Gene detail

Detailed information of MBSQW58_g11176 in Bathyacmaea lactea Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
MBSQW58_g11176	ANKYRIN REPEAT PROTEIN	ctg378	274434	281027	-

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

MBSQW58_g11176

ATGCAAACACATATTGCACACGAAAGTGCAAATTCAGAACGTCTACATATCAGCGAAGAGATTGAACGCGTTTCAAGTTCTCTGTATTTCTGTTGGGATTTAACTTGTATATTACTGCGCTTGTCAACAACGTCAAGGTACGTCATTAACTTCACATCTTACCATTGTTTAATTCCAGGTAAAACTGCTCTGGTTCGGCAAAATCACACAACCAAGCCACCATTAGAACATTCAGCAAATGTTGAAAGTAATGACAACGGAAGTCGTCACGGGTTTAGCCATGGTAAAAAGAAGCCTACCAAACAGCTCTCACAATGTCTGGAGAATCTAATAAGTAACGCCAACAACTTCCTCAAAGTTGACAAGAATAAGAAGTTTGTTAAAACAACTGCTTATAAAAAAGGCAAGAGGAGCTTAGAGTGTAACTTTCGATTAGGAATAATCGGGAGACCTTGCAGTGGAAAATCATCTTTGATTAAACAAATAATTAGAGATTTCATAAATGCAAATGCTACTGTGCAACTGCAACCAGTTTATATCTCTGGACCTCAACAATTAACTGAAGTTCCTTTGAATGATAAAGGCATTGTATTTTTATTAATAATACCTGATATATTTGGAAAATATAATTTTTCGGATGATTTGTATGATAGGTGGTCAAGAGAATTTGATAGTCTAGACAAGTCAGTGAAAAAGCGTAAAATTGCTATCGTCTTTACCTCAATAACTTTGATTTACAATACATGTAGTATATCTTTGAAGTCTTCATTTTTATTTAAAGATTTGTTGTTCCTTCACGAACAACAATACCGATTAGATGAAGTGACTAAGCAGAACATATGGGATATAAATTCTATAACCGGAGAACCAAAAGACGTATCTGATATAGGATTCTTATATCACATAAAACATAAAAAACATGAACTACACAATTTTTTGATTGATGAATTAGAAATCCTTGAAAAACATAATAACAAATTGTACGTTGCACTACTTGTTGTTCTGCTAATAGGAGAAAAATTCAATACACCACCCAATTCCAAAGAAGACAGCAGACCATTTGATAAGCTTGATATGAAACTCCCTCCGATAAGTGAGGTAAAGGGCCTATGTGAAATTTTGAAAGACACATATTTGCATTTTAATGATGATGAAGTTATGTTTATGGAACCATGCATTAGTAACACTCTGATTAAGTTAGTATTCAAGAAACCAAAATATCAAAGTGAAATTTTGTCAAGGTGTTCTCTTAGCGTGCTATTCAATATGGTCACCACAGAACAATCCGAAGAATCTAAACCATATACCACATATTTACCTATTTCGAAATTAAAGCCTTTGGCAGAAAGATTAAAAGCTGACATATGTGATCACGATGATGTTTCTAGAGTGTTGATTTACAAAGGTTTACAGAAAGGTTCACTTATTGGGGGCATACTTCAATATTTCAACAACAACCAATGTAACGCTATAACTAGGCGCTTGTTCCCAGAAATATGTATTTATGGAGATGTCAAGGGTCTAGAAAATGTTATTAAGTATGTTTCAAGCTCTGACTGTCTTACTGATTCTTCGGGAACCCCACCAATTAAATTGGCTTTGAATTCTCCGTTAGATGCTCTTAAAAAAATAGAAGTGTTGATAAAAAATAATTTCGATGTAACCGATGTTGACTTTCAAGAACGAAATATTTACCATCTTGCCGTGGACTACCGTGATAACTCCGTCTTGGAATTGTTGATCGATAGTTACCCAAATTTGAGTCATTTAATTGATTTGGAAGATCAGAAAAAACAAACTCCTCTTCACGCTGCATGCACAGAAGGAAATATTTATGCCATCGAATGTTTTGCTCAAAGATGTAAAAACATCAATGTGACTGATGATAACTACAAAACACCACTGCACCTCGTCATGGATGGTTTTGACGGGAACATCCGTATGGTTGAATTGCTGATAGAACACGGTGCTGATGTTAACTCAAAAGACGATAACGGCCGTTCACCTCTCCACGCGACTCGTTATTGCAAATCAGGAAGCTCGGATGTCATATGTCTTTTGGCTGAAAAGGGTGGTGATATAAATCTGCAAGACAAAGAAGGTCTAACACCACTGCACCTAGCCGCTAAATCTGGCAATGATGCAGCAGTAAAAGGTTTGTTAGATAACGGTGCAGATGTTACGATTGTAGATGATGAACATGAAATGACTCCACTAATATTTGCATGTAGTGTAAATACCGAAGACTCAGACAAAATTGTTCAATTACTCTTAGAAAATAAATCGAGTGTGAATTGCACAAATCGTTTCGGTGAAACTGCACTTCATGAATCTGTGGAATCTGGACAAATTAATGTTGTGCGTTGTTTGTTAAAATATGGAGCTGATCCCAACTTTGTTTCAAGAAATGATAAAGCACAAACACCATTACATACTGTAGTGAAAGCCCCGACAATCCATGCATTTGAACTTTTTAAGATTCTCATTGACAACAAAGCTGATGTAAATAAAAAAGATAACCGAGGTAACACGATATGCAATGTTGCTAAAAAAAACAAAAAACTGAGATTGTTGTCTGATATTGATAACTATTTAGTGTCTCATAATAATAAAGAATCCATTGAATGGGTATAG

Transcript

MBSQW58_g11176

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF12796	Ank_2	Ankyrin repeats (3 copies)	Repeat	Interproscan
PF20720	nSTAND3	Novel STAND NTPase 3	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001995	Domain	Peptidase A2A, retrovirus, catalytic	Interproscan
IPR002110	Repeat	Ankyrin repeat	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR036770	Homologous_superfamily	Ankyrin repeat-containing domain superfamily	Interproscan
IPR049050	Domain	Novel STAND NTPase 3	Interproscan
IPR050663	Family	Ankyrin Repeat and SOCS Box	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR24193	ANKYRIN REPEAT PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0000976	Molecular Function	transcription cis-regulatory region binding	Interproscan
GO:0004190	Molecular Function	aspartic-type endopeptidase activity	Interproscan
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	Interproscan
GO:0006508	Biological Process	proteolysis	Interproscan
GO:0045944	Biological Process	positive regulation of transcription by RNA polymerase II	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
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