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Detailed information of Clavulariidae_g15525 in Trachythela sp. YZ-2020 Gene info

Gene ID	Annotation	Contig	Start	End	Strand
Clavulariidae_g15525	RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE	ctg000307	857586	876490	-

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CDS

Clavulariidae_g15525

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Clavulariidae_g15525

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Protein

Clavulariidae_g15525

MADNFTNHSSWWLECISCQKQVINASDLRLAQVGKDGGFHLALRPELEPRIDLKILKRQHPKPERRKEAPFKMYCLKAGCPKDLGVYQLLEERFFYVFSSKSVRFRSASGEVAKIKRWKESKAELERMGVQVLQVKALWQTISKQAADGTGTPRNATEMIYCDATRTSDEQVNKLVLDTPREYQKELFRKAMGGNAIVYLPTGSGKTLVASMVINAMSKLNPGKMAAFLVHRIPLVYQQSEYIKKQNPRLRVEILAGDLTRFPGDKEHWVQVIQKIAQKRIDVLVITAQIFYNFLSDDDATLKLSGVSCMVFDEAHNCKGNHVFAQIMRKFYDPLSDRYKPLVLGLTASPAGASTIEETREQLTILLTTLRARCIMPTLSNDLALHWNNPVTSYECKPLSYTQESLESILVNYIQSICPKIEQLSNMQEALTKTPASSINFKGCLRTVIDRCHSKEEYIQGLALALHAMNMYSIIELNRVLGPSHAYDALNGIFQAVDHVRSPMDMVTKRLLQTQPSYPAFRIQINSFLKCSNVASGRFTELLKIVRDFVDHVRKDNTSRAIIFVHMRRTCFKLHEELNKDAVIKEKLKPLACVGHGNGLDGMQWKGEQEVVITRFHEGDCKLLVSTNVLEEGLDVPACNLVIRYDSRGTNLRALVQSRGRAARRADSRFVIMCNSEEEKQRYLDLAVKEANIEGAVREQVATNSSTSQATRFGCKQRPIGPEAQAVEKRKAPEEHATTSKKPRTQRPRPKACALLTLHVSPSAEISEAIDFLEDYFDITSFRPDGATGKEEKRVDQLNRMVRTFIDVKEITQPGEEDANKKPKSRDEISQEIVKKWCKDGPQSLWLERRGQPRNRGVSVHPLFLTGIGVGDFQDRGTFAEEWFHLCHPGGMVIFEHDLKNVTVAFQNREEGNIFKVEFQYKEIHDCVLVDTARPGTGKCSIFVPLRSVPRVLEAEGFYSKEGDTDEDSRLFELLEQGEILSDSDDDWSMDSDSDNEMNQRSHSHDASTANVGLENESTPETGTEIMGKLKQVTKWKRLNQIPIGRHVPNESSSRGQAEDFKPIFQELKQNEVKKCVDALSRITVLLDENYFVDPEMTLEYLLQNSKSLGRRKLVVPQNCVLIPRMVFTPTREIYFPHEVMEKNRVLRDFHELDFLCLQIRDEDFSRFATHTGNIGEILTRLKQLLKNGVEVGGKFYQFLGSSNSQLRSHSCWFVSPTAQHNATTIRQWMGDFSQIRCVATLMARMGQCFSTSTDTITVVPQETGIEFEDIDDITIVADDQTYTFSDGVGRISSNVANKVSLLIDKKLPPSAFQIRFAGYKGVLTTDPRIQDNLIQLRPSMRKFQSNHRRLEVLQTSRPQAVYLNHQLIMLLSNLGVPDEIFLRHQEKMLDALAYMMTDEDEANQRLSCAIRTGINYQALSDVGVCLTTEPYFRSLLCALYREKIYGLLSKARILLPVTEARLMMGVMDETGLLKSGQVFVQSTAMRSEGDENFVANITTVVKGKVVVTRNPCLHPGDVRQLEAVDVPDLRHLVDCVVFPSKGARPHPNEMAGGDLDGDIYFVCWGKDMLPRKPDFAPMNYKAPKKKEESGTINLGHMTEFISEYIKCDQLGIIDNTHKAQADAQGTGVESALCLQLAELHSLAVDAPKTGLWQEVPVTARLREYPDFMMKSDKPSYPSQKILGKLYRECRNFQESMNFRPPRKTGHVDSSFLAQGFEEYVESARETLTEYTEHIENVLNLYGVQTEEELMSGCFYKLQKKLGRERQQVADVVRRLMTELRTIFRREFFNEFRRNHTPLTKLEVTAEMQKKASAWYYVAYQSEQNTTNSEQQPKRFIGFPWIIDDVLVTIPLANKRSPKQGISEKNAYSALEYSLGEFFAKQAERLMEGYEHRLQVRSVIQNAIKETSRVNGLVMFGSSATFFFEDTSDIDLCAVASNESGCVLRKDALKLASNISQPDQLTLLRKLEPLLRRVYNGVHLVRAKVPIFRLAGLKSKEFGSKLCADLCANPDGFLKAMVVSWYTHKYPSLLPLLRMLIQWGRDSGLISKREGCLINTNVLVFMLLSFCVRAGWVAEPAVDDIRGDVENIARNKIKDVELVSKWKETLALLLDNTPESAAEQLPDENDVMEDIEEYQHRHFKLGPRNTPLGYVLLEFFRRHQSLLDSNIPEAFVGLLGTDQFQSLLGEGDSQLLHDQMQRAYHILALHCDVTVLLEVCSSKVQISCHLTDQLSAWIAGSEGHHSKLFSEKSGAKVRIRPRLPGLGTNLLLEASGTAVALRVLENLLDDKSASLISQPFSCLGMCFVSEANVMIFEGSQSDNDPVNLVPYYGRHHPHHDYLVRHVPLLGNATLTTSIADPEERSFRIFFDKLLRQLEVVARDYTPIVHGGILEFNVHFGRLYTFHVPRSLTEDTDPTTVKTIQISLKKGFESKAACLMSLQSTSPTKKLFRLPFKRRKNRKPETKKDDQKGGRKNEKRSPKHSFFTNIPKECVANIITYLERRGFTEDPNLGSPYLLVTVNADDGRECDITYDSDIRPKYVRSPKLRWFVTDVKRPWQERSVVADQEFAPDMLNGSECDLRLMVRSFENFLPSAVDNLPQKKFLDILKPKTDPQPGSASSYPFLINLDFKNNVSIIRHHVEQRVFTRKPDNSDRQSEFLASTTVSFDEVDEYSRLKVNGRFESVFKRYEMTIQPQIPANWTSRDEMEKFALNVWSLANEIARQAYQ

