Gene detail

Detailed information of CsqKR_Scaf117_10.15 in Chrysomallon squamiferum Gene info

Gene ID	Annotation	Chromosome	Start	End	Strand
CsqKR_Scaf117_10.15	CILIA- AND FLAGELLA-ASSOCIATED PROTEIN 61	chr1	5989726	6018848	+

Gene Structure

More details in Jbrowse Sequence

CDS

CsqKR_Scaf117_10.15

ATGACAGCAAGTTCTGCTGATGGTCAAGCAGAGGTGATAAATGCACGAAGGACTGAATCTATTGATGCTCCACATATCAGTGAATTGGTAACACATCAAACTCAAGAGTTATTTGGGCGAGTGAATGTTGTTAACCTTATTGAGAAAGCTATTTTAGCTGTGACCCTTTGTAATGAGAATGAAGAGATTCTTGGACATGCTGCATTTTTTGACTATCCCAACATCAAAGAGGTTGATCAAGCAGACTGGGAGAAATGGCTTTTAGACAATTGTCAGATGAGAGGATTTAGTGCACTCAATACTCTCTTTATGCATTACTTTGTGGCAAAAAATGAGTATGCACATGGCTGTGCTCTTGAGATAATGCGAACAGCATTTAATGCTGTACCTGATCTACACTTTCTGTTGTTAGTTGTACCAAGCAATGTGTTTCCAGAGCCTGCTATTGCAGATGTCTTCAAGCCACTTCCTAAACCACAGGATTCTCCTGGAAATACCAACTATGTGGTTTTTATTTGCAACAGACATGAACATGTTCCAGTTCTACACATCAGACATGCAATTGTTGAAGATCATGATGACCTGACACCTATCTTCAACCGACACAGTGACATGATGAGAAAAACTTATGGAGAATATTTCTTGGCTGAACTTATTGAAGCACAGGATGAACACATGCAGTCATTGGTTGCTGAGGTGGATGGCTTTGCACAGGGCTTCATGAGTATTAGTGATGATGTTAACTATGACTTGCTCAATGAGTGTTTTGAACTTGGACCCTTCCATGGACTTCGTAAACCACACCCTGATGATGAACTAACACCACCAAGAACCCCCACACCAACATCTCCTCCAAGAAAAGAAGAGAGCGCCAGTCGCCCAGGATCTGCTGAATCATTTAAGTCGGCAGATTCAAAAGTAGAAGTTGACGAAGGCACTAAAGTTGAAGAACCTCCTAAAGATGATGCTATACCTGCTTCTGGGGATGAGGGAAAAGAAATAGAAAAGGCTGACAGTCATACTTCAAGTGCAAAAAGTTCAAGAGCTGGCAGCACTTCTGATGTGAAGATGAAGATGCGTCTCAGTGATGCTCAGATTGGTGGCAGTTCAACCTCTCTGCTCAGTGAGGGAAGTCTGACAGCTGCTCTCAAAGAGGCTGTGGACCAGCAGCTGGTCACCCAAGACACACAACCTTCAATGACATCTGGTCGTATAACTCCAAAAAGATGCATGAGCCCACCAAAGCAGTTTGTTCCACAATACAAAGGTGCGCCTAATGCCTTCTGCGTTCAGCTTTTTTGCATTGATGAGAAATATGAGATGAGATCATCAGATTTTATGTACAAAGCATTCTCACTTTTTCCTGACCTAGAATTTTGTGTGGTTTCTGTTCCTCATCTTGTTCCAGAATTTCCTCTGCTGCAGAGTTTTGTGCGAGTGACTCCAAGATGTCGCAGTACTTTGCCTCATGAACTCTATGTGTTTCACAAAGGAGGACTTCTCAGAGACATCAATGTACGACCAGCTTGTACACGTGATTTACTTGCTGTTACCAATCTTGTAGAGACTGTGGATCTGCATGAGAATCTTATCAATGACTTTAAACAGTTCTGTAACTGCAGGCGTGATCCAGATGGGACACAGATTCAAGCATTTGTTGCTGAGAGTTCTGTTCAGATTATTGGAGTAGCAATCATCAGAAGAGAGGAGAACATTGAGTATATTCGTTCTCACTACAACATTGAGGACTTCATTTATTACAACCACCACCGACGTGATGAACATGCACATCTGCATCACTATGCACTGAACCCAATTTTTAACCATCTGTCCAAACATTTTCTGAAGGAAATTCTTCGTTTAGGACACAAGACTTGTTTGTATTACCCACTCTATCCATCCTATACAAGTAAAGAGATAGTGGAGAAACATTCTCTGGTTTGTTCTCTGAATAATCTAGTGCCAGTGAGAGCTCGGCGACAGATCCAGTACCCATTGAAGGATCTGGGAATCAATGCACCATCAGAGAGAGTTCTTAAAGAACATGAACCCTATGCACTTAACCACATCAACAGGAAACTTGCCTTGGAGCCAAAAGTAACAATAAATGCTAGGATTGTGGTGATTGGTGCCTCTGACGTTGGGATATCATTTCTTGAATCTTTGGCTTACTGTCCTCACCTGAGATTCAACAATCTCTCTCTGATTTCTCCACATGGAATGCCAGGAGAAATGCCTCCTGATGAACTGCGGGAACAGATGATGTCATCCAGTCACTGTTACAGCCAGGATGAATATGCTAAGATTGCTCTGAGAACCTGGGTTAATGTTATTTATGGAAAGATGACAGCTATTGACAGGAAAAGAAAACAGGTTCTGGTGAATGATTCATTGATTGTTCCATACGATCATCTCATATTGTGCACTGGACAACAGTACCAGATTCCTGCTCCAACTGGGGCTGACCTCACAAAAACTGTCACCAATGATGAATTAATAAACAGTCCATCATACAGTGGAGTTCCTCTTCAGAATCTGTTCTTGATTAATGACTCGTTTGATGCTGCAGTAGCTCTGTACAGGACTGAAAATGACCTCAGATCACCAGAGAAGAAAGCTATTATCTATGGTTCAACTCTTGATGCTTACACCTGCATTCAGGCTCTCTTGTCACTGGGTTTGCCAACCAGTCAGATCACATGGGTCCAGCCACCACTGATTTATAAGACAACTTGTATCAACAACCCACCAGTGGAGGAGTGTGTATACCAGGCTGTGGTTAACACTGGCATCAAAATCTACAGTGGATACATCCTGGCACAGTACAATGATGGTAATGATGACAGTCCCGTCATCCATTCAGTGACATTCACATCTACCCGAGAGCCTCTGAAACTGGAGTGTGATGCAGTTTTTGCATTTTATCTGAAGGGAGTGGATAATGATGCTTTCAAAGCTATCAATGATGCCTGTCTGGTTTATGATGGTAAACTGGTGATAGATTCTTCGTTCCACACTAATGATGTGTCAATCCGAGGTGCTGGCACTTTGACTAAATTCAAACGTAAATACCATGCTGAACCATGGACCCATGCAAACTTCAATTCCAAGGAGGTTGGAATAGCGCTTGCCAGTGAAATGTTGAGGCTGTTTGATCCTACCGTTGAATGTAGACAGGCTCCACCAGAGGAAACACTCAACTTGATCCCTATCTACAGAAACCCTAAGATACAAGCAGCTTACCTCCCAGGTGGATTCCATTACCTTCATATTGCTAAGCCAGCTCTTCCAACAAGCCTTGAAATACAGATGTCTCAGGCAGATTATGGTCGGGTAAGAACAACTGGAGAGCTTGGATCAGAACCCAATTATTTCCGACTACACTTCAGTCAGTACAACACCATAGAAACAATTACTTGTTTGTCCAGAAAACCAATCCCATCATCAAATATAATTTGTTTGTATGGTGTCCATGAACGATACTTGAACAATCTGTTACAGAGATTTGATGAAGGTCTCATTACTGACTTCTACACATTTTTCCAGGAAACATGGTGTTTGGCAATCTACCATGATCGCTTCCCAGATTTTAGAGATGAGATTCGTGAACTACTTATTACCAGTCCTGAGGCTAATATTGAAGCACTGGAAGAGAAAGTCCGTCAAGTTGTGGATGATGAAATTACGATGGCACCTGCACAGAGGAAGGAGTTGTTTGATGCATACACAACATCTGGTGTCAAACGTGCTGTGGAAACTCGCCTCCTCAGCTTCATCAGCTACAACTACTACCACCTGCCGATGTATGCCAAGCCAGGAATGGTGTGA

Transcript

CsqKR_Scaf117_10.15

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ATGAAAAATTTCTTATTATCATTAAATTATTAAACATTTATTTTAAAATTTAAAAAAATGGAATAAAATAAAGTGTTTGCATTTGAA

Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF07992	Pyr_redox_2	Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase	Domain	Interproscan
PF16092	CFAP61_N	Cilia- and flagella-associated protein 61, N-terminal domain	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR023753	Domain	FAD/NAD(P)-binding domain	Interproscan
IPR032151	Domain	Cilia- and flagella-associated protein 61, N-terminal domain	Interproscan
IPR036188	Homologous_superfamily	FAD/NAD(P)-binding domain superfamily	Interproscan
IPR038884	Family	Cilia- and flagella-associated protein 61	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR21178	CILIA- AND FLAGELLA-ASSOCIATED PROTEIN 61	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0016491	Molecular Function	oxidoreductase activity	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
-	-	-	-	-	-

Expression pattern

1. Expression trend for CsqKR_Scaf117_10.15 global RNA-seq network