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Detailed information of MBSQW58_g17108 in Bathyacmaea lactea Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
MBSQW58_g17108	ALANINE RACEMASE	ctg2000	14895	22304	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

MBSQW58_g17108

Transcript

MBSQW58_g17108

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00842	Ala_racemase_C	Alanine racemase, C-terminal domain	Domain	Interproscan
PF01168	Ala_racemase_N	Alanine racemase, N-terminal domain	Domain	Interproscan
PF01424	R3H	R3H domain	Domain	Interproscan
PF01464	SLT	Transglycosylase SLT domain	Domain	Interproscan
PF13437	HlyD_3	HlyD family secretion protein	Family	Interproscan
PF14804	Jag_N	Jag N-terminus	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000821	Family	Alanine racemase	Interproscan
IPR001374	Domain	R3H domain	Interproscan
IPR001608	Domain	Alanine racemase, N-terminal	Interproscan
IPR008258	Domain	Transglycosylase SLT domain 1	Interproscan
IPR009006	Homologous_superfamily	Alanine racemase/group IV decarboxylase, C-terminal	Interproscan
IPR011079	Domain	Alanine racemase, C-terminal	Interproscan
IPR015946	Homologous_superfamily	K homology domain-like, alpha/beta	Interproscan
IPR020622	Binding_site	Alanine racemase, pyridoxal-phosphate attachment site	Interproscan
IPR023346	Homologous_superfamily	Lysozyme-like domain superfamily	Interproscan
IPR029066	Homologous_superfamily	PLP-binding barrel	Interproscan
IPR032782	Domain	RNA-binding protein KhpB, N-terminal	Interproscan
IPR036867	Homologous_superfamily	R3H domain superfamily	Interproscan
IPR038008	Domain	Jag, KH domain	Interproscan
IPR038247	Homologous_superfamily	Jag, N-terminal domain superfamily	Interproscan
IPR039247	Family	RNA-binding protein KhpB	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR30511	ALANINE RACEMASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003824	Molecular Function	catalytic activity	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006522	Biological Process	alanine metabolic process	Interproscan
GO:0008784	Molecular Function	alanine racemase activity	Interproscan
GO:0030170	Molecular Function	pyridoxal phosphate binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-