Gene detail

Detailed information of CsqKR_Scaf4_12.26 in Chrysomallon squamiferum Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
CsqKR_Scaf4_12.26	UBIQUILIN	chr5	2757023	2772112	+

Gene Structure

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CDS

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CsqKR_Scaf4_12.26

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	ULD\|UBL\|NEDD8
Ubiquitin Family	UBD\|Alpha-Helix\|UBA
Ubiquitin Family	ULD\|UFD/UBQ\|UBQ_Other
Ubiquitin Family	ULD\|UFD/UBQ\|UBQ_PIM

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00240	ubiquitin	Ubiquitin family	Domain	Interproscan
PF00627	UBA	UBA/TS-N domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000626	Domain	Ubiquitin-like domain	Interproscan
IPR006636	Domain	Heat shock chaperonin-binding	Interproscan
IPR009060	Homologous_superfamily	UBA-like superfamily	Interproscan
IPR015496	Family	Ubiquilin	Interproscan
IPR015940	Domain	Ubiquitin-associated domain	Interproscan
IPR029071	Homologous_superfamily	Ubiquitin-like domain superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10677	UBIQUILIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005515	Molecular Function	protein binding	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006511	Biological Process	ubiquitin-dependent protein catabolic process	Interproscan
GO:0031593	Molecular Function	polyubiquitin modification-dependent protein binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for CsqKR_Scaf4_12.26 global RNA-seq network