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Detailed information of Bpl_scaf_8784-1.20 in Gigantidas platifrons Gene info

Gene ID	Annotation	Scaffold	Start	End	Strand
Bpl_scaf_8784-1.20	PYRIDOXINE-5-PHOSPHATE OXIDASE	Bpl_scaf_8784	247998	258678	-

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CDS

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Bpl_scaf_8784-1.20

GTAGAAAAGCTGAACAACTTCAATGGAACTATGCGCTAGTGCACAATAACAATGTCGAATGTCATTTAATAATATACGGAATTTAATCACTGACCCTCCGATATGTACTCTGTATATTTTAACTTTTTGAAGAAGAGAAGAAGTTCGGCCTCTGTATCCTACATCTTAATGATAAAACACACTGAAAACTGGCACTCCTGAGGCAATTTTTGTTGCGGGTCTTATCTGCGAACAACAGAGTTCCATTAGTACAATTGTCACGTACCATGGCAGATGTAGGTGGAGTATCGGACATGCGTCTACCCTATCGAAGTGCACATGATGTATTTGACGTTGGAGATCTTGTATCAAGAGAACCGTTTAAACAGTTTACAAGCTGGTTTGAGGAGGCATCCAACGCCCCAGACATTGGAGAACCAAATGCTATGGCTTTAGCAACAGCTACGAAGGATGGAATTCCATCAGTACGAATGGTGTTAATGAAAGGGTTTGACAAGAACGGAATAGTCTTCTTCACAAATTATAACAGTCGTAAAGGAAATGAACTGACAGAAAATCCTAGATGTTCATGTATGTTTTATTGGGAAAAGTTCAAGAGAAGTGTAAGAATAGAGGGAAATGTGAGAAAAATGTCCAATGAAAAATCAGAAGAGTATTTTCATTCTCGTCCTCGTCCAAGTCAAGTTGGTGCCGTATCTAGTAATCAGAGCCAGGTTGTAGAAAGTAGAAAGGCATTACGTGATAGATATACCTCTTTAGAAGAAAAATACAAAGATGAAAACATGTTTATACCAAAACCTGACAACTGGGGTGGATATATTGTGACACCAGAATCTTTTGAATTTTGGCAAGGACAGACAAACAGACTGCATGATAGATTAAAATTTAGAAGACTCAAGCCTGATGAGAAAATAAATGAAGAATACACCCATATAGGAGAAGACGGCTGGGTGTTCGAGAGACTAGAACCATAGATATTTTATTTTTTGATTTTATTATCTATAGTATATGATAGATATCCCGGTAATTGTATTCAGATTGATTGTCGTGGGATTTATCAAAAAATTTAGTGCGCACGACACATTTCTGGAATAACCATCATCAGGTATGCTCAATATCGAAAATTTTATCGATAAAAGCCACATCAGGGTATTCCATCATTTTCAAATAGGAGGTGATAATGGTAGAAGGGCAGGAATTTTTCTAGCCTTCCACAAGGTCTGGTAAAAGGACCTTTCCCAATGAAAAATATTATAAAATAATGCAAAATTCACAAAATTTTCATTCTTATCCCCTTATTTTGATCCCCAATTTGAGCAATTTAGATAAAGATAAAGCAATAGAATAACTAGTATACAAAAAAAAGCCATATTTTACTTTCACTTTAACATTTTCATTTTTGAAAACAAAGTAGTCAGGAAAAAATGCAATTAGACAGGCAATTTGCTCTGTTTCTGGCTGCTTTGGAATGCCCTGCAAATAAATACCCGGTAATGAGACTATGCTCTTTTTGAGTTTAAAGTTGTAAAGTTAAACATTTTATATATACTATATATTTTTTTACTATTAGTCAGTGTGGACATGTTGCTCTAATCTATATTTTTTTCTATAGCTTGATATTTTGATAAAAGCACTTTTTATAAGAAAAAATATATAGAATTTTTCAATTGTAACAAGGTACATGTTAAAAGACAAATTGTATTTGTCAGATATTGGTAAAAAATGATTATTGGGAATTAATACCACTTTCTATAATAATTCAATAATATCAATGCGGTCAGAAATATTTTTGGTGTAGAAAACAGGAGTATACGAAGAAATCTACAGACGTGCATCAAGTCACTGACAAATTTATCAGATAATAATGTATCGAGTACACCTCGCCATGTGCAGGATATCAACTCACAACTTGAGTGGTGATAGCCACCGATTTACTACAAAACGACCATGAGCTCAGTGACCCACCTCAGATATAGAAGTACATTTATCTCCCTTTTAAGCCCATATTATTATTGTTGTTTATATGTTCTTTACTCCTTTTGGTTTCTAATTTTACACTTCCGTCATAATATCATGTCACCTTTCTAGTCAATTGTATAAATACCAGTAAGAAACTTTTTTTTAGCCAAAAGCAAGAAAGAAATGGGTCAGTCTTTGAACATCGATCCTACTGTACCATAAATACATTTTTTGCCCGTATAAACTATATAATGTTGTTGCATTGTTTGTGGTATTTGGACGTCACTTAATACTGTGAAAGTACTTTTATTTGTGGGTACCAGTATTCGTGATTTCTACTACATTTATCAGTGGGTTATTGAATTTGTGGTGTCAAACAATATGCAAGTAACAAATCAAAAGAAATGCTGTATTTCGTTGGATTTTGAATTTCATGATTTTAATCTACCACAAATTCCACAAAAATTAGAACCCTAGGAATAATAAGGCCTGTTTTCATATTCTCAAGCTTGTTTATGGTTGAAAACAACCTGAAACATGTTTAAGATAGATAAAAAACACAATGGTTGAACAATATTTAAGAGAAATTTTCTAGTTCATTGATTATTTTTTAACAAAGTAAAATTAATTCTTCATTTACAAATAAAACAATTCAACTCTTAAACATACTGGTCATTAAAAAGGTTCAAACATATTCAACCGTTCTTCGATTCCGGTTAAGATGTTCTTTAACCATTTAACCGCATGGTTAAAACCACATCGAAAAAAAACCGCTCAACCATAAAACAGTTTAAAACCAGGTTAATGGTTAAGAATTAAAAAACAGGCCTATAATATTTTCACACTATGAGTAATGAATTAAGATGTGTTAATTAACTTGCTATATTCTTCTAATAAGACGTCCCCCAATGTAAAACCAACGACACAATATAGCTGAATACTGATAATGTTGGTGTTAAACACCAGTCAATCAACCAAAGTAAAACCACATTTAATTATGGAGATCACATTTCAATTTACACTTTTATTGTTGTTTAATTTTACTTCCTGGTGTGTAATTTTGCAGTATATATACCAGAGGGGACAAACAGGCATGGCTCGGAAAATAGTAGCATCGTTTGATTTGGAAACAAAACCTGAGAGATACGAATTAAATATGTATCAAGGGCACTCATTGGTCAATCTTGACCACTCAGTGTTTTCCATTTTTCAAATAGGTAAGGTGGGTGTTTTCAAAATGTCTTGTCCAGCCGGGTTTTTCGCGTTCCGGCAAGAATGAATATACTGATAGAAAATATTATATTTTAATATACATACATGTATACATGTACATAATTACTCAAATGTATATTTATGTCACTTCTTTTTTGCTTTTGGTTTTTTAATCAATTTGTCCCTGTTATGCTTCCTTTCCTGTACTATTTTATGCATCAGCATTGATTTCAAAACCACTGATTTAAGTTCCCTATTTCTATCTCCACACTTTTTAATTCTGTCCAGCAAAATATGTCTTTTCCTTAAATTGCCCCAGATTTTTAATGTCTCATTGAAATCCAATTCTTCTTCTTCTGGCCCATGTATAGCAACCATCATACGGATACATGGCTTGTCAACCCAGATGTTCCTTGCTTTTGTGTTGTACTTCTGGCAAATAGAACAGAAGTAACCATCATCAGTGACAATCAACCGTTTAAAAGTCTTGTTCATATTTGTCCTCACTTGGCATGTCGGGTTCGTTGTTTGGACGGATTTTTAGAACTTTCCTCGTGATGATCAACCTTGGTCGACTTATTTGGTCTAGGCCCTATAGCTTTCTTTATTTTCGTAAGTTTCAGCTTTACGTTTCCCTCGCTTGATGAATGAAAACATCGAACTTTGACGATCAGCCATTTTTGTCAATGAAAACAAATCAGCGATTAAGTTTTGAGTTTTGACGGTGCGGAACCGAAAAAATCCGGAATTTTCGAAAATTTACCGACCACCTTGTTAAAAGGAAAGGTGGTCGGCTTTGAAAGAAAGGTGGTCGGCAAACCCGGCTTAAACGGCGAATGGAAAACACTGGCCACTAGAAAGTGAAAATAGAAAATGGCCAAATGTTTAGTACTTCCGGCAAACATGAGTAACATGTAGGATGGAAAAAGCCAAAACATAGCTATTAATGATTAATAAAATGACAGTAACTTGATGTAAACTAATTCACAAATATCTATGGATAGAAGTTTGTCAGTTAGCTTGAATTTGAAGAATAAATACAATAAATGTCAAAACATGCTCACTACACTTCTTTCACTCTAAAAAATCATTTATGTCGTAGCGGTCAGTTTTATTGGTCCAGTTAAAAAAAATCAACTTCAATTCATATAACATTGCTTTGTTTAAACTATTAATTAATAAGAAAAATGATAACAAACTACATTGCATAGTATAACTATTGACCAATCAGCAAATTGATAACAATCCACATTGCATAGTATAACTATTGACCAATCAGCAAATTGATAATAATCCACATTGCATTGTATAAACTATTAGACCAATCAGCAAATTGATAACAATCCACATTACATACTATAACTATTAGACCAATCAACAAATTGATAATAATCCACATTGCATAGTATAACGATTAGACCAATCAGCAAATTGATAACAATCCACATTACATAGTATAACTATTAGACCAATCAACAAATTGATAATAATCCACATTGCATAGTATAACTATTAGACCAATCAGCAAATTGATAACAATCCACATTGCATAATATAACTATTAGACCAATCAACAAATTGATAACAATCCACATTGCATAGTATAACTATTAGACCAATCAGCAAATTGATAACAATCCACATTGCATAGTATAACTATTAGACCAATCAGCAAATTGATAATAATCCACATTGCATTGTATAAACTATTGACCAATCAGAATTTTCAAATGATAATGAACATCATTCCATTGGAAAAACTTTACCAATCAGCAATATAAAATAATAACCAACCACATTGCATTGTACAAGCTACATGAATTGACCAA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Protein

