Gene detail

Detailed information of HS03472 in Pseudoliparis swirei Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
HS03472	U1 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN A/U2 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN B	chr4	32326253	32334613	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

Transcript

HS03472

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00076	RRM_1	RNA recognition motif	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000504	Domain	RNA recognition motif domain	Interproscan
IPR012677	Homologous_superfamily	Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily	Interproscan
IPR034787	Domain	RBPMS2, RNA recognition motif	Interproscan
IPR035979	Homologous_superfamily	RNA-binding domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10501	U1 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN A/U2 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN B	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003723	Molecular Function	RNA binding	Interproscan
GO:0003729	Molecular Function	mRNA binding	Interproscan
GO:0042803	Molecular Function	protein homodimerization activity	Interproscan
GO:0051151	Biological Process	negative regulation of smooth muscle cell differentiation	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
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