Gene detail

Detailed information of CsqKR_Scaf490_5.32 in Chrysomallon squamiferum Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
CsqKR_Scaf490_5.32	NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP93 NUCLEOPORIN NUP93 DEAD EYE PROTEIN	chr3	18321344	18338529	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

CsqKR_Scaf490_5.32

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Transcript

CsqKR_Scaf490_5.32

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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF04097	Nic96	Nup93/Nic96	Repeat	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR007231	Family	Nucleoporin interacting component Nup93/Nic96	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11225	NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP93 NUCLEOPORIN NUP93 DEAD EYE PROTEIN	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0005643	Cellular Component	nuclear pore	Interproscan
GO:0006606	Biological Process	protein import into nucleus	Interproscan
GO:0016973	Biological Process	poly(A)+ mRNA export from nucleus	Interproscan
GO:0017056	Molecular Function	structural constituent of nuclear pore	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for CsqKR_Scaf490_5.32 global RNA-seq network