Gene family

Gene family	Subfamily
-	-

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Description	Type	Source
PF01243	Putative_PNPOx	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	Domain	Interproscan
PF10590	PNP_phzG_C	Pyridoxine 5'-phosphate oxidase C-terminal dimerisation region	Domain	Interproscan

InterPro

InterPro term	Type	Description	Source
IPR000659	Family	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	Interproscan
IPR011576	Domain	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase, putative	Interproscan
IPR012349	Homologous_superfamily	FMN-binding split barrel	Interproscan
IPR019576	Domain	Pyridoxine 5'-phosphate oxidase, dimerisation, C-terminal	Interproscan
IPR019740	Conserved_site	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase, conserved site	Interproscan

PANTHER

PANTHER term	Description	Source
PTHR10851	PYRIDOXINE-5-PHOSPHATE OXIDASE	Interproscan

Gene Ontology

GO terms	Category	Description	Source
GO:0004733	Molecular Function	pyridoxamine phosphate oxidase activity	Interproscan
GO:0008615	Biological Process	pyridoxine biosynthetic process	Interproscan
GO:0010181	Molecular Function	FMN binding	Interproscan
GO:0016638	Molecular Function	oxidoreductase activity, acting on the CH-NH2 group of donors	Interproscan
GO:0042823	Biological Process	pyridoxal phosphate biosynthetic process	Interproscan

KEGG pathway

KO	Enzyme	Enzyme ID	pathway	mapID	Source
K00275	pdxH, PNPO; pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	EC:1.4.3.5	Vitamin B6 metabolism	ko00750	PMID: 28812709

Expression pattern

1. Expression trend for Bpl_scaf_8784-1.20 global RNA-seq network