Gene detail

Detailed information of CsqKR_Scaf19_16.40 in Chrysomallon squamiferum Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
CsqKR_Scaf19_16.40	ASPARTATE AMINOTRANSFERASE	chr8	26142534	26150379	+

Gene Structure

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CDS

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CsqKR_Scaf19_16.40

CATTCACCGACCAGCTACCTTGACCTTCGAATAGCCATGGCTTCTCAAACAGATTCATTTTTCAGTGATGTTGAAATGGCACCTCCGATTGAGGTGTTTTCGCTCATAGACAGATTTAAGAAAGATGATCATCCTAACAAAGTTAACCTCAGCGTGGGTGCCTATAGAACAGAAGAAGGTAAGCCATGGGTTCTTCCTGTGGTCAAAGTAGCAGAGGTTGCCATGGTGAGTGACCACACATTGAATCATGAATATCTTCCTGTGGCAGGACTAGAAGATTTCCGAGATGCCTCATGCCGTCTGTTGCTTGGTAACGACAGCCCAGCTATAATTCAGAACAGATATCTAGGTATTCAGAGTTTGGGTGGAACAGGTGCCATAAGACTTGCAGCAGAATTTCTGAAGAAAGTCCTCAAGTATAATACCGTGTATGTCTCAAAACCAACATGGGGTAATCACAAGGGAGTATTTAAAGCTGCAGGATTTAGTGAGATTAAAGAATATCGTTACTGGAATGAAGAAAATAAAAATCTGGACATCAATGGAATGCTTGAAGATCTCTCGAATGCACCAGAAAAATCTGCAGTAATTCTGCATGCTTGTGCCCACAATCCTACTGGTGTTGATCCAACACGAGAACAGTGGAAACTCATAGCTGATGTCTGTGAGGCCAAAAGAATATTTGTTCTCATTGACTGTGCATATCAAGGTTTTGCTAGTGGGAATCTTGACAATGATGCTTTTTCACCAAGATACTTTGCTGAAAGAGGTTTTGATTTTTTTACAGCACAGTCATTCTCCAAAAACTTTGGTTTATACAATGAGCGTACAGGAAATCTGTGTGTGGTCACTCGATCTCCAGACGTGAAGGCCCAGGTGAAATCACAGTTAGAGATTATTGTTCGAACCATGTACTCAAATCCACCAAACCATGGAGCTCGTATTGTAGCATCGGTTCTCAACAACAGTTCTCAGTTTAATGACTGGAAAGACAATGTCAAAACCATGGCTAACAGAATTCTGAATAACCGAAAACTTCTGTATGACAGACTACGAGCAAAGGGAACACCAGGCAGCTGGGAACACATCATTCACCAGATTGGAATGTTTTCTTTTACTGGCCTTGGACCTTCTCAAGTGAGCCATCTAATCAACAATTATCACATCTATCTGATGAAAGAAGGTGGACGCATCAACATGTGTGCAATCACCTCAAAAAATGTAGATTACATCGTCGAGGCTATTCATGATGCTGTAACTACTGTTCCAAAGACATAATGTGATACTGGATTAACATCTTGGATGATTGACATTTGTTTGTCCATTTAGATATACCGCAAGACTTCCAAATACACTTTTATTTTAAATCTAGGACAGTATACTTAATTATATTGTACTTGTGAACAAGTTGTTGTCTTTAAAACAGCAATGATAGGTTTTCTTTACCACTTAGGGTTTTTTGCATTTTAAATGAGTAATTTAGGGAAAATATTTAATTAGTCATAAATGATTTTTTTTCCCTCCATCATTTTTTATTTCTAATAAGATATCTGGTGGAACAGTATCATTTAATCAACAGTTGGACAGTTATTTATCTGGTAAATCAAACAACAAAACCACTGTCATATCTATCAACCACATCTCCATAGATATTTATAAATATGTTTATTTTAATAAGATATATAAGTATTATAGTTACAGTTACAAGTTGTTTTCTGTTTTATTTCAGTTAGCATGCAACAATCCACGCGAACAAGAAAAGCACATATCTGGGTCTTGTGTCATAAATTTGTTTTCAAAATACTGAAATTTTTAAAAGTATTAAATTTACTTACAATGAGATCTGAATAATGTCGGATCATTATTAAGAATGGTTTACATATACATTTGTATAATTAATAGTTAATGATGATATACATATTTTTTGTTGATGATAGCAAAGATCAATGTTTTAACTTATTTTTATTTTAAATTAATCTTGTATAATATATAGATTTGAAATGTCACTGGTGTACAAATATTAGAACAAACGTGAACAAATAAACCTTTCAGAGATTTTCTAATCAATTATGTGACTTGTATTAATCAAGAATTAATGTATTTGTAATTTAAAACAGATGTTTATCAAGATTTCTAAAGCAGTCCAGATTTTAGTCTGATTTGATTCCATTTTATTGGGATTTACATAAATTAATTTGATAATAGTTAAATTATTCATTTTTGATGATAAAAAGTAATTTTTGTGTTTATAATATCACATCAAATCTGTTTTATTGAAATTTAATTAACATTTTAAAATAATTTGAGGAAAATAACAACAATGAAGCTGTTACAAATTCCAAATTAATTTGTACAGAGCAAATACTGGTTGATAATAGTGAGAATGCATTTATGACTATGCAGTTTATATGTTTGTCTTTCATTTTAAATATAAATGTATTATAAAGATGTAGATATCCTCTAGTCTTTTTCATTTAACTTTATAAAATAACAAAGTTATATATTCATTATAAATAAAAAAACAAAGTTATATATTATATAGAACTTAAATTTATTTAAATATTACACAGATAACAAACAGAAGTTGTGATAATCTTCTTGCCACAATTTACCAGATCTAATGCTCTACAATTTACTATTTATTAATGTTGATAGTTAATACATTTTACAGGATATTTTAACAATAATATAAGTATACACAATTATCTATTGGTTTTCTTCAGATACTTGTTTCAAAATGTTCTAAAATTTTGTTTATTAAAAAAAATATGTATGCATTTTGTTTTTACTAATTATTTATTTTAATTTACTATTGCTTTTAATATTTATTCAACTTTATCTAATGCTTAACATTTTAAAGCATAATTTTGTTTTCATTTAAAACCACTGTTCCAGCTTTTCATGATCATGTTTCTAAATGTTTTTGTGTTTGTGTGAAACCTTTTAGTTGCAAACATCACCTGTTACAAACAAGTATTTATACTTTTTGCTTGTAGAAAATAAATTATTGTACTGTTCATGTCTTGTTTCAGTGTTTTGTGCTACTACAATGAAAACATTTTAATATTAACATTTATTAGATATCAAAACATATTTATTTATAATGGTGAGTTAGGACACTTTCTGATGTGCTTTTTGTCAACCATTTCTCATGACAGAGATCACTGATCATAATTGGAAATGTCATATGGTGCACTTGAATACAGATAGCCCGTCATTTTATTTAATTTTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGAACAAAATAAAATTGAATACATTTTCCATTTCCATGTTTATTTACAATTCTGAATGTTATCTACAAATATACAAACTAAATTGTAATTTCAAACTCAGGCTAAATAAGCTCCATTTTAGACACAATCATTCTTTCATTCTTGTTTATGAAGAAAAAATTAAATATGTATATTTCAGTTTGTAATGTACCTATCCTAGTAGGAAAAATAAACATTGAAAGAGATCTATGATTACAGAGGTGTATATAATGTATCTCTGTATATACAACTGTATACTGAGGCATATAATCTAAATGTATAAAGGGCAGTACAAACACATTCAAAGGCTTTTAGAATTAAAAAGAAAATCACTTTTCTATAATTTAATTCAAATTTGGCCTTTTAAACCAGCATCCTGGCTGTAAAGGTTATATATTTATATAAAACTGATTAAAGAACAGAAAGACTTTTTTTTTTTCTTTTTGCACTTGTTTTTAATAAAACAAAGACAATATGGTTACCACAATATGTTTCTACCAAGATATGTTATTGTTAATTAACACATTAAAATAAATAGCATTTATATTTTTCTGTTTTCTTAAATATGAACTTTATAGATGATAATTAAAAAATATACATATATATTGATAAGCTAAAGTTATCTTGTGTATAGTTTTACTTCAAAAAAGTACTAAAAAGAACTGTTATTTCATCTGAACAGTTTAAAATATTGTCAGTATCATTAATGAGGCTTTAAAAATGTTTTCTTGTGCAACACTTACAATAATCATTTTACTGAATATTTTTACAAATGTTTTTGTAATTAATATTGGTCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTT

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00155	Aminotran_1_2	Aminotransferase class I and II	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000796	Family	Aspartate/other aminotransferase	Interproscan
IPR004839	Domain	Aminotransferase, class I/classII	Interproscan
IPR015421	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain	Interproscan
IPR015422	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain	Interproscan
IPR015424	Homologous_superfamily	Pyridoxal phosphate-dependent transferase	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR11879	ASPARTATE AMINOTRANSFERASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004069	Molecular Function	L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase activity	Interproscan
GO:0005829	Cellular Component	cytosol	Interproscan
GO:0006520	Biological Process	amino acid metabolic process	Interproscan
GO:0006532	Biological Process	aspartate biosynthetic process	Interproscan
GO:0008483	Molecular Function	transaminase activity	Interproscan
GO:0009058	Biological Process	biosynthetic process	Interproscan
GO:0030170	Molecular Function	pyridoxal phosphate binding	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for CsqKR_Scaf19_16.40 global RNA-seq network