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF00270	DEAD	DEAD/DEAH box helicase	Domain	Interproscan
PF00271	Helicase_C	Helicase conserved C-terminal domain	Domain	Interproscan
PF05183	RdRP	RNA dependent RNA polymerase	Family	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR001650	Domain	Helicase, C-terminal domain-like	Interproscan
IPR002464	Conserved_site	DNA/RNA helicase, ATP-dependent, DEAH-box type, conserved site	Interproscan
IPR007855	Family	RNA-dependent RNA polymerase, eukaryotic-type	Interproscan
IPR011545	Domain	DEAD/DEAH box helicase domain	Interproscan
IPR014001	Domain	Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain	Interproscan
IPR021673	Domain	RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain	Interproscan
IPR027417	Homologous_superfamily	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase	Interproscan
IPR038557	Homologous_superfamily	RIG-I-like receptor, C-terminal domain superfamily	Interproscan
IPR043519	Homologous_superfamily	Nucleotidyltransferase superfamily	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR23079	RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0003676	Molecular Function	nucleic acid binding	Interproscan
GO:0003968	Molecular Function	RNA-dependent RNA polymerase activity	Interproscan
GO:0005524	Molecular Function	ATP binding	Interproscan
GO:0030422	Biological Process	siRNA processing	Interproscan
GO:0031380	Cellular Component	nuclear RNA-directed RNA polymerase complex	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
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