATTTTCAGATATGGTTTTGGACTTCCTACAGCATTAGCATATGCACAGTATCTTGGTGGAAACCTCACCTTGGAATCTATGCCAGGAATAGGAACTGATGTCTATCTACGCTTGGCTCATATTGATGGGAAAAGAGAAAGTTTTCGTATATAA

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF02518	HATPase_c	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR003594	Domain	Histidine kinase/HSP90-like ATPase	Interproscan
IPR004358	Domain	Signal transduction histidine kinase-related protein, C-terminal	Interproscan
IPR036890	Homologous_superfamily	Histidine kinase/HSP90-like ATPase superfamily	Interproscan
IPR039028	Family	PDK/BCKDK protein kinase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11947	PYRUVATE DEHYDROGENASE KINASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004672	Molecular Function	protein kinase activity	Interproscan
GO:0004740	Molecular Function	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) kinase activity	Interproscan
GO:0005739	Cellular Component	mitochondrion	Interproscan
GO:0006468	Biological Process	protein phosphorylation	Interproscan
GO:0010906	Biological Process	regulation of glucose metabolic process	Interproscan
GO:0016310	Biological Process	phosphorylation	Interproscan
GO:0016772	Molecular Function	transferase activity, transferring phosphorus-containing groups	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-